RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GCAP28676 217 aa16.16■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VCPP55072 806 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF449Q6P9G9 518 aa16.16■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC2A14Q8TDB8 520 aa16.16■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa16.16■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPME1Q9Y570 386 aa16.16■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 F8W810 466 aa16.15■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BEST1O76090 585 aa16.15■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KRT16P08779 473 aa16.15■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C9orf57Q5W0N0 161 aa16.15■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IFNL1Q8IU54 200 aa16.15■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ADAM32Q8TC27 787 aa16.15■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PYROXD1Q8WU10 500 aa16.15■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM237Q96Q45 408 aa16.15■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GRID1Q9ULK0 1009 aa16.15■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IPPQ9Y573 584 aa16.15■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KRT4P19013 534 aa16.15■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TKTP29401 623 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MLH1P40692 756 aa16.15■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LMNB2Q03252 620 aa16.15■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC1A5Q15758 541 aa16.15■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HIF1AQ16665 826 aa16.15■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FNBP1LQ5T0N5 605 aa16.15■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC30A9Q6PML9 568 aa16.15■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CENPUQ71F23 418 aa16.15■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ECHDC2Q86YB7 292 aa16.15■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAML1Q92585 1016 aa16.15■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 P3H4Q92791 437 aa16.15■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ITGA11Q9UKX5 1188 aa16.15■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CASTOR2A6NHX0 329 aa16.14■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KDELR1P24390 212 aa16.14■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NDUFV1P49821 464 aa16.14■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OVGP1Q12889 678 aa16.14■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LAMB3Q13751 1172 aa16.14■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HHATQ5VTY9 493 aa16.14■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRABD2AQ86V40 505 aa16.14■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VSIG1Q86XK7 387 aa16.14■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PYROXD2Q8N2H3 581 aa16.14■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRIB2Q92519 343 aa16.14■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAGEB18Q96M61 343 aa16.14■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM210AQ96ND0 272 aa16.14■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF570Q96NI8 536 aa16.14■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GAD1Q99259 594 aa16.14■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C17orf102A2RUQ5 167 aa16.14■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VDRP11473 427 aa16.14■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NUMBP49757 651 aa16.14■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 COPS2P61201 443 aa16.14■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UBXN11Q5T124 520 aa16.14■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa16.14■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa16.14■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 STKLD1Q8NE28 680 aa16.14■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ERP27Q96DN0 273 aa16.14■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ETNK1Q9HBU6 452 aa16.14■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LMCD1Q9NZU5 365 aa16.14■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DCTN4Q9UJW0 460 aa16.14■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PHTF1Q9UMS5 762 aa16.14■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CHMP2BQ9UQN3 213 aa16.14■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RNF8O76064 485 aa16.14■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 P4HA1P13674 534 aa16.14■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NQO1P15559 274 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TARSP26639 723 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RGMBQ6NW40 437 aa16.14■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C17orf99Q6UX52 265 aa16.14■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF410Q86VK4 478 aa16.14■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OSTM1Q86WC4 334 aa16.14■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KLHL23Q8NBE8 558 aa16.14■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM172AQ8WUF8 416 aa16.14■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa16.14■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM149B1Q96BN6 582 aa16.14■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CEP41Q9BYV8 373 aa16.14■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MIOSQ9NXC5 875 aa16.14■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C15orf41Q9Y2V0 281 aa16.14■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa16.14■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C2CD2Q9Y426 696 aa16.14■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SMIM24O75264 130 aa16.13■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AVILO75366 819 aa16.13■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP16.13■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OAS1P00973 400 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GNAT1P11488 350 aa16.13■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NEFHP12036 1026 aa16.13■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PURAQ00577 322 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PALM2Q8IXS6 379 aa16.13■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms