RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
NISCH-213ENST00000489895 MICAL2O94851 1124 aa17.59■□□□□ 0.41
NISCH-213ENST00000489895 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
NISCH-213ENST00000489895 TBX4P57082 545 aa17.59■□□□□ 0.41
NISCH-213ENST00000489895 GRIK5Q16478 980 aa17.59■□□□□ 0.41
NISCH-213ENST00000489895 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
NISCH-213ENST00000489895 IL17RAQ96F46 866 aa17.59■□□□□ 0.41
NISCH-213ENST00000489895 TNFSF13BQ9Y275 285 aa17.59■□□□□ 0.41
NISCH-213ENST00000489895 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa17.59■□□□□ 0.41
NISCH-213ENST00000489895 PTENP60484 403 aa17.59■□□□□ 0.41
NISCH-213ENST00000489895 GTF2BQ00403 316 aa17.59■□□□□ 0.41
NISCH-213ENST00000489895 MED21Q13503 144 aa17.59■□□□□ 0.41
NISCH-213ENST00000489895 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
NISCH-213ENST00000489895 OLFM3Q96PB7 478 aa17.59■□□□□ 0.41
NISCH-213ENST00000489895 NEUROG2Q9H2A3 272 aa17.59■□□□□ 0.41
NISCH-213ENST00000489895 ATRNO75882 1429 aa17.59■□□□□ 0.41
NISCH-213ENST00000489895 LRRC10BA6NIK2 292 aa17.59■□□□□ 0.41
NISCH-213ENST00000489895 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
NISCH-213ENST00000489895 DENND1BQ6P3S1 775 aa17.59■□□□□ 0.41
NISCH-213ENST00000489895 FAM9CQ8IZT9 166 aa17.59■□□□□ 0.41
NISCH-213ENST00000489895 GOLGA8TH3BQL2 631 aa17.59■□□□□ 0.41
NISCH-213ENST00000489895 MAP3K10Q02779 954 aa17.59■□□□□ 0.41
NISCH-213ENST00000489895 FAM171A1Q5VUB5 890 aa17.59■□□□□ 0.41
NISCH-213ENST00000489895 TATDN1Q6P1N9 297 aa17.59■□□□□ 0.41
NISCH-213ENST00000489895 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
NISCH-213ENST00000489895 ACTL9Q8TC94 416 aa17.59■□□□□ 0.41
NISCH-213ENST00000489895 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
NISCH-213ENST00000489895 A0A087X0B3 334 aa17.58■□□□□ 0.41
NISCH-213ENST00000489895 YWHAQP27348 245 aa17.58■□□□□ 0.41
NISCH-213ENST00000489895 MARC1Q5VT66 337 aa17.58■□□□□ 0.41
NISCH-213ENST00000489895 AP1ARQ63HQ0 302 aa17.58■□□□□ 0.41
NISCH-213ENST00000489895 SLC26A11Q86WA9 606 aa17.58■□□□□ 0.41
NISCH-213ENST00000489895 UROC1Q96N76 676 aa17.58■□□□□ 0.41
NISCH-213ENST00000489895 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP17.58■□□□□ 0.41
NISCH-213ENST00000489895 SHOC2Q9UQ13 582 aa17.58■□□□□ 0.41
NISCH-213ENST00000489895 SLIT3O75094 1523 aa17.58■□□□□ 0.41
NISCH-213ENST00000489895 VCLP18206 1134 aa17.58■□□□□ 0.41
NISCH-213ENST00000489895 PTPN7P35236 360 aa17.58■□□□□ 0.41
NISCH-213ENST00000489895 ADIGQ0VDE8 80 aa17.58■□□□□ 0.41
NISCH-213ENST00000489895 MTM1Q13496 603 aa17.58■□□□□ 0.41
NISCH-213ENST00000489895 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP17.58■□□□□ 0.41
NISCH-213ENST00000489895 PNKPQ96T60 521 aa17.58■□□□□ 0.41
NISCH-213ENST00000489895 TMEM121Q9BTD3 319 aa17.58■□□□□ 0.41
NISCH-213ENST00000489895 MAF1Q9H063 256 aa17.58■□□□□ 0.41
NISCH-213ENST00000489895 CLPBQ9H078 707 aa17.58■□□□□ 0.41
NISCH-213ENST00000489895 TRHDEQ9UKU6 1024 aa17.58■□□□□ 0.41
NISCH-213ENST00000489895 SLC6A3Q01959 620 aa17.58■□□□□ 0.4
NISCH-213ENST00000489895 NBPF20Q3BBV1 942 aa17.58■□□□□ 0.4
NISCH-213ENST00000489895 BHMTQ93088 406 aa17.58■□□□□ 0.4
NISCH-213ENST00000489895 CCT8L1PA6NM43 557 aa17.58■□□□□ 0.4
NISCH-213ENST00000489895 EVPLLA8MZ36 301 aa17.58■□□□□ 0.4
