RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418674.1

PTPRC-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 462 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-207ENST00000418674 FAXCQ5TGI0 409 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 MANEALQ5VSG8 457 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 CACHD1Q5VU97 1274 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 TANGO2Q6ICL3 276 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 MRNIPQ6NTE8 343 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 AMIGO2Q86SJ2 522 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 FAM109AQ8N4B1 249 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 STT3BQ8TCJ2 826 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 PPP2R3CQ969Q6 453 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 FKBP10Q96AY3 582 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 GCC1Q96CN9 775 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 PTDSS2Q9BVG9 487 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 ACTRT3Q9BYD9 372 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 UBA5Q9GZZ9 404 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 CXorf36Q9H7Y0 433 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 ZBTB26Q9HCK0 441 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 EHD3Q9NZN3 535 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 DTNAQ9Y4J8 743 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 OR2W5A6NFC9 320 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 VWC2LB2RUY7 222 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 ASNA1O43681 348 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 SH3BP5O60239 455 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 COQ9O75208 318 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 PIAS2O75928 621 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 NXPH3O95157 252 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 RASAL1O95294 804 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 GLP2RO95838 553 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 ELFN1P0C7U0 828 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 NPPBP16860 134 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 MST1P26927 711 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 SLC5A2P31639 672 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 ARL4CP56559 192 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 PROK1P58294 105 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 FOXF2Q12947 444 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 BMPR2Q13873 1038 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 PRKG1Q13976 671 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 RALBP1Q15311 655 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 PTCHD3Q3KNS1 767 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 ALFQ53S48 1182 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 LIN54Q6MZP7 749 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 MZT2AQ6P582 158 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 RASAL3Q86YV0 1011 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 GALNT15Q8N3T1 639 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 DNAJB14Q8TBM8 379 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 HASPINQ8TF76 798 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 TRIM63Q969Q1 353 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 FAM136AQ96C01 138 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 FAM227BQ96M60 508 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 PAGR1Q9BTK6 254 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 KATNAL1Q9BW62 490 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 TRIM5Q9C035 493 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 MAF1Q9H063 256 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 ITM2CQ9NQX7 267 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 PGAP2Q9UHJ9 254 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 CA14Q9ULX7 337 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 HPSEQ9Y251 543 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 PCDH17O14917 1159 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 RGS10O43665 173 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 SRGAP2O75044 1071 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 NTSR2O95665 410 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 EBLN1P0CF75 366 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 ARP10275 920 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
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PTPRC-207ENST00000418674 ITPKBP27987 946 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 CCT8P50990 548 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 PRKAG1P54619 331 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 E2F2Q14209 437 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 TBCCQ15814 346 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 ARHGAP40Q5TG30 622 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 VPS53Q5VIR6 699 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 FCRLBQ6BAA4 426 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 SUMO4Q6EEV6 95 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 RFX8Q6ZV50 586 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 GATAD2AQ86YP4 633 aa3.37□□□□□ -1.87
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