RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATICP31939 592 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 HTR7P34969 479 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 COPAP53621 1224 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 GPS1Q13098 491 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 C4orf46Q504U0 113 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM63BQ5T3F8 832 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 CRTC1Q6UUV9 634 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 NEK8Q86SG6 692 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 P3H2Q8IVL5 708 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 LINC01465Q8N7H1 131 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 RNF152Q8N8N0 203 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 PNPLA1Q8N8W4 532 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 C8orf58Q8NAV2 365 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCDC150Q8NCX0 1101 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCDC17Q96LX7 622 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 SH2D3AQ9BRG2 576 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 COLEC11Q9BWP8 271 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 PCGF6Q9BYE7 350 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAGEB5Q9BZ81 275 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 AS3MTQ9HBK9 375 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 STARD7Q9NQZ5 370 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 MYO1AQ9UBC5 1043 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 COL15A1P39059 1388 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 AREL1O15033 823 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRC1O43663 620 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 RNF8O76064 485 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 WDR47O94967 919 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM225BP0DP42 221 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 IDEP14735 1019 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 KELP23276 732 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 LMO1P25800 156 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 MST1P26927 711 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 DEUP1Q05D60 604 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 KCNB1Q14721 858 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 LONRF1Q17RB8 773 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 MTX3Q5HYI7 312 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAXCQ5TGI0 409 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF626Q68DY1 528 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC18B1Q6NT16 456 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 USP17L6PQ6QN14 398 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 DCDC5Q6ZRR9 648 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 C11orf96Q7Z7L8 435 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 GALNT16Q8N428 558 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 USP29Q9HBJ7 922 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZBTB26Q9HCK0 441 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 PDGFCQ9NRA1 345 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 ASAP1Q9ULH1 1129 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF804BA4D1E1 1349 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANO9A1A5B4 782 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 WDR91A4D1P6 747 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 CA12O43570 354 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 COQ9O75208 318 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 MYL1P05976 194 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 TNFSF4P23510 183 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARHGAP25P42331 645 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 TM4SF4P48230 202 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 TBX4P57082 545 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 CFHR3Q02985 330 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 PMS2P11Q13670 270 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 MFSD13AQ14CX5 517 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 AWAT1Q58HT5 328 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 MRNIPQ6NTE8 343 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 VSTM1Q6UX27 236 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 CNGA4Q8IV77 575 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCDC28AQ8IWP9 274 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR2C3Q8N628 320 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP3.67□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 ABHD5Q8WTS1 349 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM118BQ9BPY3 351 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 EFHD1Q9BUP0 239 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC29A3Q9BZD2 475 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 GJB4Q9NTQ9 266 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMOD4Q9NZQ9 345 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 KLHL13Q9P2N7 655 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 WDR17Q8IZU2 1322 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 RASA4BC9J798 803 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 H3BNC9 293 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 RASA4O43374 803 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 KCNQ3O43525 872 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 NDST3O95803 873 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARP10275 920 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC5A2P31639 672 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 GPC5P78333 572 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCDC15Q0P6D6 951 aa3.66□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61 ms