RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580814.1

TSG101-211, Transcript of tumor susceptibility 101, humanhuman

TSL 2

Gene TSG101, Length 441 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSG101-211ENST00000580814 SH2B3Q9UQQ2 575 aa6.56□□□□□ -1.36
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TSG101-211ENST00000580814 ADH4P08319 380 aa6.55□□□□□ -1.36
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TSG101-211ENST00000580814 BMPR2Q13873 1038 aa6.54□□□□□ -1.36
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TSG101-211ENST00000580814 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa6.54□□□□□ -1.36
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TSG101-211ENST00000580814 CA14Q9ULX7 337 aa6.54□□□□□ -1.36
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TSG101-211ENST00000580814 PTK2BQ14289 1009 aa6.53□□□□□ -1.36
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TSG101-211ENST00000580814 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
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TSG101-211ENST00000580814 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
TSG101-211ENST00000580814 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa6.53□□□□□ -1.36
TSG101-211ENST00000580814 VN1R3Q9BXE9 311 aa6.53□□□□□ -1.36
TSG101-211ENST00000580814 RETREG1Q9H6L5 497 aa6.53□□□□□ -1.36
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TSG101-211ENST00000580814 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
TSG101-211ENST00000580814 CCDC151A5D8V7 595 aa6.52□□□□□ -1.37
TSG101-211ENST00000580814 TMEM191CA6NGB0 347 aa6.52□□□□□ -1.37
TSG101-211ENST00000580814 NPC1O15118 1278 aa6.52□□□□□ -1.37
TSG101-211ENST00000580814 PIP5K1CO60331 668 aa6.52□□□□□ -1.37
TSG101-211ENST00000580814 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
TSG101-211ENST00000580814 SNX2O60749 519 aa6.52□□□□□ -1.37
TSG101-211ENST00000580814 ERBB2P04626 1255 aa6.52□□□□□ -1.37
TSG101-211ENST00000580814 CHRM2P08172 466 aa6.52□□□□□ -1.37
TSG101-211ENST00000580814 TYRP1P17643 537 aa6.52□□□□□ -1.37
TSG101-211ENST00000580814 MST1P26927 711 aa6.52□□□□□ -1.37
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