RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 MFAP3LO75121 409 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 KRT9P35527 623 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 RAD23BP54727 409 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 PTK2Q05397 1052 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 STILQ15468 1287 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 PRSS36Q5K4E3 855 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 SFMBT2Q5VUG0 894 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 C1orf228Q6PIY5 440 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 VITQ6UXI7 678 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 WDR5BQ86VZ2 330 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 AIPL1Q9NZN9 384 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 WASF3Q9UPY6 502 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 DSPP15924 2871 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 LRRC53A6NM62 1247 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 EPN2O95208 641 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 LMO2P25791 158 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 USP8P40818 1118 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 PLA2G2CQ5R387 149 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC4A11Q8NBS3 891 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 OR8K1Q8NGG5 319 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 CPLX3Q8WVH0 158 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 MSANTD3Q96H12 275 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 DNAJC7Q99615 494 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 ELOVL4Q9GZR5 314 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF197O14709 1029 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF263O14978 683 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 PDGFRBP09619 1106 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 VDRP11473 427 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 GSDMDP57764 484 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 ASIC2Q16515 512 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 OR10T2Q8NGX3 314 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 SMARCD2Q92925 531 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 TWNKQ96RR1 684 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 HMGXB4Q9UGU5 601 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 MAFFQ9ULX9 164 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 NME7Q9Y5B8 376 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 CDY1Q9Y6F8 540 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 ATP8B3O60423 1300 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 GFPT2O94808 682 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 PDE6CP51160 858 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 RING1Q06587 406 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 MEA1Q16626 185 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF394Q53GI3 561 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 SGO2Q562F6 1265 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 DGKKQ5KSL6 1271 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 ARHGAP17Q68EM7 881 aa24.94■■□□□ 1.58
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CAPNS1-214ENST00000592483 C4orf50Q6ZRC1 276 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 ACOT1Q86TX2 421 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF677Q86XU0 584 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 TCEAL4Q96EI5 215 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 PKMYT1Q99640 499 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 ADAM33Q9BZ11 813 aa24.94■■□□□ 1.58
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CAPNS1-214ENST00000592483 LHX6Q9UPM6 363 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 CYP26A1O43174 497 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 MED7O43513 233 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 LRG1P02750 347 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 GNA15P30679 374 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 CLCN1P35523 988 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 PRKCIP41743 596 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 GPR17Q13304 367 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 TPGS2Q68CL5 300 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 RNF43Q68DV7 783 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 Q6ZS52 159 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 GAB3Q8WWW8 586 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 CORO1BQ9BR76 489 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 ABHD10Q9NUJ1 306 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 C2orf42Q9NWW7 574 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 WDR27A2RRH5 827 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 ARNTLO00327 626 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 CPB1P15086 417 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 FOXC1Q12948 553 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 MFSD6LQ8IWD5 586 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 SPC24Q8NBT2 197 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 PDLIM2Q96JY6 352 aa24.92■■□□□ 1.58
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