RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 XXYLT1Q8NBI6 393 aa11.9□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 BHMTQ93088 406 aa11.9□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 P2RY11Q96G91 374 aa11.9□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 SLITRK1Q96PX8 696 aa11.9□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 ELOVL4Q9GZR5 314 aa11.9□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 KRT82Q9NSB4 513 aa11.9□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 FAM49BQ9NUQ9 324 aa11.9□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 NUDT5Q9UKK9 219 aa11.9□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa11.9□□□□□ -0.5
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ACTB-209ENST00000473257 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP11.89□□□□□ -0.51
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ACTB-209ENST00000473257 C7orf25Q9BPX7 421 aa11.89□□□□□ -0.51
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ACTB-209ENST00000473257 E2F8A0AVK6 867 aa11.88□□□□□ -0.51
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ACTB-209ENST00000473257 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
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ACTB-209ENST00000473257 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
ACTB-209ENST00000473257 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa11.88□□□□□ -0.51
ACTB-209ENST00000473257 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa11.88□□□□□ -0.51
ACTB-209ENST00000473257 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
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ACTB-209ENST00000473257 CYP26A1O43174 497 aa11.87□□□□□ -0.51
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ACTB-209ENST00000473257 CUTAO60888 179 aa11.87□□□□□ -0.51
ACTB-209ENST00000473257 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
ACTB-209ENST00000473257 PFKLP17858 780 aa11.87□□□□□ -0.51
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ACTB-209ENST00000473257 NDST1P52848 882 aa11.87□□□□□ -0.51
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ACTB-209ENST00000473257 NMUR1Q9HB89 426 aa11.87□□□□□ -0.51
ACTB-209ENST00000473257 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
ACTB-209ENST00000473257 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
ACTB-209ENST00000473257 SPHK2Q9NRA0 654 aa11.87□□□□□ -0.51
ACTB-209ENST00000473257 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
ACTB-209ENST00000473257 PLK2Q9NYY3 685 aa11.87□□□□□ -0.51
ACTB-209ENST00000473257 EHD2Q9NZN4 543 aa11.87□□□□□ -0.51
ACTB-209ENST00000473257 DEC1Q9P2X7 70 aa11.87□□□□□ -0.51
ACTB-209ENST00000473257 KLK13Q9UKR3 277 aa11.87□□□□□ -0.51
ACTB-209ENST00000473257 CYP8B1Q9UNU6 501 aa11.87□□□□□ -0.51
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