RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489053.1

HDAC6-232, Transcript of histone deacetylase 6, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC6, Length 539 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6-232ENST00000489053 CCDC186Q7Z3E2 898 aa9.59□□□□□ -0.87
HDAC6-232ENST00000489053 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
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HDAC6-232ENST00000489053 TRIM59Q8IWR1 403 aa9.59□□□□□ -0.87
HDAC6-232ENST00000489053 ZNF687Q8N1G0 1237 aa9.59□□□□□ -0.87
HDAC6-232ENST00000489053 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
HDAC6-232ENST00000489053 ZBTB44Q8NCP5 570 aa9.59□□□□□ -0.87
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HDAC6-232ENST00000489053 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.87
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HDAC6-232ENST00000489053 ZNF510Q9Y2H8 683 aa9.59□□□□□ -0.87
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HDAC6-232ENST00000489053 PDE4CQ08493 712 aa9.58□□□□□ -0.88
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HDAC6-232ENST00000489053 KLHDC10Q6PID8 442 aa9.58□□□□□ -0.88
HDAC6-232ENST00000489053 GBP6Q6ZN66 633 aa9.58□□□□□ -0.88
HDAC6-232ENST00000489053 BBS7Q8IWZ6 715 aa9.58□□□□□ -0.88
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HDAC6-232ENST00000489053 NAT16Q8N8M0 369 aa9.58□□□□□ -0.88
HDAC6-232ENST00000489053 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa9.58□□□□□ -0.88
HDAC6-232ENST00000489053 UBA3Q8TBC4 463 aa9.58□□□□□ -0.88
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HDAC6-232ENST00000489053 EPC1Q9H2F5 836 aa9.58□□□□□ -0.88
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HDAC6-232ENST00000489053 O00370 1275 aa9.57□□□□□ -0.88
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HDAC6-232ENST00000489053 SART1O43290 800 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
HDAC6-232ENST00000489053 RPP40O75818 363 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
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HDAC6-232ENST00000489053 C10orf76Q5T2E6 689 aa9.57□□□□□ -0.88
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HDAC6-232ENST00000489053 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
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HDAC6-232ENST00000489053 SYNCQ9H7C4 482 aa9.57□□□□□ -0.88
HDAC6-232ENST00000489053 NMUR1Q9HB89 426 aa9.57□□□□□ -0.88
HDAC6-232ENST00000489053 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
HDAC6-232ENST00000489053 CNGB3Q9NQW8 809 aa9.57□□□□□ -0.88
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