RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623297.1

CU639417.6-201, humanhuman

TSL 2

Gene CU639417.6, Length 3,013 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CU639417.6-201ENST00000623297 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 TUBB6Q9BUF5 446 aa15.5■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 UGT1A7Q9HAW7 530 aa15.5■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 UGT1A10Q9HAW8 530 aa15.5■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 UGT1A8Q9HAW9 530 aa15.5■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa15.5■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 PCDH9Q9HC56 1237 aa15.5■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 SLC9A2Q9UBY0 812 aa15.5■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 ZNF112Q9UJU3 913 aa15.5■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 PACSIN3Q9UKS6 424 aa15.5■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 TRIM49D1C9J1S8 452 aa15.49■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 COPEO14579 308 aa15.49■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 EXTL3O43909 919 aa15.49■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 GRIA2P42262 883 aa15.49■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 SCNN1BP51168 640 aa15.49■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 AP2B1P63010 937 aa15.49■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 MMRN1Q13201 1228 aa15.49■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 CHI3L2Q15782 390 aa15.49■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 RAB6CQ53S08 254 aa15.49■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 SFT2D3Q587I9 215 aa15.49■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 C1orf228Q6PIY5 440 aa15.49■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 SATL1Q86VE3 508 aa15.49■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 PDIK1LQ8N165 341 aa15.49■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 JOSD2Q8TAC2 188 aa15.49■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 TMC2Q8TDI7 906 aa15.49■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 LPAR1Q92633 364 aa15.49■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 RAB6CQ9H0N0 254 aa15.49■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 LMCD1Q9NZU5 365 aa15.49■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 IP6K2Q9UHH9 426 aa15.49■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 RGS20O76081 388 aa15.49■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 CDKN2BP42772 138 aa15.49■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 BPIFB4P59827 614 aa15.49■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 KLHL38Q2WGJ6 581 aa15.49■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa15.49■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 WDR78Q5VTH9 848 aa15.49■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 ARHGAP24Q8N264 748 aa15.49■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 SLC7A3Q8WY07 619 aa15.49■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 TFAP2BQ92481 460 aa15.49■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 HEY1Q9Y5J3 304 aa15.49■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa15.49■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa15.49■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 DNAJC6O75061 913 aa15.49■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 DGAT1O75907 488 aa15.49■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 PSAPP07602 524 aa15.49■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 PDE1BQ01064 536 aa15.49■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 SPDYAQ5MJ70 313 aa15.49■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa15.49■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 C6orf163Q5TEZ5 329 aa15.49■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 NAT8LQ8N9F0 302 aa15.49■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 KCTD6Q8NC69 237 aa15.49■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 FAM81AQ8TBF8 368 aa15.49■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 POLIQ9UNA4 740 aa15.49■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 TMEM191CA6NGB0 347 aa15.48■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 TMEM191BP0C7N4 346 aa15.48■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 ACO1P21399 889 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 KRT72Q14CN4 511 aa15.48■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 RNF111Q6ZNA4 994 aa15.48■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 ZNF280CQ8ND82 737 aa15.48■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 APOPT1Q96IL0 206 aa15.48■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 NLRP4Q96MN2 994 aa15.48■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 NR2E3Q9Y5X4 410 aa15.48■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 A8MXQ7 604 aa15.48■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 I3L4J1 428 aa15.48■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 STAM2O75886 525 aa15.48■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 CCND2P30279 289 aa15.48■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 SFNP31947 248 aa15.48■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 AQP4P55087 323 aa15.48■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 ASPHQ12797 758 aa15.48■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 DLG1Q12959 904 aa15.48■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 BSPRYQ5W0U4 402 aa15.48■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa15.48■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 AS3MTQ9HBK9 375 aa15.48■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 PREBQ9HCU5 417 aa15.48■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 CISHQ9NSE2 258 aa15.48■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 ANKEF1Q9NU02 776 aa15.48■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 STRIP2Q9ULQ0 834 aa15.48■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 SCINQ9Y6U3 715 aa15.48■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa15.47■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 CCDC160A6NGH7 325 aa15.47■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 VWA5AO00534 786 aa15.47■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 PMM2O15305 246 aa15.47■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 PLA2G6O60733 806 aa15.47■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 TM7SF2O76062 418 aa15.47■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 ITGAVP06756 1048 aa15.47■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 IL1R2P27930 398 aa15.47■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 BACE1P56817 501 aa15.47■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 ACTR3P61158 418 aa15.47■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 DEUP1Q05D60 604 aa15.47■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 UBA3Q8TBC4 463 aa15.47■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 OPTNQ96CV9 577 aa15.47■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 APOL6Q9BWW8 343 aa15.47■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CU639417.6-201ENST00000623297 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms