RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000252771.11

FCHO1-201, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene FCHO1, Length 3,118 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-201ENST00000252771 TTC25Q96NG3 672 aa17.72■□□□□ 0.43
FCHO1-201ENST00000252771 ZNF670Q9BS34 389 aa17.72■□□□□ 0.43
FCHO1-201ENST00000252771 CHST12Q9NRB3 414 aa17.72■□□□□ 0.43
FCHO1-201ENST00000252771 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
FCHO1-201ENST00000252771 APOL1O14791 398 aa17.72■□□□□ 0.43
FCHO1-201ENST00000252771 THP07101 528 aa17.72■□□□□ 0.43
FCHO1-201ENST00000252771 MDH1BQ5I0G3 518 aa17.72■□□□□ 0.43
FCHO1-201ENST00000252771 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
FCHO1-201ENST00000252771 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
FCHO1-201ENST00000252771 VSIG1Q86XK7 387 aa17.72■□□□□ 0.43
FCHO1-201ENST00000252771 TMEM30AQ9NV96 361 aa17.72■□□□□ 0.43
FCHO1-201ENST00000252771 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
FCHO1-201ENST00000252771 TMEM120BA0PK00 339 aa17.72■□□□□ 0.43
FCHO1-201ENST00000252771 NPR3P17342 541 aa17.72■□□□□ 0.43
FCHO1-201ENST00000252771 DRD4P21917 467 aa17.72■□□□□ 0.43
FCHO1-201ENST00000252771 SCNN1GP51170 649 aa17.72■□□□□ 0.43
FCHO1-201ENST00000252771 BCAR1P56945 870 aa17.72■□□□□ 0.43
FCHO1-201ENST00000252771 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
FCHO1-201ENST00000252771 SYCP2LQ5T4T6 812 aa17.72■□□□□ 0.43
FCHO1-201ENST00000252771 RPAINQ86UA6 219 aa17.72■□□□□ 0.43
FCHO1-201ENST00000252771 DEFB106AQ8N104 65 aa17.72■□□□□ 0.43
FCHO1-201ENST00000252771 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa17.72■□□□□ 0.43
FCHO1-201ENST00000252771 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
FCHO1-201ENST00000252771 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP17.72■□□□□ 0.43
FCHO1-201ENST00000252771 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
FCHO1-201ENST00000252771 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
FCHO1-201ENST00000252771 FAM169AQ9Y6X4 670 aa17.72■□□□□ 0.43
FCHO1-201ENST00000252771 C5orf60A6NFR6 353 aa17.71■□□□□ 0.43
FCHO1-201ENST00000252771 E7ESA3 106 aa17.71■□□□□ 0.43
FCHO1-201ENST00000252771 H7C0C1 242 aa17.71■□□□□ 0.43
FCHO1-201ENST00000252771 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
FCHO1-201ENST00000252771 TGM2P21980 687 aa17.71■□□□□ 0.43
FCHO1-201ENST00000252771 CYP2F1P24903 491 aa17.71■□□□□ 0.43
FCHO1-201ENST00000252771 ATP5OP48047 213 aa17.71■□□□□ 0.43
FCHO1-201ENST00000252771 BASP1P80723 227 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
FCHO1-201ENST00000252771 PYROXD2Q8N2H3 581 aa17.71■□□□□ 0.43
FCHO1-201ENST00000252771 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
FCHO1-201ENST00000252771 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
FCHO1-201ENST00000252771 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa17.71■□□□□ 0.43
FCHO1-201ENST00000252771 SPC25Q9HBM1 224 aa17.71■□□□□ 0.43
FCHO1-201ENST00000252771 SLC38A7Q9NVC3 462 aa17.71■□□□□ 0.43
FCHO1-201ENST00000252771 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
FCHO1-201ENST00000252771 PADI3Q9ULW8 664 aa17.71■□□□□ 0.43
FCHO1-201ENST00000252771 AP4E1Q9UPM8 1137 aa17.71■□□□□ 0.43
FCHO1-201ENST00000252771 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa17.71■□□□□ 0.43
FCHO1-201ENST00000252771 MYO1CO00159 1063 aa17.71■□□□□ 0.43
FCHO1-201ENST00000252771 RBL1P28749 1068 aa17.71■□□□□ 0.43
FCHO1-201ENST00000252771 CD52P31358 61 aa17.71■□□□□ 0.43
FCHO1-201ENST00000252771 THPOP40225 353 aa17.71■□□□□ 0.43
FCHO1-201ENST00000252771 MATKP42679 507 aa17.71■□□□□ 0.43
FCHO1-201ENST00000252771 LRRC14Q15048 493 aa17.71■□□□□ 0.43
FCHO1-201ENST00000252771 CHMP6Q96FZ7 201 aa17.71■□□□□ 0.43
FCHO1-201ENST00000252771 CCDC77Q9BR77 488 aa17.71■□□□□ 0.43
FCHO1-201ENST00000252771 VPS37BQ9H9H4 285 aa17.71■□□□□ 0.43
FCHO1-201ENST00000252771 TSC2P49815 1807 aa17.71■□□□□ 0.43
FCHO1-201ENST00000252771 EFHC1Q5JVL4 640 aa17.7■□□□□ 0.42
FCHO1-201ENST00000252771 KLHDC9Q8NEP7 349 aa17.7■□□□□ 0.42
FCHO1-201ENST00000252771 RTP4Q96DX8 246 aa17.7■□□□□ 0.42
FCHO1-201ENST00000252771 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa17.7■□□□□ 0.42
FCHO1-201ENST00000252771 CASTOR2A6NHX0 329 aa17.7■□□□□ 0.42
FCHO1-201ENST00000252771 NDC80O14777 642 aa17.7■□□□□ 0.42
FCHO1-201ENST00000252771 ELNP15502 786 aa17.7■□□□□ 0.42
FCHO1-201ENST00000252771 ATP5DP30049 168 aa17.7■□□□□ 0.42
FCHO1-201ENST00000252771 SSTR1P30872 391 aa17.7■□□□□ 0.42
FCHO1-201ENST00000252771 CACNA2D1P54289 1103 aa17.7■□□□□ 0.42
FCHO1-201ENST00000252771 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
FCHO1-201ENST00000252771 GBE1Q04446 702 aa17.7■□□□□ 0.42
FCHO1-201ENST00000252771 KCNJ11Q14654 390 aa17.7■□□□□ 0.42
FCHO1-201ENST00000252771 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
FCHO1-201ENST00000252771 CCDC134Q9H6E4 229 aa17.7■□□□□ 0.42
FCHO1-201ENST00000252771 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
FCHO1-201ENST00000252771 MYBPHLA2RUH7 354 aa17.7■□□□□ 0.42
FCHO1-201ENST00000252771 TMEM88BA6NKF7 163 aa17.7■□□□□ 0.42
FCHO1-201ENST00000252771 ZNF487B1APH4 448 aa17.7■□□□□ 0.42
FCHO1-201ENST00000252771 KCNN4O15554 427 aa17.7■□□□□ 0.42
FCHO1-201ENST00000252771 PIAS1O75925 651 aa17.7■□□□□ 0.42
FCHO1-201ENST00000252771 FAM163BP0C2L3 166 aa17.7■□□□□ 0.42
FCHO1-201ENST00000252771 IFNAR2P48551 515 aa17.7■□□□□ 0.42
FCHO1-201ENST00000252771 ARL4CP56559 192 aa17.7■□□□□ 0.42
FCHO1-201ENST00000252771 MAP3K7CLP57077 242 aa17.7■□□□□ 0.42
FCHO1-201ENST00000252771 HFE2Q6ZVN8 426 aa17.7■□□□□ 0.42
FCHO1-201ENST00000252771 STRADAQ7RTN6 431 aa17.7■□□□□ 0.42
FCHO1-201ENST00000252771 BNIPLQ7Z465 357 aa17.7■□□□□ 0.42
FCHO1-201ENST00000252771 FAM131BQ86XD5 332 aa17.7■□□□□ 0.42
FCHO1-201ENST00000252771 IGDCC3Q8IVU1 814 aa17.7■□□□□ 0.42
FCHO1-201ENST00000252771 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
FCHO1-201ENST00000252771 KCTD13Q8WZ19 329 aa17.7■□□□□ 0.42
FCHO1-201ENST00000252771 NT5C3BQ969T7 300 aa17.7■□□□□ 0.42
FCHO1-201ENST00000252771 FAM149B1Q96BN6 582 aa17.7■□□□□ 0.42
FCHO1-201ENST00000252771 NCAPGQ9BPX3 1015 aa17.7■□□□□ 0.42
FCHO1-201ENST00000252771 PHACTR1Q9C0D0 580 aa17.7■□□□□ 0.42
FCHO1-201ENST00000252771 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa17.7■□□□□ 0.42
FCHO1-201ENST00000252771 USP3Q9Y6I4 520 aa17.7■□□□□ 0.42
FCHO1-201ENST00000252771 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa17.69■□□□□ 0.42
FCHO1-201ENST00000252771 TRIM66O15016 1216 aa17.69■□□□□ 0.42
FCHO1-201ENST00000252771 GPR182O15218 404 aa17.69■□□□□ 0.42
FCHO1-201ENST00000252771 GHRP10912 638 aa17.69■□□□□ 0.42
FCHO1-201ENST00000252771 BRAFP15056 766 aa17.69■□□□□ 0.42
FCHO1-201ENST00000252771 UPP1Q16831 310 aa17.69■□□□□ 0.42
FCHO1-201ENST00000252771 SLC25A52Q3SY17 297 aa17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms