RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 GORASP1Q9BQQ3 440 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 EDEM3Q9BZQ6 932 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 TRIM5Q9C035 493 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC6A17Q9H1V8 727 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC6A15Q9H2J7 730 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 GRPEL1Q9HAV7 217 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 SUFUQ9UMX1 484 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 NCAPD3P42695 1498 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 CDHR4A6H8M9 788 aa5.1□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 H2AFB1P0C5Y9 115 aa5.1□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 H2AFB2P0C5Z0 115 aa5.1□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 SCG2P13521 617 aa5.1□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 PRKCHP24723 683 aa5.1□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 NFKBIAP25963 317 aa5.1□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 MC3RP41968 323 aa5.1□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 DPP6P42658 865 aa5.1□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 ADCY7P51828 1080 aa5.1□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 DGKEP52429 567 aa5.1□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 DENND1BQ6P3S1 775 aa5.1□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 LAYNQ6UX15 382 aa5.1□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa5.1□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa5.1□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM47EQ6ZV65 393 aa5.1□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 ZFPM1Q8IX07 1006 aa5.1□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 SPARTQ8N0X7 666 aa5.1□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 ANKRD53Q8N9V6 530 aa5.1□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 KCTD6Q8NC69 237 aa5.1□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 TBC1D15Q8TC07 691 aa5.1□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 FNIP1Q8TF40 1166 aa5.1□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 SCFD2Q8WU76 684 aa5.1□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 PPP2R3CQ969Q6 453 aa5.1□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 JAKMIP2Q96AA8 810 aa5.1□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 HIC2Q96JB3 615 aa5.1□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 SMOQ99835 787 aa5.1□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 MECRQ9BV79 373 aa5.1□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP5.1□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 RABEP2Q9H5N1 569 aa5.1□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 DBNDD1Q9H9R9 158 aa5.1□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 TPSG1Q9NRR2 321 aa5.1□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa5.1□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 ETAA1Q9NY74 926 aa5.1□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 NCDNQ9UBB6 729 aa5.1□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 VPS51Q9UID3 782 aa5.1□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC38A8A6NNN8 435 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 BTBD11A6QL63 1104 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 B5MCH6 92 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM232C9JQI7 657 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 HRKO00198 91 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 UBE2CO00762 179 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 PRNPP04156 253 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 TUBB4AP04350 444 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 WEE2P0C1S8 567 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 TNNT1P13805 278 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 ATP6V1B1P15313 513 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 KCNA3P22001 575 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 BSGP35613 385 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 GPD2P43304 727 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 PXNP49023 591 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 MMP14P50281 582 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 PRKAG1P54619 331 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 NPEPPSP55786 919 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 LOXL3P58215 753 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 LILRA4P59901 499 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 TDGQ13569 410 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 C1orf141Q5JVX7 400 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 DEPDC1Q5TB30 811 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 MSANTD2Q6P1R3 559 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 MFSD6Q6ZSS7 791 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEFF1Q8IYR6 380 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 AVL9Q8NBF6 648 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 DNAJB14Q8TBM8 379 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 NOX5Q96PH1 765 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa5.09□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.8 ms