RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635538.1

EP300-208, Transcript of E1A binding protein p300, human

TSL 2

Gene EP300, Length 318 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EP300-208	ENST00000635538	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	GJD2	Q9UKL4	321 aa		5.21	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	GABRQ	Q9UN88	632 aa		5.21	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	HMX3	A6NHT5	357 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	AGPS	O00116	658 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	SH3BP5	O60239	455 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	LARGE1	O95461	756 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	MAK	P20794	623 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	TGM1	P22735	817 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	MMP8	P22894	467 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	ADD2	P35612	726 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	MAPK9	P45984	424 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	GSTM5	P46439	218 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	TIGD6	Q17RP2	521 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	USP51	Q70EK9	711 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	TRABD2A	Q86V40	505 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	LCORL	Q8N3X6	602 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	5.2	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	CPT1B	Q92523	772 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	SLC9A6	Q92581	669 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	EVI5L	Q96CN4	794 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	R3HDM4	Q96D70	268 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538		Q96MF0	132 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	MAST3	O60307	1309 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	NCAM2	O15394	837 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	TMPRSS11D	O60235	418 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	FES	P07332	822 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	RHO	P08100	348 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	PDHA1	P08559	390 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	AKT1	P31749	480 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	GK	P32189	559 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	5.19	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	PNLIPRP1	P54315	467 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	SP2	Q02086	613 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	GRM4	Q14833	912 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	TXNRD1	Q16881	649 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	LY6K	Q17RY6	165 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	TTC22	Q5TAA0	569 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538		Q6ZNX1	250 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	HAPLN3	Q96S86	360 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	SNX15	Q9NRS6	342 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	RASSF1	Q9NS23	344 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	PDP2	Q9P2J9	529 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	LZTS1	Q9Y250	596 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	PMPCB	O75439	489 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	TAF5L	O75529	589 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	TK1	P04183	234 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	CHRM2	P08172	466 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	ADRA1D	P25100	572 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	KLRK1	P26718	216 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	CLCN2	P51788	898 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	ACTR2	P61160	394 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	MTAP	Q13126	283 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	FHL3	Q13643	280 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	KCNJ12	Q14500	433 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	TAF5	Q15542	800 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	KAZN	Q674X7	775 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	PARS2	Q7L3T8	475 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	TEX19	Q8NA77	164 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	RFK	Q969G6	155 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	FAR2	Q96K12	515 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
EP300-208	ENST00000635538	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		5.18	□□□□□ -1.58

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