RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478954.1

STRADBP1-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene STRADBP1, Length 1,281 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa6.4□□□□□ -1.38
STRADBP1-201ENST00000478954 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa6.4□□□□□ -1.38
STRADBP1-201ENST00000478954 ITIH6Q6UXX5 1313 aa6.4□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 KDM3BQ7LBC6 1761 aa6.39□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 B4E171 279 aa6.39□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM155BO75949 473 aa6.39□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 BAIAP3O94812 1187 aa6.39□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 JUPP14923 745 aa6.39□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 BMP7P18075 431 aa6.39□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 ELF1P32519 619 aa6.39□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 TSPAN7P41732 249 aa6.39□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 KIR2DL3P43628 341 aa6.39□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 CRKLP46109 303 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 UCP3P55916 312 aa6.39□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 ACAP1Q15027 740 aa6.39□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC44A4Q53GD3 710 aa6.39□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 OLFM4Q6UX06 510 aa6.39□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 ZDHHC24Q6UX98 284 aa6.39□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 KIAA0408Q6ZU52 694 aa6.39□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa6.39□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa6.39□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF384Q8TF68 577 aa6.39□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa6.39□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 GUCD1Q96NT3 240 aa6.39□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 KCNC2Q96PR1 638 aa6.39□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 BRD9Q9H8M2 597 aa6.39□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 TMOD3Q9NYL9 352 aa6.39□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 KIF17Q9P2E2 1029 aa6.39□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 POLG2Q9UHN1 485 aa6.39□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC45A2Q9UMX9 530 aa6.39□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 VWA7Q9Y334 891 aa6.39□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 TRIM17Q9Y577 477 aa6.39□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa6.38□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 MTSS1O43312 755 aa6.38□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 KCNQ3O43525 872 aa6.38□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC43A1O75387 559 aa6.38□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 GNAI3P08754 354 aa6.38□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 GYPEP15421 78 aa6.38□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 BTF3P20290 206 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 IL1R2P27930 398 aa6.38□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 NR1H2P55055 460 aa6.38□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 GNAI1P63096 354 aa6.38□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 DUSP2Q05923 314 aa6.38□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.38□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 TMTC4Q5T4D3 741 aa6.38□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 LCE4AQ5TA78 99 aa6.38□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 FRMD5Q7Z6J6 570 aa6.38□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 SIAH1Q8IUQ4 282 aa6.38□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 FEZF2Q8TBJ5 459 aa6.38□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa6.38□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 RUBCNQ92622 972 aa6.38□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 ZBTB10Q96DT7 871 aa6.38□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 AGAP1Q9UPQ3 857 aa6.38□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 SOAT2O75908 522 aa6.37□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 TBX18O95935 607 aa6.37□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 CHGBP05060 677 aa6.37□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 RAP2AP10114 183 aa6.37□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 RARBP10826 455 aa6.37□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 CKBP12277 381 aa6.37□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 HOXC9P31274 260 aa6.37□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 ADD2P35612 726 aa6.37□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 CASRP41180 1078 aa6.37□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 COPAP53621 1224 aa6.37□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 SEC24CP53992 1094 aa6.37□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 PRKAA2P54646 552 aa6.37□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 CUL4BQ13620 913 aa6.37□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 PCOLCEQ15113 449 aa6.37□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 CRB2Q5IJ48 1285 aa6.37□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 RAP1GAP2Q684P5 730 aa6.37□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 MCTP2Q6DN12 878 aa6.37□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa6.37□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 CRTC1Q6UUV9 634 aa6.37□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 RASAL3Q86YV0 1011 aa6.37□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP6.37□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 CCDC150Q8NCX0 1101 aa6.37□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 HTRA1Q92743 480 aa6.37□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF333Q96JL9 665 aa6.37□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 NDC1Q9BTX1 674 aa6.37□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 CENPOQ9BU64 300 aa6.37□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 TBC1D22BQ9NU19 505 aa6.37□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 MOCS1Q9NZB8 636 aa6.37□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 LPAR3Q9UBY5 353 aa6.37□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC13A4Q9UKG4 626 aa6.37□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
STRADBP1-201ENST00000478954 MRC1P22897 1456 aa6.36□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms