RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	ASRGL1	Q7L266	308 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	LRRC6	Q86X45	466 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	AGAP11	Q8TF27	550 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	PAK5	Q9P286	719 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	GJD2	Q9UKL4	321 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152		A0A0G2JND7	137 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	LMO2	P25791	158 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	ALDH3A1	P30838	453 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	PDK2	Q15119	407 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	RGS9BP	Q6ZS82	235 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	C10orf82	Q8WW14	230 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	BRCA2	P51587	3418 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	TRIP11	Q15643	1979 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	IQANK1	A0A1B0GTG1	560 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	ADCY6	O43306	1168 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	MMP3	P08254	477 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	EZR	P15311	586 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	CYP2F1	P24903	491 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	SLC8A1	P32418	973 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	PKDCC	Q504Y2	493 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM110	Q86TL2	294 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	SLC44A1	Q8WWI5	657 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	FETUB	Q9UGM5	382 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	SMAP	O00193	183 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	CHAD	O15335	359 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	UGT1A9	O60656	530 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	CCNB1	P14635	433 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	ACCSL	Q4AC99	568 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	FYB2	Q5VWT5	728 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	KATNBL1	Q9H079	304 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	KLC2	Q9H0B6	622 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	UGT1A7	Q9HAW7	530 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	UGT1A10	Q9HAW8	530 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	UGT1A8	Q9HAW9	530 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	COX16	Q9P0S2	106 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	MFHAS1	Q9Y4C4	1052 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	CIT	O14578	2027 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152		A6NJR5	290 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	RECQL4	O94761	1208 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	GRIA1	P42261	906 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	BMPR2	Q13873	1038 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	STIL	Q15468	1287 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC125	Q86Z20	511 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF276	Q8N554	614 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	SNX27	Q96L92	541 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	TRIM49D1	C9J1S8	452 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	BTBD19	C9JJ37	291 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	DCTN3	O75935	186 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	METTL18	O95568	372 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	DGKD	Q16760	1214 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	TTC39C	Q8N584	583 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	BEST2	Q8NFU1	509 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	TM9SF1	O15321	606 aa		13.58	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	DES	P17661	470 aa		13.58	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	BGN	P21810	368 aa		13.58	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	TGM2	P21980	687 aa		13.58	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		13.58	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		13.58	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		13.58	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		13.58	□□□□□ -0.23

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