RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 ATXN3LQ9H3M9 355 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 ABCB6Q9NP58 842 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 RXFP3Q9NSD7 469 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 COQ4Q9Y3A0 265 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP10.22□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 NOTCH4Q99466 2003 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 SDK1Q7Z5N4 2213 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 LAMA1P25391 3075 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 COL4A2P08572 1712 aa10.21□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 SLC38A8A6NNN8 435 aa10.21□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 TM4SF5O14894 197 aa10.21□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 KCNK5O95279 499 aa10.21□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 MBD3O95983 291 aa10.21□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 CSH1P0DML2 217 aa10.21□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 CSH2P0DML3 217 aa10.21□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 CCDC130P13994 396 aa10.21□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 SPINK2P20155 84 aa10.21□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 SOX11P35716 441 aa10.21□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 CACNA2D1P54289 1103 aa10.21□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 ARID5BQ14865 1188 aa10.21□□□□□ -0.77
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CS-217ENST00000550044 STXBP5Q5T5C0 1151 aa10.21□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 STPG1Q5TH74 334 aa10.21□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 TANGO2Q6ICL3 276 aa10.21□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa10.21□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 SASS6Q6UVJ0 657 aa10.21□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 PAQR9Q6ZVX9 377 aa10.21□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 CEP68Q76N32 757 aa10.21□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 IRF2BP1Q8IU81 584 aa10.21□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 CRYBG2Q8N1P7 616 aa10.21□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 LEMD2Q8NC56 503 aa10.21□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 WHAMMQ8TF30 809 aa10.21□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP10.21□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 TWNKQ96RR1 684 aa10.21□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 KCNK16Q96T55 309 aa10.21□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa10.21□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 LMAN1LQ9HAT1 526 aa10.21□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 CYP3A43Q9HB55 503 aa10.21□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 FAM49BQ9NUQ9 324 aa10.21□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 GDE1Q9NZC3 331 aa10.21□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
CS-217ENST00000550044 F8VP50 259 aa10.2□□□□□ -0.78
CS-217ENST00000550044 ECI2O75521 394 aa10.2□□□□□ -0.78
CS-217ENST00000550044 MICAL2O94851 1124 aa10.2□□□□□ -0.78
CS-217ENST00000550044 AFPP02771 609 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
CS-217ENST00000550044 ANXA13P27216 316 aa10.2□□□□□ -0.78
CS-217ENST00000550044 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
CS-217ENST00000550044 ADORA2BP29275 332 aa10.2□□□□□ -0.78
CS-217ENST00000550044 MAGEA11P43364 429 aa10.2□□□□□ -0.78
CS-217ENST00000550044 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
CS-217ENST00000550044 CXCL12P48061 93 aa10.2□□□□□ -0.78
CS-217ENST00000550044 CYP4F8P98187 520 aa10.2□□□□□ -0.78
CS-217ENST00000550044 RING1Q06587 406 aa10.2□□□□□ -0.78
CS-217ENST00000550044 GRM2Q14416 872 aa10.2□□□□□ -0.78
CS-217ENST00000550044 ITPR1Q14643 2758 aa10.2□□□□□ -0.78
CS-217ENST00000550044 CCDC183Q5T5S1 534 aa10.2□□□□□ -0.78
CS-217ENST00000550044 GPR158Q5T848 1215 aa10.2□□□□□ -0.78
CS-217ENST00000550044 VSTM1Q6UX27 236 aa10.2□□□□□ -0.78
CS-217ENST00000550044 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
CS-217ENST00000550044 UNC93AQ86WB7 457 aa10.2□□□□□ -0.78
CS-217ENST00000550044 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
CS-217ENST00000550044 DNASE1L2Q92874 299 aa10.2□□□□□ -0.78
CS-217ENST00000550044 CYFIP2Q96F07 1278 aa10.2□□□□□ -0.78
CS-217ENST00000550044 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
CS-217ENST00000550044 UCN2Q96RP3 112 aa10.2□□□□□ -0.78
CS-217ENST00000550044 IER2Q9BTL4 223 aa10.2□□□□□ -0.78
CS-217ENST00000550044 NT5C1AQ9BXI3 368 aa10.2□□□□□ -0.78
CS-217ENST00000550044 ELOVL4Q9GZR5 314 aa10.2□□□□□ -0.78
CS-217ENST00000550044 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa10.2□□□□□ -0.78
CS-217ENST00000550044 BRD9Q9H8M2 597 aa10.2□□□□□ -0.78
CS-217ENST00000550044 ZFAND3Q9H8U3 227 aa10.2□□□□□ -0.78
CS-217ENST00000550044 CISHQ9NSE2 258 aa10.2□□□□□ -0.78
CS-217ENST00000550044 TMEM30AQ9NV96 361 aa10.2□□□□□ -0.78
CS-217ENST00000550044 TMEM63CQ9P1W3 806 aa10.2□□□□□ -0.78
CS-217ENST00000550044 SPAG17Q6Q759 2223 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-217ENST00000550044 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
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CS-217ENST00000550044 CILPO75339 1184 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-217ENST00000550044 BEST1O76090 585 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-217ENST00000550044 F11P03951 625 aa10.19□□□□□ -0.78
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CS-217ENST00000550044 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
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CS-217ENST00000550044 GAS6Q14393 721 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-217ENST00000550044 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-217ENST00000550044 TXNDC8Q6A555 127 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-217ENST00000550044 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
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CS-217ENST00000550044 RRAGAQ7L523 313 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-217ENST00000550044 TMEM150AQ86TG1 271 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-217ENST00000550044 FAM35AQ86V20 835 aa10.19□□□□□ -0.78
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