RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000387416.2

MT-TS1-201, Transcript of mitochondrially encoded tRNA serine 1 (UCN), humanhuman

BASIC

Gene MT-TS1, Length 69 nt, Biotype Mt tRNA, Subcellular localisation Exosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-TS1-201ENST00000387416 TTC30AQ86WT1 665 aa8.94□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa8.94□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 TTC16Q8NEE8 873 aa8.94□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 TTC8Q8TAM2 541 aa8.94□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 IRGQQ8WZA9 623 aa8.94□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 NELL1Q92832 810 aa8.94□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 CNGB3Q9NQW8 809 aa8.94□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 ANO10Q9NW15 660 aa8.94□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 SMPD4Q9NXE4 827 aa8.94□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 WDR35Q9P2L0 1181 aa8.94□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 A0A0A0MRY4 1105 aa8.93□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa8.93□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 LMNAP02545 664 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 KRT5P13647 590 aa8.93□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 CHKAP35790 457 aa8.93□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 ACADSBP45954 432 aa8.93□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 BPIFB4P59827 614 aa8.93□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP8.93□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 ZXDBP98169 803 aa8.93□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 E2F5Q15329 346 aa8.93□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 DHCR24Q15392 516 aa8.93□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 DPCR1Q3MIW9 517 aa8.93□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 VWA3BQ502W6 1294 aa8.93□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 PKDCCQ504Y2 493 aa8.93□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 FSTL4Q6MZW2 842 aa8.93□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 RHBDF2Q6PJF5 856 aa8.93□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 RRAGAQ7L523 313 aa8.93□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa8.93□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 SCD5Q86SK9 330 aa8.93□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 CAMKK1Q8N5S9 505 aa8.93□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 ZBTB44Q8NCP5 570 aa8.93□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa8.93□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 RIN3Q8TB24 985 aa8.93□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 KCNV2Q8TDN2 545 aa8.93□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 STK32AQ8WU08 396 aa8.93□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC35F5Q8WV83 523 aa8.93□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 GOLGA1Q92805 767 aa8.93□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 ACDQ96AP0 544 aa8.93□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 MED15Q96RN5 788 aa8.93□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 PNKPQ96T60 521 aa8.93□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa8.93□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 TRIM62Q9BVG3 475 aa8.93□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 NDST4Q9H3R1 872 aa8.93□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 ABCC13Q9NSE7 274 aa8.93□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 APEX2Q9UBZ4 518 aa8.93□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP8.93□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa8.93□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 ATG2BQ96BY7 2078 aa8.92□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 MYOFQ9NZM1 2061 aa8.92□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 GFRA3O60609 400 aa8.92□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 APODP05090 189 aa8.92□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 CYP17A1P05093 508 aa8.92□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 ADH5P11766 374 aa8.92□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 PON1P27169 355 aa8.92□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 GRIA2P42262 883 aa8.92□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 TNFRSF4P43489 277 aa8.92□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 RPL34P49207 117 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF445P59923 1031 aa8.92□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 PTK2Q05397 1052 aa8.92□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 CCDC183Q5T5S1 534 aa8.92□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 ARHGEF19Q8IW93 802 aa8.92□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 UBA3Q8TBC4 463 aa8.92□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 GPT2Q8TD30 523 aa8.92□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 RNF139Q8WU17 664 aa8.92□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 TFAP2BQ92481 460 aa8.92□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 SHC3Q92529 594 aa8.92□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 KREMEN1Q96MU8 473 aa8.92□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 CRACR2AQ9BSW2 395 aa8.92□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 NMUR1Q9HB89 426 aa8.92□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 SPHK2Q9NRA0 654 aa8.92□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM86C1Q9NVL1 165 aa8.92□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 MARCH2Q9P0N8 246 aa8.92□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 DEC1Q9P2X7 70 aa8.92□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 MYO16Q9Y6X6 1858 aa8.91□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 CEP250Q9BV73 2442 aa8.91□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 SDK1Q7Z5N4 2213 aa8.91□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 PRR23AA6NEV1 266 aa8.91□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 KCNJ18B7U540 433 aa8.91□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 M0QYV0 167 aa8.91□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 LILRB5O75023 590 aa8.91□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 TBX18O95935 607 aa8.91□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 TDGF1P13385 188 aa8.91□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC9A1P19634 815 aa8.91□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms