RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCDC33Q8N5R6 958 aa5.42□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ASB2Q96Q27 587 aa5.42□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARNT2Q9HBZ2 717 aa5.42□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MGAT4CQ9UBM8 478 aa5.42□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ASAP1Q9ULH1 1129 aa5.42□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SNX2O60749 519 aa5.41□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MYL3P08590 195 aa5.41□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CD19P15391 556 aa5.41□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RBL1P28749 1068 aa5.41□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ATICP31939 592 aa5.41□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TM4SF4P48230 202 aa5.41□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MTAPQ13126 283 aa5.41□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa5.41□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KIAA0408Q6ZU52 694 aa5.41□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C8orf58Q8NAV2 365 aa5.41□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KAZALD1Q96I82 304 aa5.41□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SEMA4CQ9C0C4 833 aa5.41□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC25A32Q9H2D1 315 aa5.41□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 STARD7Q9NQZ5 370 aa5.41□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa5.41□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 STEAP1Q9UHE8 339 aa5.41□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 APOL1O14791 398 aa5.4□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NCK2O43639 380 aa5.4□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRC1O43663 620 aa5.4□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMPRSS11DO60235 418 aa5.4□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MT-CO3P00414 261 aa5.4□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARP10275 920 aa5.4□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CYP2D6P10635 497 aa5.4□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 COPB1P53618 953 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TBX4P57082 545 aa5.4□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM187BQ17R55 369 aa5.4□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CEP78Q5JTW2 689 aa5.4□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CRTC1Q6UUV9 634 aa5.4□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BEND5Q7L4P6 421 aa5.4□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DPP9Q86TI2 863 aa5.4□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SUN3Q8TAQ9 357 aa5.4□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa5.4□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LRRC46Q96FV0 321 aa5.4□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZBTB26Q9HCK0 441 aa5.4□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SNX15Q9NRS6 342 aa5.4□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 WDR91A4D1P6 747 aa5.39□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BTBD19C9JJ37 291 aa5.39□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 H3BNC9 293 aa5.39□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CBFA2T3O75081 653 aa5.39□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TUBB4AP04350 444 aa5.39□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MYL4P12829 197 aa5.39□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CERS1P27544 350 aa5.39□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GABRB3P28472 473 aa5.39□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MPGP29372 298 aa5.39□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ACOX1Q15067 660 aa5.39□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ST3GAL2Q16842 350 aa5.39□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa5.39□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GRHL2Q6ISB3 625 aa5.39□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa5.39□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF398Q8TD17 642 aa5.39□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BRI3BPQ8WY22 251 aa5.39□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCDC136Q96JN2 1154 aa5.39□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C5orf34Q96MH7 638 aa5.39□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SH2D3AQ9BRG2 576 aa5.39□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MAGEB5Q9BZ81 275 aa5.39□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa5.39□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RASA4BC9J798 803 aa5.38□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UBE2Q2LH0YL09 131 aa5.38□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PPP6CO00743 305 aa5.38□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RASA4O43374 803 aa5.38□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FGF18O76093 207 aa5.38□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KRT18P05783 430 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MYL1P05976 194 aa5.38□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HARSP12081 509 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TNFSF4P23510 183 aa5.38□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ADRA1DP25100 572 aa5.38□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CFHR3Q02985 330 aa5.38□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PMS2P11Q13670 270 aa5.38□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LONRF1Q17RB8 773 aa5.38□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM209BQ5JX69 171 aa5.38□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RAP1GAP2Q684P5 730 aa5.38□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DENND2CQ68D51 928 aa5.38□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IL31Q6EBC2 164 aa5.38□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 USP17L6PQ6QN14 398 aa5.38□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PNPLA1Q8N8W4 532 aa5.38□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PARD3BQ8TEW8 1205 aa5.38□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.7 ms