RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438888.5

PRAME-208, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene PRAME, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-208ENST00000438888 SEC13P55735 322 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 EML3Q32P44 896 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 CFAP221Q4G0U5 840 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 TCEAL6Q6IPX3 200 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 SPOPLQ6IQ16 392 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 C4orf50Q6ZRC1 276 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 ARHGEF19Q8IW93 802 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 ATP2A3Q93084 1043 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 TCEAL3Q969E4 200 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 EXOC4Q96A65 974 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 FAM81BQ96LP2 452 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 MYRFLQ96LU7 910 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 PPP1R9BQ96SB3 815 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 XYLT2Q9H1B5 865 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 LINC00597Q9H2U6 94 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 VRTNQ9H8Y1 702 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 CAPN11Q9UMQ6 739 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 INVSQ9Y283 1065 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 FHOD1Q9Y613 1164 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 GABRDO14764 452 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 APBB3O95704 486 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 ABL1P00519 1130 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 HDCP19113 662 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 ANXA13P27216 316 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 CASP14P31944 242 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 GBP1P32455 592 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 RAP1GAPP47736 663 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 USP46P62068 366 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 GCNT1Q02742 428 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 DMC1Q14565 340 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 FBXO43Q4G163 708 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 ZNF667Q5HYK9 610 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 MDH1BQ5I0G3 518 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 GJB7Q6PEY0 223 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 RRAGAQ7L523 313 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 TTC30AQ86WT1 665 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 PPM1KQ8N3J5 372 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 CAMKK1Q8N5S9 505 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 CPLX3Q8WVH0 158 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 TATDN2Q93075 761 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 ELMO3Q96BJ8 720 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP13.15□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 LOXL4Q96JB6 756 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 TPSD1Q9BZJ3 242 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 NIF3L1Q9GZT8 377 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 NLRC4Q9NPP4 1024 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 CRTAC1Q9NQ79 661 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 DNAJC12Q9UKB3 198 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 CDH9Q9ULB4 789 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 ATG2BQ96BY7 2078 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 OBSL1O75147 1896 aa13.14□□□□□ -0.31
PRAME-208ENST00000438888 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa13.14□□□□□ -0.31
PRAME-208ENST00000438888 ANTXRLA6NF34 631 aa13.14□□□□□ -0.31
PRAME-208ENST00000438888 SOBPA7XYQ1 873 aa13.14□□□□□ -0.31
PRAME-208ENST00000438888 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
PRAME-208ENST00000438888 MFAP3LO75121 409 aa13.14□□□□□ -0.31
PRAME-208ENST00000438888 PTMAP06454 111 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
PRAME-208ENST00000438888 ZNF806P0C7X5 589 aa13.14□□□□□ -0.31
PRAME-208ENST00000438888 P4HA1P13674 534 aa13.14□□□□□ -0.31
PRAME-208ENST00000438888 MAGEA11P43364 429 aa13.14□□□□□ -0.31
PRAME-208ENST00000438888 DGKEP52429 567 aa13.14□□□□□ -0.31
PRAME-208ENST00000438888 MFAP3P55082 362 aa13.14□□□□□ -0.31
PRAME-208ENST00000438888 GSDMDP57764 484 aa13.14□□□□□ -0.31
PRAME-208ENST00000438888 ZBED6P86452 979 aa13.14□□□□□ -0.31
PRAME-208ENST00000438888 CREB5Q02930 508 aa13.14□□□□□ -0.31
PRAME-208ENST00000438888 RAPGEF1Q13905 1077 aa13.14□□□□□ -0.31
PRAME-208ENST00000438888 ELF2Q15723 593 aa13.14□□□□□ -0.31
PRAME-208ENST00000438888 ST3GAL2Q16842 350 aa13.14□□□□□ -0.31
PRAME-208ENST00000438888 WDR72Q3MJ13 1102 aa13.14□□□□□ -0.31
PRAME-208ENST00000438888 PLK5Q496M5 336 aa13.14□□□□□ -0.31
PRAME-208ENST00000438888 C2orf27AQ580R0 203 aa13.14□□□□□ -0.31
PRAME-208ENST00000438888 STPG1Q5TH74 334 aa13.14□□□□□ -0.31
PRAME-208ENST00000438888 FAM171BQ6P995 826 aa13.14□□□□□ -0.31
PRAME-208ENST00000438888 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa13.14□□□□□ -0.31
PRAME-208ENST00000438888 CNGA4Q8IV77 575 aa13.14□□□□□ -0.31
PRAME-208ENST00000438888 TSTD1Q8NFU3 115 aa13.14□□□□□ -0.31
PRAME-208ENST00000438888 SPATA18Q8TC71 538 aa13.14□□□□□ -0.31
PRAME-208ENST00000438888 BAP1Q92560 729 aa13.14□□□□□ -0.31
PRAME-208ENST00000438888 ACDQ96AP0 544 aa13.14□□□□□ -0.31
PRAME-208ENST00000438888 FAXDC2Q96IV6 333 aa13.14□□□□□ -0.31
PRAME-208ENST00000438888 SPAG5Q96R06 1193 aa13.14□□□□□ -0.31
PRAME-208ENST00000438888 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
PRAME-208ENST00000438888 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
PRAME-208ENST00000438888 STK33Q9BYT3 514 aa13.14□□□□□ -0.31
PRAME-208ENST00000438888 SMPD4Q9NXE4 827 aa13.14□□□□□ -0.31
PRAME-208ENST00000438888 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa13.14□□□□□ -0.31
PRAME-208ENST00000438888 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
PRAME-208ENST00000438888 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms