RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458278.6

ANKRD54-208, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD54, Length 623 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-208ENST00000458278 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
ANKRD54-208ENST00000458278 PLA2G4AP47712 749 aa18.09■□□□□ 0.49
ANKRD54-208ENST00000458278 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
ANKRD54-208ENST00000458278 PKDCCQ504Y2 493 aa18.09■□□□□ 0.49
ANKRD54-208ENST00000458278 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
ANKRD54-208ENST00000458278 PM20D1Q6GTS8 502 aa18.09■□□□□ 0.49
ANKRD54-208ENST00000458278 RRAGAQ7L523 313 aa18.09■□□□□ 0.49
ANKRD54-208ENST00000458278 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa18.09■□□□□ 0.49
ANKRD54-208ENST00000458278 IRF2BP1Q8IU81 584 aa18.09■□□□□ 0.49
ANKRD54-208ENST00000458278 ARHGEF19Q8IW93 802 aa18.09■□□□□ 0.49
ANKRD54-208ENST00000458278 SUMF1Q8NBK3 374 aa18.09■□□□□ 0.49
ANKRD54-208ENST00000458278 KAT5Q92993 513 aa18.09■□□□□ 0.49
ANKRD54-208ENST00000458278 FAM81BQ96LP2 452 aa18.09■□□□□ 0.49
ANKRD54-208ENST00000458278 EPC1Q9H2F5 836 aa18.09■□□□□ 0.49
ANKRD54-208ENST00000458278 THAP9Q9H5L6 903 aa18.09■□□□□ 0.49
ANKRD54-208ENST00000458278 CNTN6Q9UQ52 1028 aa18.09■□□□□ 0.49
ANKRD54-208ENST00000458278 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa18.08■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 GREM1O60565 184 aa18.08■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 RNF40O75150 1001 aa18.08■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 ZBED1O96006 694 aa18.08■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 ADH5P11766 374 aa18.08■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 TKTL1P51854 596 aa18.08■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 ZNF132P52740 706 aa18.08■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 CNGA2Q16280 664 aa18.08■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 DPCR1Q3MIW9 517 aa18.08■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 SMYD5Q6GMV2 418 aa18.08■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 FAM114A1Q8IWE2 563 aa18.08■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 BBS7Q8IWZ6 715 aa18.08■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 SCML4Q8N228 414 aa18.08■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 KCTD13Q8WZ19 329 aa18.08■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 TFAP2BQ92481 460 aa18.08■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 KREMEN1Q96MU8 473 aa18.08■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 LRRC4Q9HBW1 653 aa18.08■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP18.08■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 IRF1P10914 325 aa18.07■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP18.07■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 COG7P83436 770 aa18.07■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 GAD2Q05329 585 aa18.07■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 LY6G5CQ5SRR4 150 aa18.07■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 PKN3Q6P5Z2 889 aa18.07■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 TRIM65Q6PJ69 517 aa18.07■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 GBP6Q6ZN66 633 aa18.07■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 ACDQ96AP0 544 aa18.07■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 ULBP1Q9BZM6 244 aa18.07■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 SPHK2Q9NRA0 654 aa18.07■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 C2orf42Q9NWW7 574 aa18.07■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa18.06■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 GOLGA6L22H0YM25 854 aa18.06■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 TULP2O00295 520 aa18.06■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 CNR2P34972 360 aa18.06■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 MFAP3P55082 362 aa18.06■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 ADIGQ0VDE8 80 aa18.06■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 BTBD8Q5XKL5 378 aa18.06■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 SYT13Q7L8C5 426 aa18.06■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 LONP2Q86WA8 852 aa18.06■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 CREBRFQ8IUR6 639 aa18.06■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa18.06■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 UBA3Q8TBC4 463 aa18.06■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 SLC35F5Q8WV83 523 aa18.06■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 WBP2Q969T9 261 aa18.06■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 PNKPQ96T60 521 aa18.06■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 CNGB3Q9NQW8 809 aa18.06■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 NUDT5Q9UKK9 219 aa18.06■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 SLC8A2Q9UPR5 921 aa18.06■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 A0A0A0MRY4 1105 aa18.05■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 MDM4O15151 490 aa18.05■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 STC2O76061 302 aa18.05■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 BRD2P25440 801 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 MEA1Q16626 185 aa18.05■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 MAN2A1Q16706 1144 aa18.05■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 EXOC3L4Q17RC7 722 aa18.05■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 Q6ZNB5 142 aa18.05■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 BHLHA9Q7RTU4 235 aa18.05■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa18.05■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 CAMKK1Q8N5S9 505 aa18.05■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa18.05■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 RUBCNQ92622 972 aa18.05■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 ZSWIM1Q9BR11 485 aa18.05■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 CRACR2AQ9BSW2 395 aa18.05■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 DCLK3Q9C098 648 aa18.05■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 APEX2Q9UBZ4 518 aa18.05■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 STRIP2Q9ULQ0 834 aa18.05■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 ZNF510Q9Y2H8 683 aa18.05■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 K7EQS6 105 aa18.04■□□□□ 0.48
ANKRD54-208ENST00000458278 M0QYV0 167 aa18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms