RNA–Protein interactions for RNA: YDL105W

NSE4, Transcript of Component of the SMC5-SMC6 complex, yeastyeast

Gene NSE4, Length 1,209 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSE4YDL105W NUP192P47054 1683 aa0.39□□□□□ -2.35
NSE4YDL105W YBL039W-BP0C268 59 aa0.38□□□□□ -2.35
NSE4YDL105W YFR010W-AP0C5N0 62 aa0.38□□□□□ -2.35
NSE4YDL105W RPS30AP0CX33 63 aaKnown RBP0.38□□□□□ -2.35
NSE4YDL105W RPS30BP0CX34 63 aaKnown RBP0.38□□□□□ -2.35
NSE4YDL105W YGR025WP53216 100 aa0.38□□□□□ -2.35
NSE4YDL105W YDR246W-AQ3E763 66 aa0.38□□□□□ -2.35
NSE4YDL105W YDR182W-AQ3E796 67 aa0.38□□□□□ -2.35
NSE4YDL105W FIG2P25653 1609 aa0.38□□□□□ -2.35
NSE4YDL105W YBR200W-AQ3E755 54 aa0.37□□□□□ -2.35
NSE4YDL105W VMA9Q3E7B6 73 aa0.37□□□□□ -2.35
NSE4YDL105W YOR011W-AQ3E807 68 aa0.37□□□□□ -2.35
NSE4YDL105W YOR394C-AQ8TGJ0 55 aa0.37□□□□□ -2.35
NSE4YDL105W TAO3P40468 2376 aa0.37□□□□□ -2.35
NSE4YDL105W DYN1P36022 4092 aa0.36□□□□□ -2.35
NSE4YDL105W TRA1P38811 3744 aa0.36□□□□□ -2.35
NSE4YDL105W RPS27AP35997 82 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
NSE4YDL105W YBL044WP38194 122 aa0.36□□□□□ -2.35
NSE4YDL105W SIP18P50263 79 aa0.36□□□□□ -2.35
NSE4YDL105W FLO1P32768 1537 aa0.36□□□□□ -2.35
NSE4YDL105W SEN1Q00416 2231 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
NSE4YDL105W YLR157W-DP0CE99 70 aa0.35□□□□□ -2.35
NSE4YDL105W YKL023C-AQ2V2P3 75 aa0.34□□□□□ -2.36
NSE4YDL105W YMR001C-AQ8TGS9 76 aa0.34□□□□□ -2.36
NSE4YDL105W YOR008C-AQ3E7B9 74 aa0.33□□□□□ -2.36
NSE4YDL105W YCR108CQ3E819 63 aa0.33□□□□□ -2.36
NSE4YDL105W YOL166W-AQ8TGJ1 51 aa0.33□□□□□ -2.36
NSE4YDL105W YDR524C-BQ3E6R4 66 aa0.32□□□□□ -2.36
NSE4YDL105W YBR230W-AQ3E762 66 aa0.31□□□□□ -2.36
NSE4YDL105W TOS6P48560 102 aa0.3□□□□□ -2.36
NSE4YDL105W MEC1P38111 2368 aa0.3□□□□□ -2.36
NSE4YDL105W RPS27BP38711 82 aa0.29□□□□□ -2.36
NSE4YDL105W YBR056W-AI2HB52 66 aa0.28□□□□□ -2.36
NSE4YDL105W YOR192C-CQ3E736 78 aa0.27□□□□□ -2.37
NSE4YDL105W YIL046W-AQ3E7Z4 54 aa0.27□□□□□ -2.37
NSE4YDL105W COA2Q3E823 68 aa0.27□□□□□ -2.37
NSE4YDL105W YGR146C-AQ8TGT9 53 aa0.27□□□□□ -2.37
NSE4YDL105W RPS29AP41057 56 aaKnown RBP0.25□□□□□ -2.37
NSE4YDL105W YPR010C-AA5Z2X5 72 aa0.24□□□□□ -2.37
NSE4YDL105W YGL258W-AQ3E740 77 aa0.23□□□□□ -2.37
NSE4YDL105W YLL006W-AQ3E814 58 aa0.23□□□□□ -2.37
NSE4YDL105W YOR072W-BQ3E832 53 aa0.23□□□□□ -2.37
NSE4YDL105W Q0297Q9ZZV8 51 aa0.22□□□□□ -2.37
NSE4YDL105W YHR050W-AQ05451 56 aa0.15□□□□□ -2.39
NSE4YDL105W YOR316C-AQ3E806 69 aa0.15□□□□□ -2.39
NSE4YDL105W COX9P07255 59 aa0.13□□□□□ -2.39
NSE4YDL105W YJL133C-AQ3E7A3 74 aa0.13□□□□□ -2.39
NSE4YDL105W DDR2P89113 61 aa0.12□□□□□ -2.39
NSE4YDL105W YLR342W-AQ3E810 57 aa0.12□□□□□ -2.39
NSE4YDL105W YDR034C-AP0C289 58 aa0.11□□□□□ -2.39
NSE4YDL105W HOR7Q05827 59 aa0.11□□□□□ -2.39
NSE4YDL105W RPL39P04650 51 aa0.1□□□□□ -2.39
NSE4YDL105W RPL29P05747 59 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.4
NSE4YDL105W TOM7P53507 60 aa0.08□□□□□ -2.4
NSE4YDL105W YMR105W-AQ8TGS8 64 aa0.08□□□□□ -2.4
NSE4YDL105W NCE101Q02820 53 aa0.06□□□□□ -2.4
NSE4YDL105W Q0017Q9ZZX8 53 aa0.06□□□□□ -2.4
NSE4YDL105W YHR073W-AP0C5N7 58 aa0.05□□□□□ -2.4
NSE4YDL105W SMX2P40204 77 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
NSE4YDL105W YML054C-AQ3E809 52 aa0.04□□□□□ -2.4
NSE4YDL105W YJL127C-BQ3E828 52 aa0.04□□□□□ -2.4
NSE4YDL105W YLL066W-BQ8TGJ7 56 aa0.02□□□□□ -2.41
NSE4YDL105W PMP3P87284 55 aa-0.01□□□□□ -2.41
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