RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441703.5

HDAC6-210, Transcript of histone deacetylase 6, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC6, Length 599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6-210ENST00000441703 ASAP3Q8TDY4 903 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 TBCKQ8TEA7 893 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 USP33Q8TEY7 942 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 CAVIN3Q969G5 261 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 LGMNQ99538 433 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 ADPGKQ9BRR6 497 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 LRRC3Q9BY71 257 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 KIF9Q9HAQ2 790 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 ETAA1Q9NY74 926 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 ZMYM5Q9UJ78 669 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 MAN1B1Q9UKM7 699 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 TBX20Q9UMR3 447 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 ASB3Q9Y575 518 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 SAR1BQ9Y6B6 198 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 CFAP46Q8IYW2 2715 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 ANO9A1A5B4 782 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 LRRC10BA6NIK2 292 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 TTC36A6NLP5 189 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 FLRT2O43155 660 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 MGRN1O60291 552 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 HSF2BPO75031 334 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 DGAT1O75907 488 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 CER1O95813 267 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 JUPP14923 745 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 PRLRP16471 622 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 CCR10P46092 362 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 UCNP55089 124 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 TMPRSS3P57727 454 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 TLE3Q04726 772 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 KCNH2Q12809 1159 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 XRCC4Q13426 336 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 PNOCQ13519 176 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 RIPK1Q13546 671 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 VEPH1Q14D04 833 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 UPP1Q16831 310 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 FAM187BQ17R55 369 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 MAP7D1Q3KQU3 841 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 PKDCCQ504Y2 493 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 XKR9Q5GH70 373 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 EOGTQ5NDL2 527 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 ARHGAP40Q5TG30 622 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 SHC4Q6S5L8 630 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 DHRS13Q6UX07 377 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 CD300LGQ6UXG3 332 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 GAREM2Q75VX8 874 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 TMPRSS12Q86WS5 348 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 CCDC13Q8IYE1 715 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 FUKQ8N0W3 1084 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 C3orf58Q8NDZ4 430 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 CCHCR1Q8TD31 782 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 FGF11Q92914 225 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 PSMG2Q969U7 264 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 MED8Q96G25 268 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 TMEM176AQ96HP8 235 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 HSPA12BQ96MM6 686 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 PGLYRP2Q96PD5 576 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 ECT2Q9H8V3 914 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 TM7SF3Q9NS93 570 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 TOR4AQ9NXH8 423 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 GDAQ9Y2T3 454 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa6.84□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 CEP192Q8TEP8 1941 aa6.84□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 PODXLO00592 558 aa6.84□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 TNFSF14O43557 240 aa6.84□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 SLC37A4O43826 429 aa6.84□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 DKK1O94907 266 aa6.84□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 FAM107AO95990 144 aa6.84□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 BMP6P22004 513 aa6.84□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 GLRA2P23416 452 aa6.84□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
HDAC6-210ENST00000441703 LSP1P33241 339 aa6.84□□□□□ -1.31
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