RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507116.5

PDE4D-216, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 3,350 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-216ENST00000507116 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 LRRC20Q8TCA0 184 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 ZUFSPQ96AP4 578 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 GRAMD1AQ96CP6 724 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 SUCLG2Q96I99 432 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 GMCL1Q96IK5 515 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 HERPUD2Q9BSE4 406 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 PACSIN1Q9BY11 444 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 MROQ9BYG7 248 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 LRRC19Q9H756 370 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 TAGLN3Q9UI15 199 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 DAPK2Q9UIK4 370 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 PADI4Q9UM07 663 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 MAU2Q9Y6X3 613 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 DIP2BQ9P265 1576 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 FAM25AB3EWG3 89 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 FAM25CB3EWG5 89 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 FAM25GB3EWG6 89 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 UBXN8O00124 270 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 TNFRSF10BO14763 440 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 GNB5O14775 395 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 KCNN4O15554 427 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 KRT86O43790 486 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 ALDH1A2O94788 518 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 PDGFRAP16234 1089 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 PSMA2P25787 234 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 RFC4P35249 363 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 SERPINB5P36952 375 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 ERFP50548 548 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 PPARDQ03181 441 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 ZBTB16Q05516 673 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 ACSBG2Q5FVE4 666 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 FAM76BQ5HYJ3 339 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 PDPK2PQ6A1A2 396 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 NFRKBQ6P4R8 1299 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 FBXO11Q86XK2 927 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 DNAAF5Q86Y56 855 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 CPXCR1Q8N123 301 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 KCNG4Q8TDN1 519 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 DENND1AQ8TEH3 1009 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 TP53INP1Q96A56 240 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 COL26A1Q96A83 441 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 MTBPQ96DY7 904 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 ERLEC1Q96DZ1 483 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 TMEM80Q96HE8 168 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 MCCC2Q9HCC0 563 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 EPB41L5Q9HCM4 733 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 FETUBQ9UGM5 382 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 ABCC5O15440 1437 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 ZMYM6O95789 1325 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 A0A1B0GTQ1 180 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 HEATR9A2RTY3 570 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 HMX3A6NHT5 357 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 LAD1O00515 517 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP6.39□□□□□ -1.393e-7■■■■□ 19.9
PDE4D-216ENST00000507116 TXNDC9O14530 226 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 TOM1O60784 492 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 TNFAIP8O95379 198 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 APOC1P02654 83 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 IL6P05231 212 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 APEHP13798 732 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 CCDC130P13994 396 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 BTDP43251 543 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 TFDP1Q14186 410 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 SLC14A2Q15849 920 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 MMEL1Q495T6 779 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 FBXO48Q5FWF7 155 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 C9orf131Q5VYM1 1079 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 SCARA3Q6AZY7 606 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 STYK1Q6J9G0 422 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 ARSKQ6UWY0 536 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 UNC5AQ6ZN44 842 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 ANKLE2Q86XL3 938 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 PDSS2Q86YH6 399 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 CREG2Q8IUH2 290 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 CARFQ8N187 725 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 CLIP4Q8N3C7 705 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 IL17RDQ8NFM7 739 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 OR5H6Q8NGV6 325 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 DTX3LQ8TDB6 740 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 SNX18Q96RF0 628 aa6.39□□□□□ -1.39
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