RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		3.22	□□□□□ -1.89
AKAP13-223	ENST00000560957	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		3.22	□□□□□ -1.89
AKAP13-223	ENST00000560957	INTS13	Q9NVM9	706 aa		3.22	□□□□□ -1.89
AKAP13-223	ENST00000560957	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		3.22	□□□□□ -1.89
AKAP13-223	ENST00000560957	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		3.22	□□□□□ -1.89
AKAP13-223	ENST00000560957	PCDHA13	Q9Y5I0	950 aa		3.22	□□□□□ -1.89
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A087X0M5	115 aa		3.21	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A088AWK7	358 aa		3.21	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A1B0GX30	115 aa		3.21	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	IRAK2	O43187	625 aa		3.21	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	SGTA	O43765	313 aa		3.21	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	KRT86	O43790	486 aa		3.21	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC43A1	O75387	559 aa		3.21	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	TGFB3	P10600	412 aa		3.21	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	ABCB4	P21439	1286 aa		3.21	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	HTR1B	P28222	390 aa		3.21	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	KRT9	P35527	623 aa		3.21	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	STT3A	P46977	705 aa		3.21	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF134	P52741	427 aa		3.21	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC16A1	P53985	500 aa		3.21	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	MC2R	Q01718	297 aa		3.21	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF543	Q08ER8	600 aa		3.21	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	KRT81	Q14533	505 aa		3.21	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		3.21	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM209B	Q5JX69	171 aa		3.21	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		3.21	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	TMIE	Q8NEW7	156 aa		3.21	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		3.21	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	LPIN2	Q92539	896 aa		3.21	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	KIAA1191	Q96A73	305 aa		3.21	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		3.21	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	RMDN3	Q96TC7	470 aa		3.21	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		3.21	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	JKAMP	Q9P055	326 aa		3.21	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		3.21	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	CDYL	Q9Y232	598 aa		3.21	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	ISM1	B1AKI9	464 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	ADM5	C9JUS6	153 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957		E9PLN8	166 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	EIF3F	O00303	357 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC16A6	O15403	523 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	PLA2G6	O60733	806 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	MTA2	O94776	668 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	MT3	P25713	68 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	3.2	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	KRTAP10-5	P60370	271 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	ZBED6	P86452	979 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	TLE1	Q04724	770 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	TLE2	Q04725	743 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	DYRK1A	Q13627	763 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	IL10RA	Q13651	578 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	PRKG1	Q13976	671 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	TAF12	Q16514	161 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	CCNG2	Q16589	344 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	ZACN	Q401N2	412 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	ARMC3	Q5W041	872 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	APOA5	Q6Q788	366 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF365	Q70YC5	407 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	KRT74	Q7RTS7	529 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	DAAM2	Q86T65	1068 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	TSPYL6	Q8N831	410 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	TFAP2B	Q92481	460 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	HDAC10	Q969S8	669 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	CDHR1	Q96JP9	859 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	MARK4	Q96L34	752 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	STK31	Q9BXU1	1019 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	TDP1	Q9NUW8	608 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	CDC23	Q9UJX2	597 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	VWC2L	B2RUY7	222 aa		3.19	□□□□□ -1.9

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