RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461448.5

SNHG12-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 12, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SNHG12, Length 1,629 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12-201ENST00000461448 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa20.49■□□□□ 0.87
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SNHG12-201ENST00000461448 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa20.49■□□□□ 0.87
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SNHG12-201ENST00000461448 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
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SNHG12-201ENST00000461448 C2orf78A6NCI8 922 aa20.47■□□□□ 0.87
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SNHG12-201ENST00000461448 RALAP11233 206 aa20.47■□□□□ 0.87
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SNHG12-201ENST00000461448 ARCQ7LC44 396 aa20.47■□□□□ 0.87
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SNHG12-201ENST00000461448 TASP1Q9H6P5 420 aa20.47■□□□□ 0.87
SNHG12-201ENST00000461448 CCSER2Q9H7U1 834 aa20.47■□□□□ 0.87
SNHG12-201ENST00000461448 UVRAGQ9P2Y5 699 aa20.47■□□□□ 0.87
SNHG12-201ENST00000461448 MYO1AQ9UBC5 1043 aa20.47■□□□□ 0.87
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SNHG12-201ENST00000461448 SP100P23497 879 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
SNHG12-201ENST00000461448 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP20.46■□□□□ 0.87
SNHG12-201ENST00000461448 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SNHG12-201ENST00000461448 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SNHG12-201ENST00000461448 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SNHG12-201ENST00000461448 AAK1Q2M2I8 961 aa20.46■□□□□ 0.87
SNHG12-201ENST00000461448 DCUN1D2Q6PH85 259 aa20.46■□□□□ 0.87
SNHG12-201ENST00000461448 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SNHG12-201ENST00000461448 BEND5Q7L4P6 421 aa20.46■□□□□ 0.87
SNHG12-201ENST00000461448 NPAS3Q8IXF0 933 aa20.46■□□□□ 0.87
SNHG12-201ENST00000461448 MYADMQ96S97 322 aa20.46■□□□□ 0.87
SNHG12-201ENST00000461448 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SNHG12-201ENST00000461448 SLC46A2Q9BY10 475 aa20.46■□□□□ 0.87
SNHG12-201ENST00000461448 NACA2Q9H009 215 aa20.46■□□□□ 0.87
SNHG12-201ENST00000461448 POPDC2Q9HBU9 364 aa20.46■□□□□ 0.87
SNHG12-201ENST00000461448 ABCC13Q9NSE7 274 aa20.46■□□□□ 0.87
SNHG12-201ENST00000461448 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP20.46■□□□□ 0.87
SNHG12-201ENST00000461448 CLIC5Q9NZA1 410 aa20.46■□□□□ 0.87
SNHG12-201ENST00000461448 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP20.46■□□□□ 0.876e-8■■□□□ 11.5
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SNHG12-201ENST00000461448 CDH7Q9ULB5 785 aa20.46■□□□□ 0.87
SNHG12-201ENST00000461448 DOCK6Q96HP0 2047 aa20.46■□□□□ 0.87
SNHG12-201ENST00000461448 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.87
SNHG12-201ENST00000461448 BTNL10A8MVZ5 291 aa20.45■□□□□ 0.87
SNHG12-201ENST00000461448 TLR5O60602 858 aa20.45■□□□□ 0.87
SNHG12-201ENST00000461448 HDCP19113 662 aa20.45■□□□□ 0.87
SNHG12-201ENST00000461448 MAMLD1Q13495 774 aa20.45■□□□□ 0.87
SNHG12-201ENST00000461448 C10orf120Q5SQS8 335 aa20.45■□□□□ 0.87
SNHG12-201ENST00000461448 TADA2BQ86TJ2 420 aa20.45■□□□□ 0.87
SNHG12-201ENST00000461448 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.87
SNHG12-201ENST00000461448 RNF139Q8WU17 664 aa20.45■□□□□ 0.87
SNHG12-201ENST00000461448 RFFLQ8WZ73 363 aa20.45■□□□□ 0.87
SNHG12-201ENST00000461448 ZSWIM3Q96MP5 696 aa20.45■□□□□ 0.87
SNHG12-201ENST00000461448 CYP2S1Q96SQ9 504 aa20.45■□□□□ 0.87
SNHG12-201ENST00000461448 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.87
SNHG12-201ENST00000461448 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa20.45■□□□□ 0.87
SNHG12-201ENST00000461448 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa20.45■□□□□ 0.87
SNHG12-201ENST00000461448 NOTCH4Q99466 2003 aa20.45■□□□□ 0.86
SNHG12-201ENST00000461448 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa20.45■□□□□ 0.86
SNHG12-201ENST00000461448 CAPN9O14815 690 aa20.45■□□□□ 0.86
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