RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-215	ENST00000498284	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	5.2	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	GPD1	P21695	349 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	YY1	P25490	414 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	HTR7	P34969	479 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	TNFAIP2	Q03169	654 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	5.2	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	SARAF	Q96BY9	339 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	CRB3	Q9BUF7	120 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284		A0A087WV62	115 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	OR2W5	A6NFC9	320 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284		A8MVJ9	347 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284		F5H423	210 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	FFAR2	O15552	330 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	FGA	P02671	866 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	FPR3	P25089	353 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	CYP4F2	P78329	520 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	PSG6	Q00889	435 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	ATP1A4	Q13733	1029 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	ST3GAL2	Q16842	350 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	CEP85	Q6P2H3	762 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF527	Q8NB42	609 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	MORC4	Q8TE76	937 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	TMPRSS11D	O60235	418 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	C1QL1	O75973	258 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	WDR47	O94967	919 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	VIP	P01282	170 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	IGLV2-14	P01704	120 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	TMEM225B	P0DP42	221 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	MCM5	P33992	734 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	DIO1	P49895	249 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	MTAP	Q13126	283 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	ACOX1	Q15067	660 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	GGT6	Q6P531	493 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	POF1B	Q8WVV4	589 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	ZG16B	Q96DA0	208 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	VPS50	Q96JG6	964 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	WDR24	Q96S15	920 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	SNX15	Q9NRS6	342 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	CA14	Q9ULX7	337 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	TARM1	B6A8C7	271 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	PIP5K1B	O14986	540 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	EXOC3	O60645	756 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	CBFA2T3	O75081	653 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	JTB	O76095	146 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	ADRA1D	P25100	572 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	PBX1	P40424	430 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	DEUP1	Q05D60	604 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	LMAN2	Q12907	356 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	DENND2C	Q68D51	928 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	TERB1	Q8NA31	727 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	REPS1	Q96D71	796 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	CIPC	Q9C0C6	399 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PTPRK-215	ENST00000498284	AQP12B	A6NM10	295 aa		5.16	□□□□□ -1.58

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