RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 ICAM3P32942 547 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 GSK3AP49840 483 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 TMF1P82094 1093 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 PTSQ03393 145 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 ADCY2Q08462 1091 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 ITGA7Q13683 1181 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 CLCA4Q14CN2 919 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 MORF4L2Q15014 288 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 DGKDQ16760 1214 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 ERMARDQ5T6L9 678 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 TRAT1Q6PIZ9 186 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 SASS6Q6UVJ0 657 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 BEND5Q7L4P6 421 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 UBASH3BQ8TF42 649 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 HDAC10Q969S8 669 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 C1orf74Q96LT6 269 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 RMDN2Q96LZ7 410 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 NPAS1Q99742 590 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 CLSTN3Q9BQT9 956 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 HGH1Q9BTY7 390 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 VPS16Q9H269 839 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 LCTP09848 1927 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 TSPY2A6NKD2 308 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 K7EPI3 171 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 VILLO15195 856 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 GCNT3O95395 438 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 TSPY3P0CV98 308 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 TSPY8P0CW00 308 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 PAMP19021 973 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 KLRC1P26715 233 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 USP8P40818 1118 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 CASP3P42574 277 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 KCNC1P48547 511 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 BCAR1P56945 870 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 TSPY1Q01534 308 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 LRRC74AQ0VAA2 488 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 NAA25Q14CX7 972 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 TCP11X2Q5H9J9 407 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 MTFR2Q6P444 385 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 ZER1Q7Z7L7 766 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 CNTN4Q8IWV2 1026 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 SPATA18Q8TC71 538 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 UCMAQ8WVF2 138 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 MR1Q95460 341 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 PIDD1Q9HB75 910 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 SLC22A11Q9NSA0 550 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 DNAJB9Q9UBS3 223 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 LAMP5Q9UJQ1 280 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 PCDHGB4Q9UN71 923 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 NUDCQ9Y266 331 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 BTBD3Q9Y2F9 522 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 NEU2Q9Y3R4 380 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 SIP14410 1827 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 PKD1P98161 4303 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 A0A1W2PQ27 194 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 A0A1W2PQ64 194 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 A0A1W2PQC6 194 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 A0A1W2PQD8 194 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC188H7C350 402 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 KCNK3O14649 394 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 N4BP3O15049 544 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 ENTPD3O75355 529 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 DNAJB5O75953 348 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 BMP4P12644 408 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 SREBF1P36956 1147 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 MCM2P49736 904 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 HTD2P86397 168 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 MEP1BQ16820 701 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 MST1LQ2TV78 715 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 C19orf54Q5BKX5 351 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 TRAPPC3LQ5T215 181 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 OXR1Q8N573 874 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 GALNT6Q8NCL4 622 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 PIGSQ96S52 555 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 PAAF1Q9BRP4 392 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 MYL10Q9BUA6 226 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 MXD3Q9BW11 206 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 C1orf43Q9BWL3 253 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 AMNQ9BXJ7 453 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa2.7□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms