RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453996.6

CTU2-202, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTU2, Length 1,751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-202ENST00000453996 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa22.27■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 CAPN9O14815 690 aa22.27■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 LTFP02788 710 aa22.27■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 CYP2F1P24903 491 aa22.27■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 GRIK1P39086 918 aa22.27■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 PBX3P40426 434 aa22.27■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 DYNLT1P63172 113 aa22.27■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 LMNB2Q03252 620 aa22.27■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 ERMARDQ5T6L9 678 aa22.27■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 VSIG1Q86XK7 387 aa22.27■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 TTC13Q8NBP0 860 aa22.27■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
CTU2-202ENST00000453996 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 TRIM43BA6NCK2 446 aa22.26■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 KIAA0355O15063 1070 aa22.26■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 FAM153BP0C7A2 387 aa22.26■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 PTK6Q13882 451 aa22.26■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 FAM153CQ494X1 144 aa22.26■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 PM20D1Q6GTS8 502 aa22.26■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 BHLHA9Q7RTU4 235 aa22.26■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 BNIPLQ7Z465 357 aa22.26■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 HAUS1Q96CS2 278 aa22.26■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 B3GALT6Q96L58 329 aa22.26■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 NEUROG2Q9H2A3 272 aa22.26■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 VIPAS39Q9H9C1 493 aa22.26■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 PCDH18Q9HCL0 1135 aa22.26■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 FAM153AQ9UHL3 310 aa22.26■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa22.26■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 SNX24Q9Y343 169 aa22.26■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 MYO16Q9Y6X6 1858 aa22.26■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 AMHP03971 560 aa22.25■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 FYNP06241 537 aa22.25■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 RDXP35241 583 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 RPL21P46778 160 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 SYPL2Q5VXT5 272 aa22.25■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 FAM53CQ9NYF3 392 aa22.25■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 RRN3Q9NYV6 651 aa22.25■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa22.25■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 DNPEPQ9ULA0 475 aa22.25■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 AP4E1Q9UPM8 1137 aa22.25■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa22.25■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 USP3Q9Y6I4 520 aa22.25■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 M0QYT0 321 aa22.25■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 CSF2RAP15509 400 aa22.25■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 RAG1P15918 1043 aa22.25■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 ITGB8P26012 769 aa22.25■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 VCPP55072 806 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 MMRN1Q13201 1228 aa22.25■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 TFDP2Q14188 446 aa22.25■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 CA9Q16790 459 aa22.25■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 VSTM1Q6UX27 236 aa22.25■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 FAM71BQ8TC56 605 aa22.25■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 TOP1MTQ969P6 601 aa22.25■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 ZNF670Q9BS34 389 aa22.25■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 TRIM62Q9BVG3 475 aa22.25■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 ACBD3Q9H3P7 528 aa22.25■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 CWH43Q9H720 699 aa22.25■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 ZNF487B1APH4 448 aa22.24■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 H7C4K7 107 aa22.24■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa22.24■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 EFCAB14O75071 495 aa22.24■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 APOC2P02655 101 aa22.24■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 NCAM1P13591 858 aa22.24■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 SLC5A3P53794 718 aa22.24■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 DEUP1Q05D60 604 aa22.24■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 DPYSL2Q16555 572 aa22.24■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 RTP2Q5QGT7 225 aa22.24■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 ZNF365Q70YC5 407 aa22.24■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 FAM131BQ86XD5 332 aa22.24■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 SCN4BQ8IWT1 228 aa22.24■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 CCDC185Q8N715 623 aa22.24■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 RNF157Q96PX1 679 aa22.24■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 TTPALQ9BTX7 342 aa22.24■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 GRHL1Q9NZI5 618 aa22.24■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 OGFRQ9NZT2 677 aa22.24■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 ASIC3Q9UHC3 531 aa22.24■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 HPCAL4Q9UM19 191 aa22.24■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 ZNF148Q9UQR1 794 aa22.24■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 TNFRSF10BO14763 440 aa22.23■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 TRIM66O15016 1216 aa22.23■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 OASLQ15646 514 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 MFSD5Q6N075 450 aa22.23■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 ANKS3Q6ZW76 656 aa22.23■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 GSTA5Q7RTV2 222 aa22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.3 ms