RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504971.1

FBXO38-208, Transcript of F-box protein 38, human

TSL 3

Gene FBXO38, Length 492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO38-208	ENST00000504971	SCN4A	P35499	1836 aa		7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971		A0A087X0M5	115 aa		7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971		A0A1B0GX30	115 aa		7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	LCHN	A4D1U4	455 aa		7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	GLTPD2	A6NH11	291 aa		7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971		H3BRJ5	948 aa		7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	AP3D1	O14617	1153 aa		7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	GPR39	O43194	453 aa		7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	ZW10	O43264	779 aa		7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	EFS	O43281	561 aa		7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	NIPSNAP2	O75323	286 aa		7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	GUCY1B2	O75343	617 aa		7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	ALB	P02768	609 aa		7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	CCDC192	P0DO97	292 aa		7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	PFKFB1	P16118	471 aa		7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	KRT4	P19013	534 aa		7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	PRKACB	P22694	351 aa		7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	CYP4F8	P98187	520 aa		7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	TNFAIP2	Q03169	654 aa		7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	CUL1	Q13616	776 aa		7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	COTL1	Q14019	142 aa		7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	DOC2A	Q14183	400 aa		7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	SHC4	Q6S5L8	630 aa		7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	RANBP10	Q6VN20	620 aa		7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	NEK8	Q86SG6	692 aa		7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	FBXO11	Q86XK2	927 aa		7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	ENKUR	Q8TC29	256 aa		7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	ACER1	Q8TDN7	264 aa		7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	UCMA	Q8WVF2	138 aa		7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	ZIC5	Q96T25	663 aa		7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	TXN2	Q99757	166 aa		7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	ADNP	Q9H2P0	1102 aa		7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	SDAD1	Q9NVU7	687 aa	Known RBP eCLIP	7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	GGA3	Q9NZ52	723 aa		7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	EHD3	Q9NZN3	535 aa		7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	CD300A	Q9UGN4	299 aa		7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	IL19	Q9UHD0	177 aa		7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	WDR90	Q96KV7	1748 aa		7.07	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	7.06	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		7.06	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971		A0A1B0GVL5	298 aa		7.06	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	7.06	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971		F8W810	466 aa		7.06	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	CDK2AP1	O14519	115 aa		7.06	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	HAT1	O14929	419 aa		7.06	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	ADAMTS3	O15072	1205 aa		7.06	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	BUB1	O43683	1085 aa		7.06	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	EFCAB14	O75071	495 aa		7.06	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	FLOT1	O75955	427 aa		7.06	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF202	O95125	648 aa		7.06	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	ITGB3	P05106	788 aa		7.06	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	PSAP	P07602	524 aa		7.06	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	UBL4A	P11441	157 aa		7.06	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	HSPA6	P17066	643 aa		7.06	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	IL32	P24001	234 aa		7.06	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	AXL	P30530	894 aa		7.06	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	SYK	P43405	635 aa		7.06	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	GATA4	P43694	442 aa		7.06	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	HNMT	P50135	292 aa		7.06	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	NDUFA8	P51970	172 aa		7.06	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	DCAF7	P61962	342 aa		7.06	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	CSNK2B	P67870	215 aa		7.06	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	TPM4	P67936	248 aa		7.06	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	ARF5	P84085	180 aa		7.06	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	GHRHR	Q02643	423 aa		7.06	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	BFSP1	Q12934	665 aa		7.06	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	SNAPC2	Q13487	334 aa		7.06	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	GALNT3	Q14435	633 aa		7.06	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF174	Q15697	407 aa		7.06	□□□□□ -1.28

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