RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566199.1

JMJD8-208, Transcript of jumonji domain containing 8, human

TSL 3

Gene JMJD8, Length 719 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
JMJD8-208	ENST00000566199	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	27.6	■■■□□ 2.01
JMJD8-208	ENST00000566199	CNR2	P34972	360 aa		27.59	■■■□□ 2.01
JMJD8-208	ENST00000566199	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		27.59	■■■□□ 2.01
JMJD8-208	ENST00000566199	HTR3D	Q70Z44	454 aa		27.59	■■■□□ 2.01
JMJD8-208	ENST00000566199	SCD5	Q86SK9	330 aa		27.59	■■■□□ 2.01
JMJD8-208	ENST00000566199	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		27.59	■■■□□ 2.01
JMJD8-208	ENST00000566199	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		27.59	■■■□□ 2.01
JMJD8-208	ENST00000566199	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	27.59	■■■□□ 2.01
JMJD8-208	ENST00000566199	HINFP	Q9BQA5	517 aa		27.59	■■■□□ 2.01
JMJD8-208	ENST00000566199	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		27.59	■■■□□ 2.01
JMJD8-208	ENST00000566199	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		27.59	■■■□□ 2.01
JMJD8-208	ENST00000566199	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		27.58	■■■□□ 2.01
JMJD8-208	ENST00000566199	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
JMJD8-208	ENST00000566199		O00370	1275 aa		27.58	■■■□□ 2.01
JMJD8-208	ENST00000566199	SETSIP	P0DME0	302 aa		27.58	■■■□□ 2.01
JMJD8-208	ENST00000566199	PLA2G4A	P47712	749 aa		27.58	■■■□□ 2.01
JMJD8-208	ENST00000566199	FNTB	P49356	437 aa		27.58	■■■□□ 2.01
JMJD8-208	ENST00000566199	GAD2	Q05329	585 aa		27.58	■■■□□ 2.01
JMJD8-208	ENST00000566199	PDE4C	Q08493	712 aa		27.58	■■■□□ 2.01
JMJD8-208	ENST00000566199	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		27.58	■■■□□ 2.01
JMJD8-208	ENST00000566199	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		27.58	■■■□□ 2.01
JMJD8-208	ENST00000566199	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
JMJD8-208	ENST00000566199	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		27.57	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	TKTL1	P51854	596 aa		27.57	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	STIL	Q15468	1287 aa		27.57	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		27.57	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	PNKP	Q96T60	521 aa		27.57	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		27.57	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		27.57	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		27.57	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	RAB23	Q9ULC3	237 aa		27.57	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	FRYL	O94915	3013 aa		27.57	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	ZBED1	O96006	694 aa		27.56	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	DMWD	Q09019	674 aa		27.56	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		27.56	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		27.56	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	SYT13	Q7L8C5	426 aa		27.56	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		27.56	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		27.56	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		27.56	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	KAT5	Q92993	513 aa		27.56	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	WBP2	Q969T9	261 aa		27.56	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	NCDN	Q9UBB6	729 aa		27.56	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		27.56	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	GREM1	O60565	184 aa		27.55	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	APOD	P05090	189 aa		27.55	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	PKDCC	Q504Y2	493 aa		27.55	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	RRAGA	Q7L523	313 aa		27.55	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	MED15	Q96RN5	788 aa		27.55	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	DACH1	Q9UI36	760 aa		27.55	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199		K7EQS6	105 aa		27.54	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	TULP2	O00295	520 aa		27.54	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	MDM4	O15151	490 aa		27.54	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	27.54	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	COG7	P83436	770 aa		27.54	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	CNGA2	Q16280	664 aa		27.54	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	27.54	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	C12orf40	Q86WS4	652 aa		27.54	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	MIB1	Q86YT6	1006 aa		27.54	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	USP33	Q8TEY7	942 aa		27.54	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		27.54	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	TFAP2B	Q92481	460 aa		27.54	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	FAM81B	Q96LP2	452 aa		27.54	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	27.54	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		27.54	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	27.54	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	KAT7	O95251	611 aa		27.53	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	SLC6A11	P48066	632 aa		27.53	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	ZNF132	P52740	706 aa		27.53	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	ADIG	Q0VDE8	80 aa		27.53	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	DMC1	Q14565	340 aa		27.53	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	ANO4	Q32M45	955 aa		27.53	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		27.53	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		27.53	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		27.53	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		27.53	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	SCML4	Q8N228	414 aa		27.53	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	UBA3	Q8TBC4	463 aa		27.53	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		27.53	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	GBP4	Q96PP9	640 aa		27.53	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		27.53	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		27.53	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		27.53	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		27.53	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	CEP250	Q9BV73	2442 aa		27.52	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199		A0A0A0MRY4	1105 aa		27.52	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	27.52	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	STC2	O76061	302 aa		27.52	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	GRIA2	P42262	883 aa		27.52	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	27.52	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199		Q6ZNB5	142 aa		27.52	■■■□□ 2
JMJD8-208	ENST00000566199	TMEM25	Q86YD3	366 aa		27.52	■■■□□ 2

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms