RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557115.5

CIPC-208, Transcript of CLOCK interacting pacemaker, humanhuman

TSL 4

Gene CIPC, Length 882 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPC-208ENST00000557115 DNMT3LQ9UJW3 386 aa22.9■■□□□ 1.26
CIPC-208ENST00000557115 NAGPAQ9UK23 515 aa22.9■■□□□ 1.26
CIPC-208ENST00000557115 INVSQ9Y283 1065 aa22.9■■□□□ 1.26
CIPC-208ENST00000557115 DCLK1O15075 740 aa22.89■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 RARGP13631 454 aa22.89■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 TNFRSF4P43489 277 aa22.89■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 MESP2Q0VG99 397 aa22.89■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 STIM1Q13586 685 aa22.89■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 CRY1Q16526 586 aa22.89■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 PLK5Q496M5 336 aa22.89■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 C10orf120Q5SQS8 335 aa22.89■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 EMC10Q5UCC4 262 aa22.89■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 ANKRD40Q6AI12 368 aa22.89■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 TADA2BQ86TJ2 420 aa22.89■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 TMEM25Q86YD3 366 aa22.89■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 ENGASEQ8NFI3 743 aa22.89■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 WBP2Q969T9 261 aa22.89■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 TMEM176AQ96HP8 235 aa22.89■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 OSER1Q9NX31 292 aa22.89■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 NUDT5Q9UKK9 219 aa22.89■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 GDF9O60383 454 aa22.88■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 RALAP11233 206 aa22.88■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 KIF11P52732 1056 aa22.88■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 SLC8A3P57103 927 aa22.88■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 COBLL1Q53SF7 1204 aa22.88■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 EOGTQ5NDL2 527 aa22.88■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 HTR3DQ70Z44 454 aa22.88■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 IL17RCQ8NAC3 791 aa22.88■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 TATDN2Q93075 761 aa22.88■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 ARID3AQ99856 593 aa22.88■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 NMUR1Q9HB89 426 aa22.88■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa22.88■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 A0A0A0MRY4 1105 aa22.87■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 SLC30A4O14863 429 aa22.87■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 TULP3O75386 442 aa22.87■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 ZNF806P0C7X5 589 aa22.87■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 MPLP40238 635 aa22.87■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 PLA2G4AP47712 749 aa22.87■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 PSEN1P49768 467 aa22.87■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 PMS1P54277 932 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 LRRC63Q05C16 580 aa22.87■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 CBWD6Q4V339 395 aa22.87■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 CBWD3Q5JTY5 395 aa22.87■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 CBWD5Q5RIA9 395 aa22.87■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 ISM2Q6H9L7 571 aa22.87■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 TPGS1Q6ZTW0 290 aa22.87■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 TIGD1Q96MW7 591 aa22.87■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP22.87■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP22.87■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 TRIM49BA6NDI0 452 aa22.86■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa22.86■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 SGK1O00141 431 aa22.86■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 PSMA7O14818 248 aa22.86■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 MDM4O15151 490 aa22.86■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 RAD23BP54727 409 aa22.86■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 CREB5Q02930 508 aa22.86■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 C10orf76Q5T2E6 689 aa22.86■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 KLHDC10Q6PID8 442 aa22.86■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 CCDC186Q7Z3E2 898 aa22.86■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 C11orf74Q86VG3 221 aa22.86■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 RASSF3Q86WH2 238 aa22.86■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 MIB1Q86YT6 1006 aa22.86■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa22.86■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 SLC4A11Q8NBS3 891 aa22.86■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 MDGA1Q8NFP4 955 aa22.86■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 BBS2Q9BXC9 721 aa22.86■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa22.86■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 MYH10P35580 1976 aa22.85■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 IL31Q6EBC2 164 aa22.85■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 GRAMD4Q6IC98 578 aa22.85■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 TMEM92Q6UXU6 159 aa22.85■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 PGBD3Q8N328 593 aa22.85■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 SPATA20Q8TB22 786 aa22.85■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 VPS45Q9NRW7 570 aa22.85■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 WDR35Q9P2L0 1181 aa22.85■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 SDK1Q7Z5N4 2213 aa22.84■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 TYRP14679 529 aa22.84■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 SCD5Q86SK9 330 aa22.84■■□□□ 1.25
CIPC-208ENST00000557115 ARHGAP18Q8N392 663 aa22.84■■□□□ 1.25
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