RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536265.5

DDX11-208, Transcript of DEAD/H-box helicase 11, human

TSL 5

Gene DDX11, Length 3,603 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX11-208	ENST00000536265	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		11.99	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	PAK5	Q9P286	719 aa		11.99	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	PADI3	Q9ULW8	664 aa		11.99	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		11.99	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265		F5H423	210 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	MSH2	P43246	934 aa		11.99	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	CLCNKB	P51801	687 aa		11.99	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	GDF10	P55107	478 aa		11.99	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	SP3	Q02447	781 aa		11.99	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		11.99	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		11.99	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		11.99	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	CHST12	Q9NRB3	414 aa		11.99	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		11.99	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		11.99	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	CIT	O14578	2027 aa		11.99	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	CFAP69	A5D8W1	941 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	ADAM17	P78536	824 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	TLCD1	Q96CP7	247 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	CFAP36	Q96G28	342 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	DUSP16	Q9BY84	665 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	EPB41L4B	Q9H329	900 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	GRIN2D	O15399	1336 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265		H3BRJ5	948 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	BZW1	Q7L1Q6	419 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	VPS52	Q8N1B4	723 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	TRPV1	Q8NER1	839 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	ARL5C	A6NH57	179 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	BANF1	O75531	89 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	NEBL	O76041	1014 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	ODC1	P11926	461 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	NCAM1	P13591	858 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	TGM2	P21980	687 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	RBL1	P28749	1068 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	SARNP	P82979	210 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	NOMO1	Q15155	1222 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	OSTM1	Q86WC4	334 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	PTGES	O14684	152 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	INHBA	P08476	426 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	CYBA	P13498	195 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	TSPY1	Q01534	308 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	CA9	Q16790	459 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	CCDC142	Q17RM4	750 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	HHAT	Q5VTY9	493 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	ABI1	Q8IZP0	508 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	TEKT4	Q8WW24	435 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	IQCG	Q9H095	443 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	SPAG7	O75391	227 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	TRPA1	O75762	1119 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	CP	P00450	1065 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	CA4	P22748	312 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	AMPD1	P23109	780 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	SSTR1	P30872	391 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	RAB27A	P51159	221 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	NRL	P54845	237 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	HDAC4	P56524	1084 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	AP1B1	Q10567	949 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	NOG	Q13253	232 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	FUK	Q8N0W3	1084 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	PLD5	Q8N7P1	536 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	ADAM32	Q8TC27	787 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	SMAP	O00193	183 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	MATK	P42679	507 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	NR1H3	Q13133	447 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDX11-208	ENST00000536265	ITGA7	Q13683	1181 aa		11.97	□□□□□ -0.49

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms