RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516635.1

RNU6-344P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 344, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-344P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
RNU6-344P-201ENST00000516635 PADI4Q9UM07 663 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-344P-201ENST00000516635 CAPN11Q9UMQ6 739 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-344P-201ENST00000516635 USP22Q9UPT9 525 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-344P-201ENST00000516635 SH2B3Q9UQQ2 575 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-344P-201ENST00000516635 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-344P-201ENST00000516635 AQP7P3A6NL99 342 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-344P-201ENST00000516635 CLCA1A8K7I4 914 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-344P-201ENST00000516635 TARM1B6A8C7 271 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-344P-201ENST00000516635 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-344P-201ENST00000516635 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-344P-201ENST00000516635 AREL1O15033 823 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-344P-201ENST00000516635 ONECUT2O95948 504 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-344P-201ENST00000516635 FGAP02671 866 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-344P-201ENST00000516635 NPSP0C0P6 89 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-344P-201ENST00000516635 WT1P19544 449 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-344P-201ENST00000516635 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-344P-201ENST00000516635 MST1P26927 711 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-344P-201ENST00000516635 DIO1P49895 249 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-344P-201ENST00000516635 MTHFSP49914 203 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-344P-201ENST00000516635 COPAP53621 1224 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-344P-201ENST00000516635 LMAN2Q12907 356 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-344P-201ENST00000516635 MPEG1Q2M385 716 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-344P-201ENST00000516635 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-344P-201ENST00000516635 TMTC4Q5T4D3 741 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-344P-201ENST00000516635 IZUMO3Q5VZ72 239 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-344P-201ENST00000516635 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-344P-201ENST00000516635 ANKRD16Q6P6B7 361 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-344P-201ENST00000516635 KIRREL2Q6UWL6 708 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZNF788Q6ZQV5 615 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-344P-201ENST00000516635 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-344P-201ENST00000516635 KRT28Q7Z3Y7 464 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-344P-201ENST00000516635 PRIMA1Q86XR5 153 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-344P-201ENST00000516635 CCDC28AQ8IWP9 274 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-344P-201ENST00000516635 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-344P-201ENST00000516635 ABHD11Q8NFV4 315 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-344P-201ENST00000516635 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-344P-201ENST00000516635 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-344P-201ENST00000516635 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-344P-201ENST00000516635 DDB2Q92466 427 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-344P-201ENST00000516635 TBC1D5Q92609 795 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-344P-201ENST00000516635 DPF1Q92782 380 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZNF566Q969W8 418 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-344P-201ENST00000516635 MMS19Q96T76 1030 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-344P-201ENST00000516635 MYD88Q99836 296 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-344P-201ENST00000516635 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-344P-201ENST00000516635 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-344P-201ENST00000516635 MAGEB5Q9BZ81 275 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-344P-201ENST00000516635 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-344P-201ENST00000516635 CIPCQ9C0C6 399 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-344P-201ENST00000516635 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-344P-201ENST00000516635 ASIC5Q9NY37 505 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-344P-201ENST00000516635 WNT6Q9Y6F9 365 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-344P-201ENST00000516635 COX11Q9Y6N1 276 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-344P-201ENST00000516635 WIPF3A6NGB9 483 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-344P-201ENST00000516635 TISP43B9A030 160 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-344P-201ENST00000516635 PSMD9O00233 223 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-344P-201ENST00000516635 PODXLO00592 558 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-344P-201ENST00000516635 CBFA2T3O75081 653 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-344P-201ENST00000516635 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-344P-201ENST00000516635 INMTO95050 263 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-344P-201ENST00000516635 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-344P-201ENST00000516635 CREB1P16220 341 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-344P-201ENST00000516635 KRTAP5-9P26371 169 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-344P-201ENST00000516635 RBL1P28749 1068 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-344P-201ENST00000516635 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-344P-201ENST00000516635 PBX1P40424 430 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-344P-201ENST00000516635 HSPA7P48741 367 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-344P-201ENST00000516635 RENBPP51606 427 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-344P-201ENST00000516635 COPB1P53618 953 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-344P-201ENST00000516635 GPS1Q13098 491 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-344P-201ENST00000516635 MTAPQ13126 283 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-344P-201ENST00000516635 UBE4AQ14139 1066 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-344P-201ENST00000516635 PROSER3Q2NL68 480 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-344P-201ENST00000516635 FAXCQ5TGI0 409 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-344P-201ENST00000516635 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-344P-201ENST00000516635 FCRLBQ6BAA4 426 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-344P-201ENST00000516635 CEP85Q6P2H3 762 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-344P-201ENST00000516635 GGT6Q6P531 493 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-344P-201ENST00000516635 PTCHD4Q6ZW05 846 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-344P-201ENST00000516635 BEND5Q7L4P6 421 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-344P-201ENST00000516635 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-344P-201ENST00000516635 DPP9Q86TI2 863 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-344P-201ENST00000516635 MORC1Q86VD1 984 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-344P-201ENST00000516635 CHSY1Q86X52 802 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-344P-201ENST00000516635 FAM186BQ8IYM0 893 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-344P-201ENST00000516635 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-344P-201ENST00000516635 SIRT6Q8N6T7 355 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-344P-201ENST00000516635 TERB1Q8NA31 727 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-344P-201ENST00000516635 SUN3Q8TAQ9 357 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-344P-201ENST00000516635 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-344P-201ENST00000516635 GJA10Q969M2 543 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-344P-201ENST00000516635 RSPRY1Q96DX4 576 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-344P-201ENST00000516635 TNIP3Q96KP6 325 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-344P-201ENST00000516635 FAM227BQ96M60 508 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-344P-201ENST00000516635 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-344P-201ENST00000516635 SH2D3AQ9BRG2 576 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-344P-201ENST00000516635 COLEC11Q9BWP8 271 aa2.58□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms