RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229270.8

TPI1-201, Transcript of triosephosphate isomerase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TPI1, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPI1-201ENST00000229270 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP27.33■■□□□ 1.974e-11■■■□□ 17.2
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TPI1-201ENST00000229270 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
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TPI1-201ENST00000229270 SIX4Q9UIU6 781 aa27.33■■□□□ 1.97
TPI1-201ENST00000229270 POLIQ9UNA4 740 aa27.33■■□□□ 1.97
TPI1-201ENST00000229270 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP27.33■■□□□ 1.97
TPI1-201ENST00000229270 L3MBTL1Q9Y468 752 aa27.33■■□□□ 1.97
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TPI1-201ENST00000229270 SLC44A1Q8WWI5 657 aa27.32■■□□□ 1.96
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TPI1-201ENST00000229270 ADPGKQ9BRR6 497 aa27.32■■□□□ 1.96
TPI1-201ENST00000229270 CNPY3Q9BT09 278 aa27.32■■□□□ 1.96
TPI1-201ENST00000229270 USP18Q9UMW8 372 aa27.32■■□□□ 1.96
TPI1-201ENST00000229270 GOLGA8MH3BSY2 632 aa27.32■■□□□ 1.96
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TPI1-201ENST00000229270 JADE1Q6IE81 842 aa27.32■■□□□ 1.96
TPI1-201ENST00000229270 C4orf22Q6V702 233 aa27.32■■□□□ 1.96
TPI1-201ENST00000229270 CAPN12Q6ZSI9 719 aa27.32■■□□□ 1.96
TPI1-201ENST00000229270 CXorf38Q8TB03 319 aa27.32■■□□□ 1.96
TPI1-201ENST00000229270 TCP10LQ8TDR4 215 aa27.32■■□□□ 1.96
TPI1-201ENST00000229270 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
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TPI1-201ENST00000229270 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
TPI1-201ENST00000229270 MICAL2O94851 1124 aa27.31■■□□□ 1.96
TPI1-201ENST00000229270 GSTA2P09210 222 aa27.31■■□□□ 1.96
TPI1-201ENST00000229270 CYP2C9P11712 490 aa27.31■■□□□ 1.96
TPI1-201ENST00000229270 HOXD10P28358 340 aa27.31■■□□□ 1.96
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TPI1-201ENST00000229270 NEK3P51956 506 aa27.31■■□□□ 1.96
TPI1-201ENST00000229270 KIZQ2M2Z5 673 aa27.31■■□□□ 1.96
TPI1-201ENST00000229270 SMTNL2Q2TAL5 461 aa27.31■■□□□ 1.96
TPI1-201ENST00000229270 BBS9Q3SYG4 887 aa27.31■■□□□ 1.96
TPI1-201ENST00000229270 NT5DC4Q86YG4 428 aa27.31■■□□□ 1.96
TPI1-201ENST00000229270 C1orf127Q8N9H9 656 aa27.31■■□□□ 1.96
TPI1-201ENST00000229270 KATNAL1Q9BW62 490 aa27.31■■□□□ 1.96
TPI1-201ENST00000229270 MANSC1Q9H8J5 431 aa27.31■■□□□ 1.96
TPI1-201ENST00000229270 PAK5Q9P286 719 aa27.31■■□□□ 1.96
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TPI1-201ENST00000229270 MYL3P08590 195 aa27.3■■□□□ 1.96
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TPI1-201ENST00000229270 KCNJ11Q14654 390 aa27.3■■□□□ 1.96
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TPI1-201ENST00000229270 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
TPI1-201ENST00000229270 ZFP69BQ9UJL9 534 aa27.3■■□□□ 1.96
TPI1-201ENST00000229270 TEX264Q9Y6I9 313 aa27.3■■□□□ 1.96
TPI1-201ENST00000229270 CITO14578 2027 aa27.3■■□□□ 1.96
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TPI1-201ENST00000229270 KCNT1Q5JUK3 1230 aa27.3■■□□□ 1.96
TPI1-201ENST00000229270 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
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TPI1-201ENST00000229270 SDCBP2Q9H190 292 aa27.3■■□□□ 1.96
TPI1-201ENST00000229270 ZNF180Q9UJW8 692 aa27.3■■□□□ 1.96
TPI1-201ENST00000229270 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
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TPI1-201ENST00000229270 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
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TPI1-201ENST00000229270 FAM91A1Q658Y4 838 aa27.29■■□□□ 1.96
TPI1-201ENST00000229270 SH2D5Q6ZV89 423 aa27.29■■□□□ 1.96
TPI1-201ENST00000229270 MAP7D3Q8IWC1 876 aa27.29■■□□□ 1.96
TPI1-201ENST00000229270 ELOVL4Q9GZR5 314 aa27.29■■□□□ 1.96
TPI1-201ENST00000229270 TJP2Q9UDY2 1190 aa27.29■■□□□ 1.96
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