RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594708.1

SMC5-AS1-201, Transcript of SMC5 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SMC5-AS1, Length 1,818 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC5-AS1-201ENST00000594708 VCPIP1Q96JH7 1222 aa20.49■□□□□ 0.87
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 THAP2Q9H0W7 228 aa20.49■□□□□ 0.87
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP20.49■□□□□ 0.87
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SMC5-AS1-201ENST00000594708 C3orf20Q8ND61 904 aa20.47■□□□□ 0.87
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 TRNP1Q6NT89 227 aa20.46■□□□□ 0.87
SMC5-AS1-201ENST00000594708 DNAJC24Q6P3W2 148 aa20.46■□□□□ 0.87
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 ARHGEF26Q96DR7 871 aa20.46■□□□□ 0.87
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 SCNN1AP37088 669 aa20.46■□□□□ 0.87
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TRIM11Q96F44 468 aa20.46■□□□□ 0.87
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SLC2A13Q96QE2 648 aa20.46■□□□□ 0.87
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TFR2Q9UP52 801 aa20.46■□□□□ 0.87
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 OLFM2O95897 454 aa20.45■□□□□ 0.86
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CKMP06732 381 aa20.45■□□□□ 0.86
SMC5-AS1-201ENST00000594708 H2AFZP0C0S5 128 aa20.45■□□□□ 0.86
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 GPC5P78333 572 aa20.45■□□□□ 0.86
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SPA17Q15506 151 aa20.45■□□□□ 0.86
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SMC5-AS1-201ENST00000594708 DCAF6Q58WW2 860 aa20.45■□□□□ 0.86
SMC5-AS1-201ENST00000594708 H2AFVQ71UI9 128 aa20.45■□□□□ 0.86
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RNF139Q8WU17 664 aa20.45■□□□□ 0.86
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