RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000006777.10

RHBDD2-201, Transcript of rhomboid domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RHBDD2, Length 1,802 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2-201ENST00000006777 FZD10Q9ULW2 581 aa22.3■■□□□ 1.16
RHBDD2-201ENST00000006777 USP3Q9Y6I4 520 aa22.3■■□□□ 1.16
RHBDD2-201ENST00000006777 FYNP06241 537 aa22.29■■□□□ 1.16
RHBDD2-201ENST00000006777 AIF1P55008 147 aa22.29■■□□□ 1.16
RHBDD2-201ENST00000006777 DEUP1Q05D60 604 aa22.29■■□□□ 1.16
RHBDD2-201ENST00000006777 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
RHBDD2-201ENST00000006777 P3H1Q32P28 736 aa22.29■■□□□ 1.16
RHBDD2-201ENST00000006777 SYPL2Q5VXT5 272 aa22.29■■□□□ 1.16
RHBDD2-201ENST00000006777 FAM131BQ86XD5 332 aa22.29■■□□□ 1.16
RHBDD2-201ENST00000006777 CCDC185Q8N715 623 aa22.29■■□□□ 1.16
RHBDD2-201ENST00000006777 PQLC3Q8N755 202 aa22.29■■□□□ 1.16
RHBDD2-201ENST00000006777 PLD5Q8N7P1 536 aa22.29■■□□□ 1.16
RHBDD2-201ENST00000006777 PCDH19Q8TAB3 1148 aa22.29■■□□□ 1.16
RHBDD2-201ENST00000006777 RSAD2Q8WXG1 361 aa22.29■■□□□ 1.16
RHBDD2-201ENST00000006777 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
RHBDD2-201ENST00000006777 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP22.29■■□□□ 1.16
RHBDD2-201ENST00000006777 ZNF333Q96JL9 665 aa22.29■■□□□ 1.16
RHBDD2-201ENST00000006777 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa22.29■■□□□ 1.16
RHBDD2-201ENST00000006777 VPS18Q9P253 973 aa22.29■■□□□ 1.16
RHBDD2-201ENST00000006777 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa22.29■■□□□ 1.16
RHBDD2-201ENST00000006777 H0YGN5 161 aa22.29■■□□□ 1.16
RHBDD2-201ENST00000006777 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
RHBDD2-201ENST00000006777 RBP3P10745 1247 aa22.29■■□□□ 1.16
RHBDD2-201ENST00000006777 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
RHBDD2-201ENST00000006777 BCAR1P56945 870 aa22.29■■□□□ 1.16
RHBDD2-201ENST00000006777 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
RHBDD2-201ENST00000006777 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
RHBDD2-201ENST00000006777 CEP128Q6ZU80 1094 aa22.29■■□□□ 1.16
RHBDD2-201ENST00000006777 BHLHA9Q7RTU4 235 aa22.29■■□□□ 1.16
RHBDD2-201ENST00000006777 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
RHBDD2-201ENST00000006777 MTMR10Q9NXD2 777 aa22.29■■□□□ 1.16
RHBDD2-201ENST00000006777 NFS1Q9Y697 457 aa22.29■■□□□ 1.16
RHBDD2-201ENST00000006777 CYP2F1P24903 491 aa22.28■■□□□ 1.16
RHBDD2-201ENST00000006777 STIP1P31948 543 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
RHBDD2-201ENST00000006777 CYP2C18P33260 490 aa22.28■■□□□ 1.16
RHBDD2-201ENST00000006777 GATMP50440 423 aa22.28■■□□□ 1.16
RHBDD2-201ENST00000006777 SLC39A12Q504Y0 691 aa22.28■■□□□ 1.16
RHBDD2-201ENST00000006777 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
RHBDD2-201ENST00000006777 BEND5Q7L4P6 421 aa22.28■■□□□ 1.16
RHBDD2-201ENST00000006777 GLIS1Q8NBF1 620 aa22.28■■□□□ 1.16
RHBDD2-201ENST00000006777 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP22.28■■□□□ 1.16
RHBDD2-201ENST00000006777 MICAL3Q7RTP6 2002 aa22.28■■□□□ 1.16
RHBDD2-201ENST00000006777 OR6C75A6NL08 312 aa22.27■■□□□ 1.16
RHBDD2-201ENST00000006777 F9P00740 461 aa22.27■■□□□ 1.16
RHBDD2-201ENST00000006777 IFNB1P01574 187 aa22.27■■□□□ 1.16
RHBDD2-201ENST00000006777 NCAM1P13591 858 aa22.27■■□□□ 1.16
RHBDD2-201ENST00000006777 ARL4AP40617 200 aa22.27■■□□□ 1.16
RHBDD2-201ENST00000006777 SLC11A1P49279 550 aa22.27■■□□□ 1.16
