RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000396667.7

TMEM106B-201, Transcript of transmembrane protein 106B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM106B, Length 12,539 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106B-201ENST00000396667 PCDH10Q9P2E7 1040 aa4.59□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 TBC1D14Q9P2M4 693 aa4.59□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 PXDNQ92626 1479 aa4.59□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa4.59□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 FAM227AF5H4B4 570 aa4.59□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 TTI1O43156 1089 aa4.59□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 BUD23O43709 281 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP4.59□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 STAU1O95793 577 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 NDST1P52848 882 aa4.59□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 KIAA2013Q8IYS2 634 aa4.59□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 VPS50Q96JG6 964 aa4.59□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 EBF3Q9H4W6 596 aa4.59□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 TXNRD2Q9NNW7 524 aa4.59□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 TXLNGQ9NUQ3 528 aa4.59□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 SHOC2Q9UQ13 582 aa4.59□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 CPQQ9Y646 472 aa4.59□□□□□ -1.67
TMEM106B-201ENST00000396667 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 CYP20A1Q6UW02 462 aa4.59□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 USP45Q70EL2 814 aa4.59□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 SAMD3Q8N6K7 520 aa4.59□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 FAM71BQ8TC56 605 aa4.59□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 AGPAT1Q99943 283 aa4.59□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 APOL2Q9BQE5 337 aa4.59□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 PDXKO00764 312 aa4.59□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 GPC1P35052 558 aa4.59□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 CAP1Q01518 475 aa4.59□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 ENPP7Q6UWV6 458 aa4.59□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 SLFN11Q7Z7L1 901 aa4.59□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 IFT20Q8IY31 132 aa4.59□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 MCUR1Q96AQ8 359 aa4.59□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 SPASTQ9UBP0 616 aa4.59□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 TSPAN16Q9UKR8 245 aa4.59□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 VPS4BO75351 444 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 FTLP02792 175 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 ITGAXP20702 1163 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 PTGER2P43116 358 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 PLA2G4AP47712 749 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 UTS2BQ765I0 119 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 ZNF366Q8N895 744 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 ICA1LQ8NDH6 482 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 IL31RAQ8NI17 732 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 PYROXD1Q8WU10 500 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 SLC13A1Q9BZW2 595 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 FTSJ1Q9UET6 329 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 HCN2Q9UL51 889 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 PHF20L1A8MW92 1017 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 F8VP50 259 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 GRM6O15303 877 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 ACSL4O60488 711 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 GUCA1CO95843 209 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 SCP2P22307 547 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 RPA1P27694 616 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 TNFSF9P41273 254 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 ALX1Q15699 326 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 MMGT1Q8N4V1 131 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 LMLNQ96KR4 655 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 SLC38A3Q99624 504 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 ULBP1Q9BZM6 244 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 BCL9LQ86UU0 1499 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 TTC4O95801 387 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 VDRP11473 427 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 GPC5P78333 572 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 LRRC63Q05C16 580 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 BRSK2Q8IWQ3 736 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 C1orf54Q8WWF1 131 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 SAMD11Q96NU1 681 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 WDR41Q9HAD4 459 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 MCCC2Q9HCC0 563 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 ADGRB2O60241 1585 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 KITP10721 976 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 CYP2F1P24903 491 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 ITGA3P26006 1051 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 MASP1P48740 699 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 PEX6Q13608 980 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 SPIDRQ14159 915 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 TCP11X2Q5H9J9 407 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 WDR49Q8IV35 697 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 EMC1Q8N766 993 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 POMGNT2Q8NAT1 580 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 LINC00301Q8NCQ3 95 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 PPP1R14AQ96A00 147 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 ADGRE3Q9BY15 652 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 OLFML3Q9NRN5 406 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 A0A1W2PQH9 124 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 GGCXP38435 758 aa4.58□□□□□ -1.68
TMEM106B-201ENST00000396667 NFATC2Q13469 925 aa4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms