RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510923.5

MRPL3-208, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L3, human

TSL 2

Gene MRPL3, Length 813 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL3-208	ENST00000510923	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	WHAMM	Q8TF30	809 aa		14.76	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	RLN3	Q8WXF3	142 aa		14.76	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	EDEM2	Q9BV94	578 aa		14.76	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	14.76	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		14.76	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	POLM	Q9NP87	494 aa	Predicted RBP	14.76	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	OSER1	Q9NX31	292 aa		14.76	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		14.75	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	TRIM24	O15164	1050 aa		14.75	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	CYP26A1	O43174	497 aa		14.75	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	P2RY2	P41231	377 aa		14.75	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	DHPS	P49366	369 aa	Predicted RBP	14.75	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	14.75	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		14.75	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		14.75	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	HTR3D	Q70Z44	454 aa		14.75	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		14.75	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		14.75	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	14.75	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	FRMD1	Q8N878	549 aa		14.75	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	14.75	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		14.75	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	14.75	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		14.75	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		14.75	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		14.75	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		14.75	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	NMUR1	Q9HB89	426 aa		14.75	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	CYLD	Q9NQC7	956 aa		14.75	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	DEC1	Q9P2X7	70 aa		14.75	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	HCN2	Q9UL51	889 aa		14.75	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	SCML2	Q9UQR0	700 aa		14.75	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	TNRC6B	Q9UPQ9	1833 aa	Known RBP	14.75	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		14.74	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	LNP1	A1A4G5	178 aa		14.74	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	PATE3	B3GLJ2	98 aa		14.74	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	CILP	O75339	1184 aa		14.74	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	KRT13	P13646	458 aa		14.74	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	CD58	P19256	250 aa		14.74	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		14.74	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		14.74	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	14.74	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	TERB1	Q8NA31	727 aa		14.74	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	HMGB4	Q8WW32	186 aa		14.74	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		14.74	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	14.74	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	14.74	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		14.74	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	14.74	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		14.74	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	ASCC3	Q8N3C0	2202 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923		A0A1W2PQ27	194 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923		A0A1W2PQ64	194 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923		A0A1W2PQD8	194 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923		A0A1W2PQH9	124 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	C4orf47	A7E2U8	309 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	KHNYN	O15037	678 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	MDM4	O15151	490 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	KCNK5	O95279	499 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	RARG	P13631	454 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	PML	P29590	882 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	KIF11	P52732	1056 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	ENPEP	Q07075	957 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	ADAM9	Q13443	819 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	MIB1	Q86YT6	1006 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	PGBD3	Q8N328	593 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	PIGK	Q92643	395 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	SPACA7	Q96KW9	195 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	14.73	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	MARK1	Q9P0L2	795 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	CACNG3	O60359	315 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	ZNF202	O95125	648 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	TYR	P14679	529 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	WAS	P42768	502 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	PTGER3	P43115	390 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	ZNF394	Q53GI3	561 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	KRT39	Q6A163	491 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MRPL3-208	ENST00000510923	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		14.72	□□□□□ -0.05

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78 ms