RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538545.6

ACTN1-205, Transcript of actinin alpha 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTN1, Length 2,813 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1-205ENST00000538545 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 STK32AQ8WU08 396 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 RUNDC3BQ96NL0 473 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 RNF157Q96PX1 679 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 TRAIPQ9BWF2 469 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 I6L893 689 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 GOT1P17174 413 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 OR1G1P47890 313 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 GBE1Q04446 702 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 DMTNQ08495 405 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 TUSC3Q13454 348 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 TAZQ16635 292 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 EXOC4Q96A65 974 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 HOMER3Q9NSC5 361 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 MTMR10Q9NXD2 777 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 AP4E1Q9UPM8 1137 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 SNX10Q9Y5X0 201 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 MOXD2PA6NHM9 499 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 M0QYT0 321 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 ENDOD1O94919 500 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 RARGP13631 454 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 AMPD1P23109 780 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 RPL22P35268 128 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 CCL23P55773 120 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 MTMR3Q13615 1198 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 HSFY1Q96LI6 401 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 GOLGA6L10A6NI86 522 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 H7C0C1 242 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 ARVCFO00192 962 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 APOC2P02655 101 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 NR1D1P20393 614 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 L1CAMP32004 1257 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 ATP5OP48047 213 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 ANKMY2Q8IV38 441 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 MDM1Q8TC05 714 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 RSAD2Q8WXG1 361 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 RSPH1Q8WYR4 309 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 P3H4Q92791 437 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 PGLYRP2Q96PD5 576 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP14.71□□□□□ -0.058e-6■■■■■ 30.1
ACTN1-205ENST00000538545 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP14.71□□□□□ -0.056e-7■■□□□ 11.8
ACTN1-205ENST00000538545 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 PIGVQ9NUD9 493 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 DPYSL4O14531 572 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 CABYRO75952 493 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 CYP2F1P24903 491 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 PTPN7P35236 360 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 LHX1P48742 406 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 GRIK3Q13003 919 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 ACAP1Q15027 740 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 FAM26DQ5JW98 314 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 ERMARDQ5T6L9 678 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 CEP57Q86XR8 500 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 CCDC13Q8IYE1 715 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 SLC7A14Q8TBB6 771 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 GPR152Q8TDT2 470 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 CEP41Q9BYV8 373 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 SAYSD1Q9NPB0 183 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 NINJ2Q9NZG7 142 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 TBK1Q9UHD2 729 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTN1-205ENST00000538545 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
ACTN1-205ENST00000538545 CREB3O43889 395 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTN1-205ENST00000538545 ITGAVP06756 1048 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTN1-205ENST00000538545 NCAM1P13591 858 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTN1-205ENST00000538545 CREB1P16220 341 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTN1-205ENST00000538545 RBL1P28749 1068 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTN1-205ENST00000538545 MATKP42679 507 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTN1-205ENST00000538545 RPL34P49207 117 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ACTN1-205ENST00000538545 SLC8A3P57103 927 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTN1-205ENST00000538545 BASP1P80723 227 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ACTN1-205ENST00000538545 MSS51Q4VC12 460 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTN1-205ENST00000538545 OVOS1Q6IE37 1185 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTN1-205ENST00000538545 RGS18Q9NS28 235 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTN1-205ENST00000538545 TBC1D13Q9NVG8 400 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTN1-205ENST00000538545 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ACTN1-205ENST00000538545 FRMPD3Q5JV73 1810 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTN1-205ENST00000538545 FAM72CH0Y354 149 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTN1-205ENST00000538545 ODC1P11926 461 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTN1-205ENST00000538545 MAP2K2P36507 400 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTN1-205ENST00000538545 GPR15P49685 360 aa14.7□□□□□ -0.06
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