NISCH-213ENST00000489895 PFDN1O60925 122 aa17.58■□□□□ 0.4
NISCH-213ENST00000489895 RBP1P09455 135 aa17.58■□□□□ 0.4
NISCH-213ENST00000489895 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP17.58■□□□□ 0.4
NISCH-213ENST00000489895 RBBP8Q99708 897 aa17.58■□□□□ 0.4
NISCH-213ENST00000489895 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
NISCH-213ENST00000489895 MAFO75444 373 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
NISCH-213ENST00000489895 NFIL3Q16649 462 aa17.57■□□□□ 0.4
NISCH-213ENST00000489895 NLRP9Q7RTR0 991 aa17.57■□□□□ 0.4
NISCH-213ENST00000489895 LONP2Q86WA8 852 aa17.57■□□□□ 0.4
NISCH-213ENST00000489895 KCTD10Q9H3F6 313 aa17.57■□□□□ 0.4
NISCH-213ENST00000489895 PJA2O43164 708 aa17.57■□□□□ 0.4
NISCH-213ENST00000489895 FGRP09769 529 aa17.57■□□□□ 0.4
NISCH-213ENST00000489895 RPAINQ86UA6 219 aa17.57■□□□□ 0.4
NISCH-213ENST00000489895 MYO1HQ8N1T3 1032 aa17.57■□□□□ 0.4
NISCH-213ENST00000489895 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa17.57■□□□□ 0.4
NISCH-213ENST00000489895 FICDQ9BVA6 458 aa17.57■□□□□ 0.4
NISCH-213ENST00000489895 RNF112Q9ULX5 631 aa17.57■□□□□ 0.4
NISCH-213ENST00000489895 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa17.57■□□□□ 0.4
NISCH-213ENST00000489895 TRIM66O15016 1216 aa17.57■□□□□ 0.4
NISCH-213ENST00000489895 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
NISCH-213ENST00000489895 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
NISCH-213ENST00000489895 STX5Q13190 355 aa17.57■□□□□ 0.4
NISCH-213ENST00000489895 KCNK18Q7Z418 384 aa17.57■□□□□ 0.4
NISCH-213ENST00000489895 HAS1Q92839 578 aa17.57■□□□□ 0.4
NISCH-213ENST00000489895 CAVIN3Q969G5 261 aa17.57■□□□□ 0.4
NISCH-213ENST00000489895 PLA2G4CQ9UP65 541 aa17.57■□□□□ 0.4
NISCH-213ENST00000489895 TRIM17Q9Y577 477 aa17.57■□□□□ 0.4
NISCH-213ENST00000489895 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa17.57■□□□□ 0.4
NISCH-213ENST00000489895 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
NISCH-213ENST00000489895 ADGRA2Q96PE1 1338 aa17.57■□□□□ 0.4
NISCH-213ENST00000489895 TMEM150BA6NC51 233 aa17.57■□□□□ 0.4
NISCH-213ENST00000489895 SERPINF2P08697 491 aa17.57■□□□□ 0.4
NISCH-213ENST00000489895 MAP2K5Q13163 448 aa17.57■□□□□ 0.4
NISCH-213ENST00000489895 MEA1Q16626 185 aa17.57■□□□□ 0.4
NISCH-213ENST00000489895 CCDC90BQ9GZT6 254 aa17.57■□□□□ 0.4
NISCH-213ENST00000489895 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
NISCH-213ENST00000489895 HACD1B0YJ81 288 aa17.57■□□□□ 0.4
NISCH-213ENST00000489895 ANKRD63C9JTQ0 380 aa17.57■□□□□ 0.4
NISCH-213ENST00000489895 RAMP2O60895 175 aa17.57■□□□□ 0.4
NISCH-213ENST00000489895 DNAJB2P25686 324 aa17.57■□□□□ 0.4
NISCH-213ENST00000489895 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
NISCH-213ENST00000489895 KCNV2Q8TDN2 545 aa17.57■□□□□ 0.4
NISCH-213ENST00000489895 TSC22D3Q99576 134 aa17.57■□□□□ 0.4
NISCH-213ENST00000489895 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP17.57■□□□□ 0.45e-6■■■□□ 15.9
NISCH-213ENST00000489895 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
NISCH-213ENST00000489895 GLP2RO95838 553 aa17.56■□□□□ 0.4
NISCH-213ENST00000489895 NSL1Q96IY1 281 aa17.56■□□□□ 0.4
NISCH-213ENST00000489895 PRKD2Q9BZL6 878 aa17.56■□□□□ 0.4
NISCH-213ENST00000489895 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms