RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 C1orf21Q9H246 121 aa15.48■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 GPAMQ9HCL2 828 aa15.48■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 NRBP2Q9NSY0 501 aa15.48■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 SDR42E2A6NKP2 422 aa15.47■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 KRT38O76015 456 aa15.47■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 MAP3K6O95382 1288 aa15.47■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 BAG2O95816 211 aa15.47■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 APRTP07741 180 aa15.47■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 ZCCHC18P0CG32 403 aa15.47■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 GPD1P21695 349 aa15.47■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 IL4RP24394 825 aa15.47■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 CRHR1P34998 444 aa15.47■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 CPOXP36551 454 aa15.47■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 POLE2P56282 527 aa15.47■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 STXBP2Q15833 593 aa15.47■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 MTHFD1LQ6UB35 978 aa15.47■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 SLC25A41Q8N5S1 370 aa15.47■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 CEP120Q8N960 986 aa15.47■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 LRRN4Q8WUT4 740 aa15.47■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 ELOVL4Q9GZR5 314 aa15.47■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 SMYD3Q9H7B4 428 aa15.47■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 MEI4A8MW99 385 aa15.46■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 M0QYV0 167 aa15.46■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 B4GALT4O60513 344 aa15.46■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 GPD2P43304 727 aa15.46■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 MAGEA6P43360 314 aa15.46■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 WASHC5Q12768 1159 aa15.46■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 CDC16Q13042 620 aa15.46■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 ZNF667Q5HYK9 610 aa15.46■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 MROH9Q5TGP6 573 aa15.46■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 TMCO4Q5TGY1 634 aa15.46■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 STKLD1Q8NE28 680 aa15.46■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 RXFP2Q8WXD0 754 aa15.46■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 KLC2Q9H0B6 622 aa15.46■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 SIX4Q9UIU6 781 aa15.46■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 HEY1Q9Y5J3 304 aa15.46■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 ANK1P16157 1881 aa15.46■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 A0A088AWK7 358 aa15.46■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 ANKRD33BA6NCL7 494 aa15.46■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 PIK3R2O00459 728 aa15.46■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 BIRC5O15392 142 aa15.46■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 BUD23O43709 281 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 ZBED1O96006 694 aa15.46■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 EGFRP00533 1210 aa15.46■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 HMGCRP04035 888 aa15.46■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 CNTN2Q02246 1040 aa15.46■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 CXCL9Q07325 125 aa15.46■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 STX3Q13277 289 aa15.46■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 BIRC2Q13490 618 aa15.46■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 CDO1Q16878 200 aa15.46■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 NBPF20Q3BBV1 942 aa15.46■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 ZNF534Q76KX8 674 aa15.46■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 ADGRF2Q8IZF7 708 aa15.46■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 PQLC3Q8N755 202 aa15.46■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 RNF149Q8NC42 400 aa15.46■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 GBP5Q96PP8 586 aa15.46■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa15.46■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 CNPY3Q9BT09 278 aa15.46■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 TEX13BQ9BXU2 312 aa15.46■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 TRIM4Q9C037 500 aa15.46■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 FAM192AQ9GZU8 254 aa15.46■□□□□ 0.07
SYP-201ENST00000263233 FAM159BA6NKW6 160 aa15.45■□□□□ 0.06
SYP-201ENST00000263233 C2CD4BA6NLJ0 364 aa15.45■□□□□ 0.06
SYP-201ENST00000263233 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
SYP-201ENST00000263233 AOC1P19801 751 aa15.45■□□□□ 0.06
SYP-201ENST00000263233 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
SYP-201ENST00000263233 STAT5BP51692 787 aa15.45■□□□□ 0.06
SYP-201ENST00000263233 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa15.45■□□□□ 0.06
SYP-201ENST00000263233 TUBB3Q13509 450 aa15.45■□□□□ 0.06
SYP-201ENST00000263233 KRT81Q14533 505 aa15.45■□□□□ 0.06
SYP-201ENST00000263233 SMYD5Q6GMV2 418 aa15.45■□□□□ 0.06
SYP-201ENST00000263233 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
SYP-201ENST00000263233 MPP5Q8N3R9 675 aa15.45■□□□□ 0.06
SYP-201ENST00000263233 GSTCDQ8NEC7 633 aa15.45■□□□□ 0.06
SYP-201ENST00000263233 UBA3Q8TBC4 463 aa15.45■□□□□ 0.06
SYP-201ENST00000263233 SIGLEC10Q96LC7 697 aa15.45■□□□□ 0.06
SYP-201ENST00000263233 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
SYP-201ENST00000263233 THAP1Q9NVV9 213 aa15.45■□□□□ 0.06
SYP-201ENST00000263233 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa15.45■□□□□ 0.06
SYP-201ENST00000263233 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
SYP-201ENST00000263233 PRPSAP2O60256 369 aa15.45■□□□□ 0.06
SYP-201ENST00000263233 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
SYP-201ENST00000263233 PDGFRAP16234 1089 aa15.45■□□□□ 0.06
SYP-201ENST00000263233 PROZP22891 400 aa15.45■□□□□ 0.06
SYP-201ENST00000263233 MAGEA3P43357 314 aa15.45■□□□□ 0.06
SYP-201ENST00000263233 HMGCS2P54868 508 aa15.45■□□□□ 0.06
SYP-201ENST00000263233 RAPH1Q70E73 1250 aa15.45■□□□□ 0.06
SYP-201ENST00000263233 ARCQ7LC44 396 aa15.45■□□□□ 0.06
SYP-201ENST00000263233 TMEM192Q8IY95 271 aa15.45■□□□□ 0.06
SYP-201ENST00000263233 GSDMBQ8TAX9 411 aa15.45■□□□□ 0.06
SYP-201ENST00000263233 LRRC39Q96DD0 335 aa15.45■□□□□ 0.06
SYP-201ENST00000263233 TMEM176AQ96HP8 235 aa15.45■□□□□ 0.06
SYP-201ENST00000263233 ZNF778Q96MU6 729 aa15.45■□□□□ 0.06
SYP-201ENST00000263233 PTPRHQ9HD43 1115 aa15.45■□□□□ 0.06
SYP-201ENST00000263233 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.3 ms