RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531920.6

MED17-208, Transcript of mediator complex subunit 17, human

TSL 3

Gene MED17, Length 573 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MED17-208	ENST00000531920	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	PRKG2	Q13237	762 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	E2F2	Q14209	437 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	P3H1	Q32P28	736 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	TRIM60	Q495X7	471 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	METRNL	Q641Q3	311 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	ATG16L1	Q676U5	607 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	ZNF280D	Q6N043	979 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	TP53I13	Q8NBR0	393 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	SYT8	Q8NBV8	401 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	VPS51	Q9UID3	782 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	FSD2	A1L4K1	749 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	ADM5	C9JUS6	153 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920		K7ENM7	598 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	ERN1	O75460	977 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	CPA1	P15085	419 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	PRKAR1B	P31321	381 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	UQCRC1	P31930	480 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	GATM	P50440	423 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	SLURP1	P55000	103 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	DCAF7	P61962	342 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	NUCB1	Q02818	461 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	CSHL1	Q14406	222 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	ANKRD1	Q15327	319 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	FSTL5	Q8N475	847 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	RFFL	Q8WZ73	363 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	STAM	Q92783	540 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	TEPSIN	Q96N21	525 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	GNRHR2	Q96P88	292 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	MECR	Q9BV79	373 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	ACAD9	Q9H845	621 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	RMI1	Q9H9A7	625 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920		A0A087X0M5	115 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920		A0A1B0GTW7	788 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920		A0A1B0GX30	115 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920		F5H697	171 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	ZNF185	O15231	689 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	SPTLC2	O15270	562 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	CSF1R	P07333	972 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	CYP21A2	P08686	494 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	KCNA2	P16389	499 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	FGFR4	P22455	802 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	MAN2A2	P49641	1150 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	NDUFV1	P49821	464 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	PPP2CB	P62714	309 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	PPP2CA	P67775	309 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	5.04	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	CCNI	Q14094	377 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	D2HGDH	Q8N465	521 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		5.04	□□□□□ -1.6

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