RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000023054.13

Apobec3-201, Transcript of DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Apobec3, Length 1,842 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Rell1Q8K2J7 272 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Haus3Q8QZX2 570 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 BlmhQ8R016 455 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Angel1Q8VCU0 667 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Q8VDP2 222 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Snx9Q91VH2 595 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Pard3bQ9CSB4 1203 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Vwa7Q9JHA8 891 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 GgcxQ9QYC7 757 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Snx1Q9WV80 522 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Nup210lQ9D2F7 1881 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Cyp4a29A0A087WPC3 509 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm13276A0A087WR18 182 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm15262A0A140LIQ5 728 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Tubb1A2AQ07 451 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm5936A2BG95 728 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 ZxdbA2CE44 873 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm5640A3KG49 728 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Cyp2b13A6H6J2 491 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Siah3B2RWG3 268 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm6133B2RY53 190 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ccdc24E9PUW8 296 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Trim30bE9PVL6 203 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Srsf11E9Q6E5 511 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Tmem265E9Q8G3 109 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm6583E9Q8Z1 469 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 E030030I06RikJ3QML9 246 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ppef1O35655 650 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 P01652 108 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Lamp2P17047 415 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Zfy2P20662 777 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Vav1P27870 845 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 TktP40142 623 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Kcnn2P58390 839 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Il1rapl1P59823 695 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Rpl22P67984 128 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Cpne7Q0VE82 557 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Faf2Q3TDN2 445 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 CblbQ3TTA7 982 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Syce2Q505B8 171 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Serpinb6Q60854 378 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Usp17laQ61068 526 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 OcrlQ6NVF0 900 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 RbfaQ6P3B9 350 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Dnajc16Q80TN4 772 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 SnphQ80U23 495 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Wnk4Q80UE6 1222 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 GnsQ8BFR4 544 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Orai2Q8BH10 250 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Kank2Q8BX02 843 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 SgczQ8BX51 311 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Zfp120Q8BZW4 436 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Sh3rf3Q8C120 878 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Tmem120aQ8C1E7 343 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ccdc186Q8C9S4 917 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Sec63Q8VHE0 760 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Pcdhb17Q91VD8 799 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Synpo2Q91YE8 1087 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 MrgpreQ91ZB7 310 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Clstn3Q99JH7 956 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Fuca2Q99KR8 461 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 CoprsQ9CQ13 173 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Cox16Q9CR63 106 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Dcp2Q9CYC6 422 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ascc1Q9D8Z1 356 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 IkbipQ9DBZ1 373 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Tubd1Q9R1K7 455 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Phf2Q9WTU0 1096 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ms4a4aA0A087WRT7 236 aa9.71□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm36028A0A0U1RPM1 299 aa9.71□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Tbc1d16A2ABG4 766 aa9.71□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Kcng1A2BDX4 514 aa9.71□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 4930402K13RikB1AW18 415 aa9.71□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm8369E9PZI3 166 aa9.71□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Hnrnph1O35737 449 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Il2P04351 169 aa9.71□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 CalrP14211 416 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Fcer2P20693 331 aa9.71□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 GlrbP48168 496 aa9.71□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Dynlt1P51807 113 aa9.71□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Hnrnph2P70333 449 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Tmprss15P97435 1069 aa9.71□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Tekt4Q149S1 447 aa9.71□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Nsun2Q1HFZ0 757 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Cd163Q2VLH6 1121 aa9.71□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ccdc33Q3ULW6 985 aa9.71□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Slc30a9Q5IRJ6 567 aa9.71□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Slc5a10Q5SWY8 596 aa9.71□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Birc2Q62210 612 aa9.71□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Q6DFW0 481 aa9.71□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Dusp11Q6NXK5 321 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Tatdn1Q6P8M1 295 aa9.71□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Mon1aQ6PDG8 556 aa9.71□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 TwistnbQ78WZ7 330 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Armc12Q80X86 340 aa9.71□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Best2Q8BGM5 508 aa9.71□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gtf3c4Q8BMQ2 817 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ldhal6bQ8BVP2 382 aa9.71□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Nipal4Q8BZF2 406 aa9.71□□□□□ -0.85
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Fam78aQ8C552 283 aa9.71□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19.2 ms