RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000280377.9

USP15-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP15, Length 4,748 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-201ENST00000280377 TAZQ16635 292 aa5.9□□□□□ -1.46
USP15-201ENST00000280377 LRRC31Q6UY01 552 aa5.9□□□□□ -1.46
USP15-201ENST00000280377 RNF180Q86T96 592 aa5.9□□□□□ -1.46
USP15-201ENST00000280377 TP53INP2Q8IXH6 220 aa5.9□□□□□ -1.46
USP15-201ENST00000280377 PQLC3Q8N755 202 aa5.9□□□□□ -1.46
USP15-201ENST00000280377 CCDC89Q8N998 374 aa5.9□□□□□ -1.46
USP15-201ENST00000280377 GRK7Q8WTQ7 553 aa5.9□□□□□ -1.46
USP15-201ENST00000280377 TNIP3Q96KP6 325 aa5.9□□□□□ -1.46
USP15-201ENST00000280377 GLT1D1Q96MS3 346 aa5.9□□□□□ -1.46
USP15-201ENST00000280377 SMOQ99835 787 aa5.9□□□□□ -1.46
USP15-201ENST00000280377 TRAIPQ9BWF2 469 aa5.9□□□□□ -1.46
USP15-201ENST00000280377 DUSP16Q9BY84 665 aa5.9□□□□□ -1.46
USP15-201ENST00000280377 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
USP15-201ENST00000280377 KRT82Q9NSB4 513 aa5.9□□□□□ -1.46
USP15-201ENST00000280377 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
USP15-201ENST00000280377 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
USP15-201ENST00000280377 VCANP13611 3396 aa5.9□□□□□ -1.46
USP15-201ENST00000280377 WDR91A4D1P6 747 aa5.9□□□□□ -1.46
USP15-201ENST00000280377 YJEFN3A6XGL0 299 aa5.9□□□□□ -1.46
USP15-201ENST00000280377 E7ENQ6 273 aa5.9□□□□□ -1.46
USP15-201ENST00000280377 UPP2O95045 317 aa5.9□□□□□ -1.46
USP15-201ENST00000280377 FYNP06241 537 aa5.9□□□□□ -1.46
USP15-201ENST00000280377 OR4Q2P0C623 313 aa5.9□□□□□ -1.46
USP15-201ENST00000280377 WARSP23381 471 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
USP15-201ENST00000280377 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
USP15-201ENST00000280377 COPS2P61201 443 aa5.9□□□□□ -1.46
USP15-201ENST00000280377 GNGT1P63211 74 aa5.9□□□□□ -1.46
USP15-201ENST00000280377 IRX4P78413 519 aa5.9□□□□□ -1.46
USP15-201ENST00000280377 GBE1Q04446 702 aa5.9□□□□□ -1.46
USP15-201ENST00000280377 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
USP15-201ENST00000280377 DSC3Q14574 896 aa5.9□□□□□ -1.46
USP15-201ENST00000280377 EML3Q32P44 896 aa5.9□□□□□ -1.46
USP15-201ENST00000280377 TOP6BLQ8N6T0 577 aa5.9□□□□□ -1.46
USP15-201ENST00000280377 PLD5Q8N7P1 536 aa5.9□□□□□ -1.46
USP15-201ENST00000280377 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
USP15-201ENST00000280377 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
USP15-201ENST00000280377 LINC01599Q8WXQ3 324 aa5.9□□□□□ -1.46
USP15-201ENST00000280377 BHMTQ93088 406 aa5.9□□□□□ -1.46
USP15-201ENST00000280377 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP5.9□□□□□ -1.463e-8■■■□□ 16.3
USP15-201ENST00000280377 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
USP15-201ENST00000280377 CAPS2Q9BXY5 557 aa5.9□□□□□ -1.46
USP15-201ENST00000280377 CEP41Q9BYV8 373 aa5.9□□□□□ -1.46
USP15-201ENST00000280377 PCDH18Q9HCL0 1135 aa5.9□□□□□ -1.46
USP15-201ENST00000280377 ANLNQ9NQW6 1124 aa5.9□□□□□ -1.46
USP15-201ENST00000280377 MTMR10Q9NXD2 777 aa5.9□□□□□ -1.46
USP15-201ENST00000280377 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa5.9□□□□□ -1.46
USP15-201ENST00000280377 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa5.9□□□□□ -1.46
USP15-201ENST00000280377 ZNF623O75123 536 aa5.9□□□□□ -1.47
USP15-201ENST00000280377 DDHD2O94830 711 aa5.9□□□□□ -1.47
USP15-201ENST00000280377 USP17L7P0C7H9 530 aa5.9□□□□□ -1.47
USP15-201ENST00000280377 NPR3P17342 541 aa5.9□□□□□ -1.47
USP15-201ENST00000280377 RPL22P35268 128 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
USP15-201ENST00000280377 MTMR3Q13615 1198 aa5.9□□□□□ -1.47
USP15-201ENST00000280377 MSS51Q4VC12 460 aa5.9□□□□□ -1.47
USP15-201ENST00000280377 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
USP15-201ENST00000280377 TRAF7Q6Q0C0 670 aa5.9□□□□□ -1.47
USP15-201ENST00000280377 SLC26A9Q7LBE3 791 aa5.9□□□□□ -1.47
USP15-201ENST00000280377 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
USP15-201ENST00000280377 RNF157Q96PX1 679 aa5.9□□□□□ -1.47
USP15-201ENST00000280377 SYT15Q9BQS2 421 aa5.9□□□□□ -1.47
USP15-201ENST00000280377 CHST12Q9NRB3 414 aa5.9□□□□□ -1.47
USP15-201ENST00000280377 HOMER3Q9NSC5 361 aa5.9□□□□□ -1.47
USP15-201ENST00000280377 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa5.9□□□□□ -1.47
USP15-201ENST00000280377 AP1G2O75843 785 aa5.9□□□□□ -1.47
USP15-201ENST00000280377 SAT1P21673 171 aa5.9□□□□□ -1.47
USP15-201ENST00000280377 BDNFP23560 247 aa5.9□□□□□ -1.47
USP15-201ENST00000280377 PGFP49763 221 aa5.9□□□□□ -1.47
USP15-201ENST00000280377 TKTL1P51854 596 aa5.9□□□□□ -1.47
USP15-201ENST00000280377 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
USP15-201ENST00000280377 NKX3-2P78367 333 aa5.9□□□□□ -1.47
USP15-201ENST00000280377 NME3Q13232 169 aa5.9□□□□□ -1.47
USP15-201ENST00000280377 KRT81Q14533 505 aa5.9□□□□□ -1.47
USP15-201ENST00000280377 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
USP15-201ENST00000280377 LRIG3Q6UXM1 1119 aa5.9□□□□□ -1.47
USP15-201ENST00000280377 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
USP15-201ENST00000280377 ANKMY2Q8IV38 441 aa5.9□□□□□ -1.47
USP15-201ENST00000280377 CCDC13Q8IYE1 715 aa5.9□□□□□ -1.47
USP15-201ENST00000280377 CYP4X1Q8N118 509 aa5.9□□□□□ -1.47
USP15-201ENST00000280377 OR10T2Q8NGX3 314 aa5.9□□□□□ -1.47
USP15-201ENST00000280377 STK32AQ8WU08 396 aa5.9□□□□□ -1.47
USP15-201ENST00000280377 EDEM1Q92611 657 aa5.9□□□□□ -1.47
USP15-201ENST00000280377 RUNDC3BQ96NL0 473 aa5.9□□□□□ -1.47
USP15-201ENST00000280377 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
USP15-201ENST00000280377 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
USP15-201ENST00000280377 ULBP1Q9BZM6 244 aa5.9□□□□□ -1.47
USP15-201ENST00000280377 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
USP15-201ENST00000280377 PSD3Q9NYI0 1048 aa5.9□□□□□ -1.47
USP15-201ENST00000280377 NINJ2Q9NZG7 142 aa5.9□□□□□ -1.47
USP15-201ENST00000280377 SEPT10Q9P0V9 454 aa5.9□□□□□ -1.47
USP15-201ENST00000280377 DNAJB4Q9UDY4 337 aa5.9□□□□□ -1.47
USP15-201ENST00000280377 GIT1Q9Y2X7 761 aa5.9□□□□□ -1.47
USP15-201ENST00000280377 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
USP15-201ENST00000280377 A0A1W2PQY0 241 aa5.89□□□□□ -1.47
USP15-201ENST00000280377 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa5.89□□□□□ -1.47
USP15-201ENST00000280377 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
USP15-201ENST00000280377 TTC4O95801 387 aa5.89□□□□□ -1.47
USP15-201ENST00000280377 APOC2P02655 101 aa5.89□□□□□ -1.47
USP15-201ENST00000280377 ITGAVP06756 1048 aa5.89□□□□□ -1.47
USP15-201ENST00000280377 NUDT17P0C025 328 aa5.89□□□□□ -1.47
USP15-201ENST00000280377 GOT1P17174 413 aa5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms