RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498524.5

ANKRD28-213, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,289 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-213ENST00000498524 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 OXCT1P55809 520 aa4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF844Q08AG5 666 aa4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 FAPQ12884 760 aa4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 LY6KQ17RY6 165 aa4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 LRRC8CQ8TDW0 803 aa4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 NSMCE1Q8WV22 266 aa4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 TSC22D3Q99576 134 aa4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 TTPALQ9BTX7 342 aa4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 MFRPQ9BY79 579 aa4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 TTYH3Q9C0H2 523 aa4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 CARD9Q9H257 536 aa4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 KRT82Q9NSB4 513 aa4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 MCM8Q9UJA3 840 aa4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 CDH7Q9ULB5 785 aa4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 DOLKQ9UPQ8 538 aa4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 LAMB4A4D0S4 1761 aa4.1□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 KANSL1LA0AUZ9 987 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 ESYT2A0FGR8 921 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 A6NCN8 305 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 SOWAHBA6NEL2 793 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 FAM170BA6NMN3 283 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 FAM25EA8MYX2 175 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 YKT6O15498 198 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 RALAP11233 206 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 NCAM1P13591 858 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 ADAM15Q13444 863 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 MESDQ14696 234 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 ANGPT1Q15389 498 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 CTXN3Q4LDR2 81 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 MIIPQ5JXC2 388 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 FBXO47Q5MNV8 452 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 TMC5Q6UXY8 1006 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 KIAA0895Q8NCT3 520 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 MAGEC3Q8TD91 643 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 TNFRSF25Q93038 417 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 TATDN2Q93075 761 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 TBC1D20Q96BZ9 403 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
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ANKRD28-213ENST00000498524 TRIM8Q9BZR9 551 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
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ANKRD28-213ENST00000498524 GTF3C4Q9UKN8 822 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa4.09□□□□□ -1.75
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ANKRD28-213ENST00000498524 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa4.09□□□□□ -1.75
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ANKRD28-213ENST00000498524 MAPK13O15264 365 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 DFNA5O60443 496 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 B3GALNT1O75752 331 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 AKAP3O75969 853 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 LCA5LO95447 670 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 ATP6V1G2O95670 118 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 ADH1CP00326 375 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 NR3C1P04150 777 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 NTRK1P04629 796 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 CTSAP10619 480 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 NDUFV2P19404 249 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 TSPAN7P41732 249 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 CYP2J2P51589 502 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 GSCP56915 257 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 CAV1Q03135 178 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 PTK2Q05397 1052 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 PGM5Q15124 567 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 FAM102BQ5T8I3 360 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 SPATA21Q7Z572 469 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 TMC3Q7Z5M5 1100 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 DSG4Q86SJ6 1040 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 KIAA2013Q8IYS2 634 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 GALNT15Q8N3T1 639 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 OXR1Q8N573 874 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 TPCN2Q8NHX9 752 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 MIEF2Q96C03 454 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 MOCOSQ96EN8 888 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 ANKRD27Q96NW4 1050 aa4.09□□□□□ -1.75
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