RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419253.1

TTC28-AS1-203, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC28-AS1, Length 846 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MTAPQ13126 283 aa13.04□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RAB41Q5JT25 222 aa13.04□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FKBP15Q5T1M5 1219 aa13.04□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MIB1Q86YT6 1006 aa13.04□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa13.04□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KCTD13Q8WZ19 329 aa13.04□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TFAP2BQ92481 460 aa13.04□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CD101Q93033 1021 aa13.04□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CNGB3Q9NQW8 809 aa13.04□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ST7Q9NRC1 585 aa13.04□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NUDT5Q9UKK9 219 aa13.04□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CACNA1HO95180 2353 aa13.04□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TULP2O00295 520 aa13.03□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SP9P0CG40 484 aa13.03□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ADH5P11766 374 aa13.03□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CXCL12P48061 93 aa13.03□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PGFP49763 221 aa13.03□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF132P52740 706 aa13.03□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NRLP54845 237 aa13.03□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MYL5Q02045 173 aa13.03□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GAD2Q05329 585 aa13.03□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PTK2Q05397 1052 aa13.03□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-203ENST00000419253 EFEMP1Q12805 493 aa13.03□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FZD5Q13467 585 aa13.03□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DHCR24Q15392 516 aa13.03□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ANO4Q32M45 955 aa13.03□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF528Q3MIS6 628 aa13.03□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FBXO43Q4G163 708 aa13.03□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TMEM196Q5HYL7 178 aa13.03□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PM20D1Q6GTS8 502 aa13.03□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GJB7Q6PEY0 223 aa13.03□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NUDT18Q6ZVK8 323 aa13.03□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SCD5Q86SK9 330 aa13.03□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF687Q8N1G0 1237 aa13.03□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SPEM1Q8N4L4 309 aa13.03□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF276Q8N554 614 aa13.03□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HSFY1Q96LI6 401 aa13.03□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DCLK3Q9C098 648 aa13.03□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-203ENST00000419253 VPS16Q9H269 839 aa13.03□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PDCL3Q9H2J4 239 aa13.03□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OSER1Q9NX31 292 aa13.03□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TAB2Q9NYJ8 693 aa13.03□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MARCH2Q9P0N8 246 aa13.03□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DNAJC12Q9UKB3 198 aa13.03□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CNTN6Q9UQ52 1028 aa13.03□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF510Q9Y2H8 683 aa13.03□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CEP83Q9Y592 693 aa13.03□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PIK3R2O00459 728 aa13.02□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MDM4O15151 490 aa13.02□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FBXO21O94952 628 aa13.02□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CYP17A1P05093 508 aa13.02□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HMBSP08397 361 aa13.02□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ACADSBP45954 432 aa13.02□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-203ENST00000419253 BPIFB4P59827 614 aa13.02□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TYRO3Q06418 890 aa13.02□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RAPGEF1Q13905 1077 aa13.02□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CCINQ13939 588 aa13.02□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SMYD5Q6GMV2 418 aa13.02□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HTR3DQ70Z44 454 aa13.02□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-203ENST00000419253 BBS7Q8IWZ6 715 aa13.02□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SLC35F5Q8WV83 523 aa13.02□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF606Q8WXB4 792 aa13.02□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ATRIPQ8WXE1 791 aa13.02□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CHFRQ96EP1 664 aa13.02□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ABCC13Q9NSE7 274 aa13.02□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FANCLQ9NW38 375 aa13.02□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SLC12A8A0AV02 714 aa13.01□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SART1O43290 800 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-203ENST00000419253 EGFP01133 1207 aa13.01□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CALCAP01258 141 aa13.01□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-203ENST00000419253 APODP05090 189 aa13.01□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KRT9P35527 623 aa13.01□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NBL1P41271 181 aa13.01□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MRE11P49959 708 aa13.01□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SNX16P57768 344 aa13.01□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-203ENST00000419253 APBA1Q02410 837 aa13.01□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MEA1Q16626 185 aa13.01□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PKDCCQ504Y2 493 aa13.01□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MIIPQ5JXC2 388 aa13.01□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LY6G5CQ5SRR4 150 aa13.01□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-203ENST00000419253 BSPRYQ5W0U4 402 aa13.01□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FSTL4Q6MZW2 842 aa13.01□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PMF1Q6P1K2 205 aa13.01□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RHBDF2Q6PJF5 856 aa13.01□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MAMSTRQ6ZN01 415 aa13.01□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-203ENST00000419253 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SCML4Q8N228 414 aa13.01□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-203ENST00000419253 IRGQQ8WZA9 623 aa13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms