RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567316.1

CTU2-209, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 3

Gene CTU2, Length 452 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-209ENST00000567316 PAPLNO95428 1278 aa16.16■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 FYNP06241 537 aa16.16■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa16.16■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 FLT3P36888 993 aa16.16■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP16.16■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 OGDHQ02218 1023 aa16.16■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 AAK1Q2M2I8 961 aa16.16■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 BSPRYQ5W0U4 402 aa16.16■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa16.16■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 ARCQ7LC44 396 aa16.16■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 MON1AQ86VX9 555 aa16.16■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 HS6ST3Q8IZP7 471 aa16.16■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 DEFB106AQ8N104 65 aa16.16■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 ELMOD1Q8N336 334 aa16.16■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 TPCN2Q8NHX9 752 aa16.16■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 OVCA2Q8WZ82 227 aa16.16■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 BTBD6Q96KE9 485 aa16.16■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 SLITRK1Q96PX8 696 aa16.16■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 ASB2Q96Q27 587 aa16.16■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 SLC2A13Q96QE2 648 aa16.16■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 PRKD2Q9BZL6 878 aa16.16■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 IL21Q9HBE4 155 aa16.16■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 ANAPC7Q9UJX3 599 aa16.16■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa16.15■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 POU2F2P09086 479 aa16.15■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 GPD1P21695 349 aa16.15■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa16.15■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 BTBD8Q5XKL5 378 aa16.15■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 BEND5Q7L4P6 421 aa16.15■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 TMC8Q8IU68 726 aa16.15■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 ARHGAP18Q8N392 663 aa16.15■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 PDZD8Q8NEN9 1154 aa16.15■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 FNIP1Q8TF40 1166 aa16.15■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 RXFP2Q8WXD0 754 aa16.15■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 POPDC2Q9HBU9 364 aa16.15■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 ABCC13Q9NSE7 274 aa16.15■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 DZANK1Q9NVP4 752 aa16.15■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 OSER1Q9NX31 292 aa16.15■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP16.15■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 UNC80Q8N2C7 3258 aa16.15■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 A0A0C4DFX4 3053 aa16.15■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 SPDYE4A6NLX3 237 aa16.14■□□□□ 0.17
CTU2-209ENST00000567316 MYO1FO00160 1098 aa16.14■□□□□ 0.17
CTU2-209ENST00000567316 XYLBO75191 536 aa16.14■□□□□ 0.17
CTU2-209ENST00000567316 TADA3O75528 432 aa16.14■□□□□ 0.17
CTU2-209ENST00000567316 F11P03951 625 aa16.14■□□□□ 0.17
CTU2-209ENST00000567316 PDGFRAP16234 1089 aa16.14■□□□□ 0.17
CTU2-209ENST00000567316 PTPN2P17706 415 aa16.14■□□□□ 0.17
CTU2-209ENST00000567316 NOS2P35228 1153 aa16.14■□□□□ 0.17
CTU2-209ENST00000567316 MATKP42679 507 aa16.14■□□□□ 0.17
CTU2-209ENST00000567316 PSEN1P49768 467 aa16.14■□□□□ 0.17
CTU2-209ENST00000567316 ADAM15Q13444 863 aa16.14■□□□□ 0.17
CTU2-209ENST00000567316 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
CTU2-209ENST00000567316 TJAP1Q5JTD0 557 aa16.14■□□□□ 0.17
CTU2-209ENST00000567316 SNX30Q5VWJ9 437 aa16.14■□□□□ 0.17
CTU2-209ENST00000567316 SYPL2Q5VXT5 272 aa16.14■□□□□ 0.17
CTU2-209ENST00000567316 TMEM150AQ86TG1 271 aa16.14■□□□□ 0.17
CTU2-209ENST00000567316 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
CTU2-209ENST00000567316 EDEM1Q92611 657 aa16.14■□□□□ 0.17
CTU2-209ENST00000567316 GOLGA1Q92805 767 aa16.14■□□□□ 0.17
CTU2-209ENST00000567316 CORO1BQ9BR76 489 aa16.14■□□□□ 0.17
CTU2-209ENST00000567316 TRIM62Q9BVG3 475 aa16.14■□□□□ 0.17
CTU2-209ENST00000567316 SFXN1Q9H9B4 322 aa16.14■□□□□ 0.17
CTU2-209ENST00000567316 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa16.14■□□□□ 0.17
CTU2-209ENST00000567316 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa16.14■□□□□ 0.17
CTU2-209ENST00000567316 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
CTU2-209ENST00000567316 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa16.14■□□□□ 0.17
CTU2-209ENST00000567316 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa16.14■□□□□ 0.17
CTU2-209ENST00000567316 NUP205Q92621 2012 aa16.13■□□□□ 0.17
CTU2-209ENST00000567316 GRID2IPA4D2P6 1211 aa16.13■□□□□ 0.17
CTU2-209ENST00000567316 ZNF840PA6NDX5 716 aa16.13■□□□□ 0.17
CTU2-209ENST00000567316 DPYSL4O14531 572 aa16.13■□□□□ 0.17
CTU2-209ENST00000567316 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
CTU2-209ENST00000567316 NCAM1P13591 858 aa16.13■□□□□ 0.17
CTU2-209ENST00000567316 LTBRP36941 435 aa16.13■□□□□ 0.17
CTU2-209ENST00000567316 PPP3CCP48454 512 aa16.13■□□□□ 0.17
CTU2-209ENST00000567316 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
CTU2-209ENST00000567316 EPHA5P54756 1037 aa16.13■□□□□ 0.17
CTU2-209ENST00000567316 MESDQ14696 234 aa16.13■□□□□ 0.17
CTU2-209ENST00000567316 LEXMQ3ZCV2 418 aa16.13■□□□□ 0.17
CTU2-209ENST00000567316 CCDC14Q49A88 953 aa16.13■□□□□ 0.17
CTU2-209ENST00000567316 DCAF6Q58WW2 860 aa16.13■□□□□ 0.17
CTU2-209ENST00000567316 ANKRD54Q6NXT1 300 aa16.13■□□□□ 0.17
CTU2-209ENST00000567316 CFAP57Q96MR6 1250 aa16.13■□□□□ 0.17
CTU2-209ENST00000567316 CLIC5Q9NZA1 410 aa16.13■□□□□ 0.17
CTU2-209ENST00000567316 IP6K2Q9UHH9 426 aa16.13■□□□□ 0.17
CTU2-209ENST00000567316 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
CTU2-209ENST00000567316 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms