RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 LTFP02788 710 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 MMP8P22894 467 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 ACADSBP45954 432 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 PPP3CCP48454 512 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 ARID5BQ14865 1188 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 C10orf120Q5SQS8 335 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 IER5LQ5T953 404 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 SYPL2Q5VXT5 272 aa9.53□□□□□ -0.88
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PDE4D-201ENST00000309641 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 FAM149B1Q96BN6 582 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 ASIC4Q96FT7 647 aa9.53□□□□□ -0.88
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PDE4D-201ENST00000309641 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
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PDE4D-201ENST00000309641 ZFP14Q9HCL3 533 aa9.53□□□□□ -0.88
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PDE4D-201ENST00000309641 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa9.53□□□□□ -0.88
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PDE4D-201ENST00000309641 FAM228BP0C875 321 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
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PDE4D-201ENST00000309641 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP9.53□□□□□ -0.88
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PDE4D-201ENST00000309641 GABRB2P47870 512 aa9.53□□□□□ -0.88
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PDE4D-201ENST00000309641 EFEMP1Q12805 493 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 TRIM14Q14142 442 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 MIB1Q86YT6 1006 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 SCML4Q8N228 414 aa9.53□□□□□ -0.88
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PDE4D-201ENST00000309641 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 C18orf8Q96DM3 657 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 IQCDQ96DY2 449 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 ADAM33Q9BZ11 813 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 SYNCQ9H7C4 482 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 CLIC5Q9NZA1 410 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 COL4A3Q01955 1670 aa9.52□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
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PDE4D-201ENST00000309641 MSI1O43347 362 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
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PDE4D-201ENST00000309641 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
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PDE4D-201ENST00000309641 TRNP1Q6NT89 227 aa9.52□□□□□ -0.89
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PDE4D-201ENST00000309641 MON1BQ7L1V2 547 aa9.52□□□□□ -0.89
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PDE4D-201ENST00000309641 NOX5Q96PH1 765 aa9.52□□□□□ -0.89
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PDE4D-201ENST00000309641 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
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PDE4D-201ENST00000309641 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa9.52□□□□□ -0.89
PDE4D-201ENST00000309641 WDFY4Q6ZS81 3184 aa9.52□□□□□ -0.89
PDE4D-201ENST00000309641 LEFTY2O00292 366 aa9.51□□□□□ -0.89
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PDE4D-201ENST00000309641 HMBSP08397 361 aa9.51□□□□□ -0.89
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PDE4D-201ENST00000309641 DEFB106AQ8N104 65 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-201ENST00000309641 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-201ENST00000309641 EMC1Q8N766 993 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-201ENST00000309641 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-201ENST00000309641 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-201ENST00000309641 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-201ENST00000309641 LINC00597Q9H2U6 94 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-201ENST00000309641 ABCC13Q9NSE7 274 aa9.51□□□□□ -0.89
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