RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 ZSWIM3Q96MP5 696 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC46A2Q9BY10 475 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 MIS12Q9H081 205 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 CYTH4Q9UIA0 394 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 SERPING1P05155 500 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 RALAP11233 206 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 AOC1P19801 751 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 NBL1P41271 181 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 STXBP5Q5T5C0 1151 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 DRC7Q8IY82 874 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 CMTM8Q8IZV2 173 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF276Q8N554 614 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 SMARCD2Q92925 531 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 ASB16Q96NS5 453 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 HAUS4Q9H6D7 363 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 TRPV4Q9HBA0 871 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 TRPC7Q9HCX4 862 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 CLIC5Q9NZA1 410 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 NAGPAQ9UK23 515 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 FBXL21Q9UKT6 434 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 A0A1W2PQH9 124 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 E5RJQ4 531 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 HDCP19113 662 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 AVPR1AP37288 418 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 DAOAP59103 153 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP11.11□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 NOMO3P69849 1222 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 ARID5BQ14865 1188 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM78AQ5JUQ0 283 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 NAA35Q5VZE5 725 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 POTEHQ6S545 545 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 SCD5Q86SK9 330 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 TADA2BQ86TJ2 420 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 ERICH1Q86X53 443 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 CNGA4Q8IV77 575 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 FLCNQ8NFG4 579 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 E2F7Q96AV8 911 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 CPXM1Q96SM3 734 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 DNAJC7Q99615 494 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 SYT11Q9BT88 431 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 SYNCQ9H7C4 482 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 WNT16Q9UBV4 365 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 C2orf78A6NCI8 922 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 ANHXE9PGG2 379 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 PIK3R2O00459 728 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 ADCY5O95622 1261 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 OAS1P00973 400 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 SKILP12757 684 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 UNGP13051 313 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 VPS36Q86VN1 386 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 SCUBE3Q8IX30 993 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 CCDC105Q8IYK2 499 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 CPA5Q8WXQ8 436 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 GOLGA1Q92805 767 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 PCDHB18PQ96TA0 734 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 TRIM62Q9BVG3 475 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 NMUR1Q9HB89 426 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 ZFP14Q9HCL3 533 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 DOCK8Q8NF50 2099 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 WDFY4Q6ZS81 3184 aa11.1□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 CCDC66A2RUB6 948 aa11.1□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 NARSO43776 548 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 MFAP3LO75121 409 aa11.1□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 OLFM2O95897 454 aa11.1□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 RARGP13631 454 aa11.1□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 CDC25BP30305 580 aa11.1□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 NSFP46459 744 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 GABRB2P47870 512 aa11.1□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 PGFP49763 221 aa11.1□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC7A9P82251 487 aa11.1□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 HTR4Q13639 388 aa11.1□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 PTPN20Q4JDL3 420 aa11.1□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 BTBD8Q5XKL5 378 aa11.1□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 HGSNATQ68CP4 663 aa11.1□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 BHLHA9Q7RTU4 235 aa11.1□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 SIX5Q8N196 739 aa11.1□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC44A3Q8N4M1 653 aa11.1□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 ANKRD7Q92527 254 aa11.1□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 ELSPBP1Q96BH3 223 aa11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.1 ms