RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 COCHO43405 550 aa8.33□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 IGLV3-19P01714 112 aa8.33□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 CYBBP04839 570 aa8.33□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 ITGAVP06756 1048 aa8.33□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 PDGFRBP09619 1106 aa8.33□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 GARTP22102 1010 aa8.33□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 CHKAP35790 457 aa8.33□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 TPMTP51580 245 aa8.33□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 BCAT1P54687 386 aa8.33□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 USP46P62068 366 aa8.33□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 TNNC1P63316 161 aa8.33□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 MESP2Q0VG99 397 aa8.33□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 ILKQ13418 452 aa8.33□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 ALCAMQ13740 583 aa8.33□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 RTP5Q14D33 572 aa8.33□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 DUOXA2Q1HG44 320 aa8.33□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 SOWAHAQ2M3V2 549 aa8.33□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 HS1BP3Q53T59 392 aa8.33□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 MDH1BQ5I0G3 518 aa8.33□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 SNX30Q5VWJ9 437 aa8.33□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC39A4Q6P5W5 647 aa8.33□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa8.33□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 HTR3DQ70Z44 454 aa8.33□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 BBS7Q8IWZ6 715 aa8.33□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 LSMEM2Q8N112 164 aa8.33□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 OR6B3Q8NGW1 331 aa8.33□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 DNAI2Q9GZS0 605 aa8.33□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 MARK1Q9P0L2 795 aa8.33□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa8.33□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 STON1Q9Y6Q2 735 aa8.33□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 PTPRJQ12913 1337 aa8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 ANTXRLA6NF34 631 aa8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 A8MXQ7 604 aa8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 TIMM44O43615 452 aa8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 DTNBO60941 627 aa8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 CLSTN1O94985 981 aa8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 WISP1O95388 367 aa8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 BMP15O95972 392 aa8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 IRF1P10914 325 aa8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 GAP43P17677 238 aa8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 NEK4P51957 841 aa8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 ZBTB16Q05516 673 aa8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 KIF19Q2TAC6 998 aa8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 FUT11Q495W5 492 aa8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM119Q4V9L6 283 aa8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC45A4Q5BKX6 768 aa8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 ARSHQ5FYA8 562 aa8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 TPGS1Q6ZTW0 290 aa8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 OSTM1Q86WC4 334 aa8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 OXR1Q8N573 874 aa8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM181AQ8N9Y4 354 aa8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 TNIP3Q96KP6 325 aa8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 ACOX2Q99424 681 aa8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 MED10Q9BTT4 135 aa8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 MTMR12Q9C0I1 747 aa8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 BTBD1Q9H0C5 482 aa8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 KIAA1586Q9HCI6 787 aa8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 CRTAC1Q9NQ79 661 aa8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 SNX11Q9Y5W9 270 aa8.32□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF233A6NK53 670 aa8.31□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 PRRT4C9JH25 899 aa8.31□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC28A2O43868 658 aa8.31□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 TLR5O60602 858 aa8.31□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP2C2O75185 946 aa8.31□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 TACC1O75410 805 aa8.31□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 DNTTP04053 509 aa8.31□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 EPHX1P07099 455 aa8.31□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 C6P13671 934 aa8.31□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 LMO2P25791 158 aa8.31□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 CD27P26842 260 aa8.31□□□□□ -1.08
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