RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431413.5

HERC3-206, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 761 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-206ENST00000431413 DUSP16Q9BY84 665 aa15.99■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 RAB20Q9NX57 234 aa15.99■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 CYP26A1O43174 497 aa15.98■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 RALAP11233 206 aa15.98■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 PLA2G4AP47712 749 aa15.98■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 ZNF394Q53GI3 561 aa15.98■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 TCERG1LQ5VWI1 586 aa15.98■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 KLHDC10Q6PID8 442 aa15.98■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 C12orf40Q86WS4 652 aa15.98■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 TTC30AQ86WT1 665 aa15.98■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 ALLCQ8N6M5 410 aa15.98■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 IL17RCQ8NAC3 791 aa15.98■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 WHAMMQ8TF30 809 aa15.98■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 TPSD1Q9BZJ3 242 aa15.98■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 WDR35Q9P2L0 1181 aa15.98■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 DNMT3LQ9UJW3 386 aa15.98■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 HHLA1C9JL84 531 aa15.97■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 GDF9O60383 454 aa15.97■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 TULP3O75386 442 aa15.97■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 TBX18O95935 607 aa15.97■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 RARGP13631 454 aa15.97■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 PRCPP42785 496 aa15.97■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 KIF11P52732 1056 aa15.97■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 LIMK1P53667 647 aa15.97■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 CREB5Q02930 508 aa15.97■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 STIM1Q13586 685 aa15.97■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 COBLL1Q53SF7 1204 aa15.97■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 PLA2G2CQ5R387 149 aa15.97■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 C10orf120Q5SQS8 335 aa15.97■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa15.97■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa15.97■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 NAT16Q8N8M0 369 aa15.97■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 SMARCE1Q969G3 411 aa15.97■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 EEF2KMTQ96G04 330 aa15.97■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 TMEM176AQ96HP8 235 aa15.97■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 SPACA7Q96KW9 195 aa15.97■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 CISHQ9NSE2 258 aa15.97■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP15.97■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP15.97■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 NAGPAQ9UK23 515 aa15.97■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 SDK1Q7Z5N4 2213 aa15.96■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 A0A1W2PQH9 124 aa15.96■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 DCLK1O15075 740 aa15.96■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 LRRC63Q05C16 580 aa15.96■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 CCDC6Q16204 474 aa15.96■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 C10orf76Q5T2E6 689 aa15.96■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 GRAMD4Q6IC98 578 aa15.96■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 CCDC186Q7Z3E2 898 aa15.96■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 TMEM25Q86YD3 366 aa15.96■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 ARHGAP18Q8N392 663 aa15.96■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 ZNF276Q8N554 614 aa15.96■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 MDGA1Q8NFP4 955 aa15.96■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 SEMA4DQ92854 862 aa15.96■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 TIGD1Q96MW7 591 aa15.96■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 BBS2Q9BXC9 721 aa15.96■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 UBXN6Q9BZV1 441 aa15.96■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 CLIC5Q9NZA1 410 aa15.96■□□□□ 0.15
HERC3-206ENST00000431413 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa15.95■□□□□ 0.14
HERC3-206ENST00000431413 SPAG17Q6Q759 2223 aa15.95■□□□□ 0.14
HERC3-206ENST00000431413 NCOR2Q9Y618 2525 aa15.95■□□□□ 0.14
HERC3-206ENST00000431413 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
HERC3-206ENST00000431413 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa15.95■□□□□ 0.14
HERC3-206ENST00000431413 SGK1O00141 431 aa15.95■□□□□ 0.14
HERC3-206ENST00000431413 MAP3K13O43283 966 aa15.95■□□□□ 0.14
HERC3-206ENST00000431413 CAVIN2O95810 425 aa15.95■□□□□ 0.14
HERC3-206ENST00000431413 PPP1R2P41236 205 aa15.95■□□□□ 0.14
HERC3-206ENST00000431413 PGFP49763 221 aa15.95■□□□□ 0.14
HERC3-206ENST00000431413 COG7P83436 770 aa15.95■□□□□ 0.14
HERC3-206ENST00000431413 MESP2Q0VG99 397 aa15.95■□□□□ 0.14
HERC3-206ENST00000431413 PPM1JQ5JR12 505 aa15.95■□□□□ 0.14
HERC3-206ENST00000431413 EMC10Q5UCC4 262 aa15.95■□□□□ 0.14
HERC3-206ENST00000431413 PMS2CLQ68D20 193 aa15.95■□□□□ 0.14
HERC3-206ENST00000431413 SDE2Q6IQ49 451 aa15.95■□□□□ 0.14
HERC3-206ENST00000431413 TMEM92Q6UXU6 159 aa15.95■□□□□ 0.14
HERC3-206ENST00000431413 PGBD3Q8N328 593 aa15.95■□□□□ 0.14
HERC3-206ENST00000431413 PHTF2Q8N3S3 785 aa15.95■□□□□ 0.14
HERC3-206ENST00000431413 TERB1Q8NA31 727 aa15.95■□□□□ 0.14
HERC3-206ENST00000431413 NMUR1Q9HB89 426 aa15.95■□□□□ 0.14
HERC3-206ENST00000431413 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
HERC3-206ENST00000431413 OSER1Q9NX31 292 aa15.95■□□□□ 0.14
HERC3-206ENST00000431413 MARK1Q9P0L2 795 aa15.95■□□□□ 0.14
HERC3-206ENST00000431413 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
HERC3-206ENST00000431413 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
HERC3-206ENST00000431413 INVSQ9Y283 1065 aa15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms