RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482054.1

CTSL-205, Transcript of cathepsin L, human

TSL 2

Gene CTSL, Length 908 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTSL-205	ENST00000482054	SPTLC2	O15270	562 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	COCH	O43405	550 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	APOD	P05090	189 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	FAM163B	P0C2L3	166 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	P2RY2	P41231	377 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	KIR2DL1	P43626	348 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	AMPD3	Q01432	767 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	KDSR	Q06136	332 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	LMAN2	Q12907	356 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	13.73	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	NUP93	Q8N1F7	819 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	FRMD1	Q8N878	549 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	WHAMM	Q8TF30	809 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	FBXO32	Q969P5	355 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	ZFR	Q96KR1	1074 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	PLXNB3	Q9ULL4	1909 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	UBE4B	O95155	1302 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	TNRC6B	Q9UPQ9	1833 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	E2F8	A0AVK6	867 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	STX6	O43752	255 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	ADAM23	O75077	832 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	YWHAQ	P27348	245 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	CASP1	P29466	404 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	GRIA2	P42262	883 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	TRPC3	Q13507	836 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	EOGT	Q5NDL2	527 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	SHC4	Q6S5L8	630 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	FAM35A	Q86V20	835 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	SPACA7	Q96KW9	195 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	KCNK16	Q96T55	309 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	POLM	Q9NP87	494 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	13.72	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054		A0A0A0MRY4	1105 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	MAP3K13	O43283	966 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	PPP6R2	O75170	966 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	ENG	P17813	658 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	ATIC	P31939	592 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	PTGER3	P43115	390 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	TNFRSF4	P43489	277 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	CASP4	P49662	377 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	CDH8	P55286	799 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	EHHADH	Q08426	723 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	UNC13D	Q70J99	1090 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	IQUB	Q8NA54	791 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	HMGB4	Q8WW32	186 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	MED10	Q9BTT4	135 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	NUSAP1	Q9BXS6	441 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CTSL-205	ENST00000482054	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.22
CTSL-205	ENST00000482054	ADAMTS9	Q9P2N4	1935 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CTSL-205	ENST00000482054	ATP8B3	O60423	1300 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CTSL-205	ENST00000482054	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CTSL-205	ENST00000482054	TNFRSF10B	O14763	440 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CTSL-205	ENST00000482054	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
CTSL-205	ENST00000482054	CUTA	O60888	179 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CTSL-205	ENST00000482054	PHACTR2	O75167	634 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CTSL-205	ENST00000482054	CLSTN1	O94985	981 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CTSL-205	ENST00000482054	SLC5A3	P53794	718 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CTSL-205	ENST00000482054	GAD2	Q05329	585 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CTSL-205	ENST00000482054	BIRC3	Q13489	604 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CTSL-205	ENST00000482054	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CTSL-205	ENST00000482054	ZNF699	Q32M78	642 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CTSL-205	ENST00000482054	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		13.7	□□□□□ -0.22

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