RHBDD2-201ENST00000006777 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
RHBDD2-201ENST00000006777 ROR1Q01973 937 aa22.27■■□□□ 1.16
RHBDD2-201ENST00000006777 GPS1Q13098 491 aa22.27■■□□□ 1.16
RHBDD2-201ENST00000006777 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
RHBDD2-201ENST00000006777 ZNF280DQ6N043 979 aa22.27■■□□□ 1.16
RHBDD2-201ENST00000006777 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
RHBDD2-201ENST00000006777 SLC7A14Q8TBB6 771 aa22.27■■□□□ 1.16
RHBDD2-201ENST00000006777 TBX21Q9UL17 535 aa22.27■■□□□ 1.16
RHBDD2-201ENST00000006777 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
RHBDD2-201ENST00000006777 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
RHBDD2-201ENST00000006777 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
RHBDD2-201ENST00000006777 VWA8A3KMH1 1905 aa22.27■■□□□ 1.16
RHBDD2-201ENST00000006777 GOLGA6L10A6NI86 522 aa22.27■■□□□ 1.15
RHBDD2-201ENST00000006777 TBKBP1A7MCY6 615 aa22.27■■□□□ 1.15
RHBDD2-201ENST00000006777 NUDT17P0C025 328 aa22.27■■□□□ 1.15
RHBDD2-201ENST00000006777 FGFR3P22607 806 aa22.27■■□□□ 1.15
RHBDD2-201ENST00000006777 GRIK1P39086 918 aa22.27■■□□□ 1.15
RHBDD2-201ENST00000006777 NME3Q13232 169 aa22.27■■□□□ 1.15
RHBDD2-201ENST00000006777 CEP85LQ5SZL2 805 aa22.27■■□□□ 1.15
RHBDD2-201ENST00000006777 FAM171A1Q5VUB5 890 aa22.27■■□□□ 1.15
RHBDD2-201ENST00000006777 DENND2CQ68D51 928 aa22.27■■□□□ 1.15
RHBDD2-201ENST00000006777 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.15
RHBDD2-201ENST00000006777 NPNTQ6UXI9 565 aa22.27■■□□□ 1.15
RHBDD2-201ENST00000006777 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.15
RHBDD2-201ENST00000006777 DEFB128Q7Z7B8 93 aa22.27■■□□□ 1.15
RHBDD2-201ENST00000006777 PCGF5Q86SE9 256 aa22.27■■□□□ 1.15
RHBDD2-201ENST00000006777 LRRC43Q8N309 656 aa22.27■■□□□ 1.15
RHBDD2-201ENST00000006777 NTAN1Q96AB6 310 aa22.27■■□□□ 1.15
RHBDD2-201ENST00000006777 CSPG4P5Q96PW8 444 aa22.27■■□□□ 1.15
RHBDD2-201ENST00000006777 MARCH5Q9NX47 278 aa22.27■■□□□ 1.15
RHBDD2-201ENST00000006777 CFAP69A5D8W1 941 aa22.26■■□□□ 1.15
RHBDD2-201ENST00000006777 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa22.26■■□□□ 1.15
RHBDD2-201ENST00000006777 ETS1P14921 441 aa22.26■■□□□ 1.15
RHBDD2-201ENST00000006777 RFC2P35250 354 aa22.26■■□□□ 1.15
RHBDD2-201ENST00000006777 MORF4L2Q15014 288 aa22.26■■□□□ 1.15
RHBDD2-201ENST00000006777 CTXN3Q4LDR2 81 aa22.26■■□□□ 1.15
RHBDD2-201ENST00000006777 EFHC2Q5JST6 749 aa22.26■■□□□ 1.15
RHBDD2-201ENST00000006777 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
RHBDD2-201ENST00000006777 C1orf228Q6PIY5 440 aa22.26■■□□□ 1.15
RHBDD2-201ENST00000006777 VSTM1Q6UX27 236 aa22.26■■□□□ 1.15
RHBDD2-201ENST00000006777 PRUNE1Q86TP1 453 aa22.26■■□□□ 1.15
RHBDD2-201ENST00000006777 CCDC25Q86WR0 208 aa22.26■■□□□ 1.15
RHBDD2-201ENST00000006777 ANKLE1Q8NAG6 615 aa22.26■■□□□ 1.15
RHBDD2-201ENST00000006777 ADAM7Q9H2U9 754 aa22.26■■□□□ 1.15
RHBDD2-201ENST00000006777 EPB41L4BQ9H329 900 aa22.26■■□□□ 1.15
RHBDD2-201ENST00000006777 AAASQ9NRG9 546 aa22.26■■□□□ 1.15
RHBDD2-201ENST00000006777 PIGVQ9NUD9 493 aa22.26■■□□□ 1.15
RHBDD2-201ENST00000006777 OR4Q2P0C623 313 aa22.25■■□□□ 1.15
RHBDD2-201ENST00000006777 NR2C2P49116 596 aa22.25■■□□□ 1.15
RHBDD2-201ENST00000006777 SCAPQ12770 1279 aa22.25■■□□□ 1.15
RHBDD2-201ENST00000006777 IKBKEQ14164 716 aa22.25■■□□□ 1.15
RHBDD2-201ENST00000006777 BSPRYQ5W0U4 402 aa22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms